H2AFB1

H2AFB1 (англ. H2A histone family member B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 115 амінокислот, а молекулярна маса — 12 697.

H2AFB1
Ідентифікатори
Символи	H2AB1, H2A.Bbd, H2A histone family member B1, H2A.B, H2A.B variant histone 1, H2AFB1, H2A.B.2
Зовнішні ІД	MGI: 3644980 HomoloGene: 129517 GeneCards: H2AB1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • protein heterodimerization activity Клітинна компонента • Нуклеосома • клітинне ядро • хромосома Біологічний процес • nucleosome assembly • mRNA processing • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	474382	624153
Ensembl	ENSG00000274183	ENSMUSG00000082482
UniProt	P0C5Y9	S4R1M3
RefSeq (мРНК)	NM_001017990	NM_001281530
RefSeq (білок)	NP_001017990	NP_001268459
Локус (UCSC)	Хр. X: 154.88 – 154.89 Mb	Хр. X: 115.59 – 115.59 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPRRRRRRGS		SGAGGRGRTC		SRTVRAELSF		SVSQVERSLR		EGHYAQRLSR
TAPVYLAAVI		EYLTAKVPEL		AGNEAQNSGE		RNITPLLLDM		VVHNDRLLST
LFNTTTISQV		APGED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Okuwaki M., Kato K., Shimahara H., Tate S., Nagata K. (2005). Assembly and disassembly of nucleosome core particles containing histone variants by human nucleosome assembly protein I. Mol. Cell. Biol. 25: 10639—10651. PMID 16287874 DOI:10.1128/MCB.25.23.10639-10651.2005
• Eirin-Lopez J.M., Ishibashi T., Ausio J. (2008). H2A.Bbd: a quickly evolving hypervariable mammalian histone that destabilizes nucleosomes in an acetylation-independent way. FASEB J. 22: 316—326. PMID 17726088 DOI:10.1096/fj.07-9255com
• Gonzalez-Romero R., Mendez J., Ausio J., Eirin-Lopez J.M. (2008). Quickly evolving histones, nucleosome stability and chromatin folding: all about histone H2A.Bbd. Gene. 413: 1—7. PMID 18329190 DOI:10.1016/j.gene.2008.02.003

Див. також

• Хромосома X