FUS

FUS (англ. FUS RNA binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 526 амінокислот, а молекулярна маса — 53 426.

FUS
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LA6, 2LCW, 4FDD, 4FQ3
Ідентифікатори
Символи	FUS, ALS6, ETM4, FUS1, HNRNPP2, POMP75, TLS, FUS RNA binding protein, altFUS
Зовнішні ІД	OMIM: 137070 GeneCards: FUS
Пов'язані генетичні захворювання
Angiomatoid fibrous histiocytoma, amyotrophic lateral sclerosis type 6, sporadic amyotrophic lateral sclerosis
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • зв'язування з іоном металу • retinoid X receptor binding • thyroid hormone receptor binding • myosin V binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • nucleic acid binding • ionotropic glutamate receptor binding • estrogen receptor binding • RNA binding • chromatin binding Клітинна компонента • цитоплазма • Полісома • перикаріон • dendritic spine • нуклеоплазма • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • dendritic spine head • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро Біологічний процес • cellular response to calcium ion • mRNA splicing, via spliceosome • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • Сплайсинг РНК • regulation of RNA splicing • protein homooligomerization • positive regulation of nucleic acid-templated transcription • positive regulation of double-strand break repair via homologous recombination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2521	н/д
Ensembl	ENSG00000089280	н/д
UniProt	P35637	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001010850 NM_001170634 NM_001170937 NM_004960	н/д
RefSeq (білок)	NP_001164105 NP_001164408 NP_004951	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 16: 31.18 – 31.19 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASNDYTQQA		TQSYGAYPTQ		PGQGYSQQSS		QPYGQQSYSG		YSQSTDTSGY
GQSSYSSYGQ		SQNTGYGTQS		TPQGYGSTGG		YGSSQSSQSS		YGQQSSYPGY
GQQPAPSSTS		GSYGSSSQSS		SYGQPQSGSY		SQQPSYGGQQ		QSYGQQQSYN
PPQGYGQQNQ		YNSSSGGGGG		GGGGGNYGQD		QSSMSSGGGS		GGGYGNQDQS
GGGGSGGYGQ		QDRGGRGRGG		SGGGGGGGGG		GYNRSSGGYE		PRGRGGGRGG
RGGMGGSDRG		GFNKFGGPRD		QGSRHDSEQD		NSDNNTIFVQ		GLGENVTIES
VADYFKQIGI		IKTNKKTGQP		MINLYTDRET		GKLKGEATVS		FDDPPSAKAA
IDWFDGKEFS		GNPIKVSFAT		RRADFNRGGG		NGRGGRGRGG		PMGRGGYGGG
GSGGGGRGGF		PSGGGGGGGQ		QRAGDWKCPN		PTCENMNFSW		RNECNQCKAP
KPDGPGGGPG		GSHMGGNYGD		DRRGGRGGYD		RGGYRGRGGD		RGGFRGGRGG
GDRGGFGPGK		MDSRGEHRQD		RRERPY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Crozat A., Aman P., Mandahl N., Ron D. (1993). Fusion of CHOP to a novel RNA-binding protein in human myxoid liposarcoma. Nature. 363: 640—644. PMID 8510758 DOI:10.1038/363640a0
• Rabbitts T.H., Forster A., Larson R., Nathan P. (1993). Fusion of the dominant negative transcription regulator CHOP with a novel gene FUS by translocation t(12;16) in malignant liposarcoma. Nat. Genet. 4: 175—180. PMID 7503811 DOI:10.1038/ng0693-175
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Waters B.L., Panagopoulos I., Allen E.F. (2000). Genetic characterization of angiomatoid fibrous histiocytoma identifies fusion of the FUS and ATF-1 genes induced by a chromosomal translocation involving bands 12q13 and 16p11. Cancer Genet. Cytogenet. 121: 109—116. PMID 11063792 DOI:10.1016/S0165-4608(00)00237-5
• Bertrand P., Akhmedov A.T., Delacote F., Durrbach A., Lopez B.S. (1999). Human POMp75 is identified as the pro-oncoprotein TLF/FUS: both POMp75 and POMp100 DNA homologous pairing activities are associated to cell proliferation. Oncogene. 18: 4515—4521. PMID 10442642 DOI:10.1038/sj.onc.1203048
• Zhang D., Paley A.J., Childs G. (1998). The transcriptional repressor ZFM1 interacts with and modulates the ability of EWS to activate transcription. J. Biol. Chem. 273: 18086—18091. PMID 9660765 DOI:10.1074/jbc.273.29.18086

Див. також

• Хромосома 16