FBL

FBL (англ. Fibrillarin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 321 амінокислот, а молекулярна маса — 33 784.

FBL
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2IPX
Ідентифікатори
Символи	FBL, FIB, FLRN, RNU3IP1, fibrillarin, Nop1
Зовнішні ІД	OMIM: 134795 MGI: 95486 HomoloGene: 1099 GeneCards: FBL
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • rRNA methyltransferase activity • ATPase binding • histone-glutamine methyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • TFIID-class transcription factor complex binding • RNA binding Клітинна компонента • small-subunit processome • Тільце Кахаля • мембрана • ядерце • dense fibrillar component • екзосома • клітинне ядро • box C/D RNP complex • granular component • хромосома • Нуклеоплазма • fibrillar center Біологічний процес • tRNA processing • snoRNA localization • rRNA methylation • histone glutamine methylation • Метилювання • box C/D RNA 3'-end processing • sno(s)RNA metabolic process • osteoblast differentiation • rRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2091	14113
Ensembl	ENSG00000105202 ENSG00000280548	ENSMUSG00000046865
UniProt	P22087	P35550
RefSeq (мРНК)	NM_001436	NM_007991
RefSeq (білок)	NP_001427	NP_032017
Локус (UCSC)	Хр. 19: 39.83 – 39.85 Mb	Хр. 7: 27.87 – 27.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKPGFSPRGG		GFGGRGGFGD		RGGRGGRGGF		GGGRGRGGGF		RGRGRGGGGG
GGGGGGGGRG		GGGFHSGGNR		GRGRGGKRGN		QSGKNVMVEP		HRHEGVFICR
GKEDALVTKN		LVPGESVYGE		KRVSISEGDD		KIEYRAWNPF		RSKLAAAILG
GVDQIHIKPG		AKVLYLGAAS		GTTVSHVSDI		VGPDGLVYAV		EFSHRSGRDL
INLAKKRTNI		IPVIEDARHP		HKYRMLIAMV		DVIFADVAQP		DQTRIVALNA
HTFLRNGGHF		VISIKANCID		STASAEAVFA		SEVKKMQQEN		MKPQEQLTLE
PYERDHAVVV		GVYRPPPKVK		N

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, рибонуклеопротеїнів, метилтрансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі як процесинг рРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК, s-аденозил-l-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

• Aris J.P., Blobel G. (1991). cDNA cloning and sequencing of human fibrillarin, a conserved nucleolar protein recognized by autoimmune antisera. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 931—935. PMID 1846968 DOI:10.1073/pnas.88.3.931
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nicol S.M., Causevic M., Prescott A.R., Fuller-Pace F.V. (2000). The nuclear DEAD box RNA helicase p68 interacts with the nucleolar protein fibrillarin and colocalizes specifically in nascent nucleoli during telophase. Exp. Cell Res. 257: 272—280. PMID 10837141 DOI:10.1006/excr.2000.4886
• McKeegan K.S., Debieux C.M., Boulon S., Bertrand E., Watkins N.J. (2007). A dynamic scaffold of pre-snoRNP factors facilitates human box C/D snoRNP assembly. Mol. Cell. Biol. 27: 6782—6793. PMID 17636026 DOI:10.1128/MCB.01097-07
• Freed E.F., Prieto J.L., McCann K.L., McStay B., Baserga S.J. (2012). NOL11, implicated in the pathogenesis of North American Indian childhood cirrhosis, is required for pre-rRNA transcription and processing. PLoS Genet. 8: E1002892—E1002892. PMID 22916032 DOI:10.1371/journal.pgen.1002892
• Baserga S.J., Yang X.D., Steitz J.A. (1991). An intact Box C sequence in the U3 snRNA is required for binding of fibrillarin, the protein common to the major family of nucleolar snRNPs. EMBO J. 10: 2645—2651. PMID 1714385

Див. також

• Хромосома 19