FASTKD5
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
FASTKD5 (англ. FAST kinase domains 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 764 амінокислот, а молекулярна маса — 86 574[5].
FASTKD5 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | FASTKD5, dJ1187M17.5, FAST kinase domains 5 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 614272 MGI: 2139469 HomoloGene: 36400 GeneCards: FASTKD5 | ||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
Viroporin 3a[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 20: 3.15 – 3.16 Mb | Хр. 2: 130.46 – 130.47 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAATLKSLKL | VRYRAFCSPS | AFGAVRSVSY | WNVSSTQHGG | QDPPEHISLC | ||||
HSAKKVKNIC | STFSSRRILT | TSSAHPGLEF | SKTSSSKAST | LQLGSPRATG | ||||
VDEEDVEVFD | SFENMRVFLQ | LRPEYRVHSY | NASETSQLLS | VSEGELILHK | ||||
VRVNQNNLQA | QVIVDYLCKL | SSLPAEQHPV | LLGSTSFALL | CQLSVKKIQL | ||||
FDTQDLINVL | KAFVILGIPH | SHSMLDVYET | KCCHQVWEMN | MDQLLLVADL | ||||
WRYLGRKVPR | FLNIFSSYLN | LHWKDLSLSQ | LVHLIYVIGE | NRQVSQDLMQ | ||||
KLESLILKYI | DLINLEEVGT | ICLGFFKSST | NLSEFVMRKI | GDLACANIQH | ||||
LSSRSLVNIV | KMFRFTHVDH | INFMKQIGEI | APQRIPSLGV | QGVMHLTLYC | ||||
SALRFLNEGV | MNAVAASLPP | RVAHCRSKDV | AKILWSFGTL | NYKPPNAEEF | ||||
YSSLISEIHR | KMPEFNQYPE | HLPTCLLGLA | FLEYFPVELI | DFALSPGFVR | ||||
LAQERTKFDL | LKELYTLDGT | VGIECPDYRG | NRLSTHLQQE | GSELLWYLAE | ||||
KDMNSKPEFL | ETVFLLETML | GGPQYVKHHM | ILPHTRSSDL | EVQLDVNLKP | ||||
LPFNREATPA | ENVAKLRLEH | VGVSLTDDLM | NKLLKGKARG | HFQGKTESEP | ||||
GQQPMELENK | AAVPLGGFLC | NVADKSGAME | MAGLCPAACM | QTPRMKLAVQ | ||||
FTNRNQYCYG | SRDLLGLHNM | KRRQLARLGY | RVVELSYWEW | LPLLKRTRLE | ||||
KLAFLHEKVF | TSAL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК, рРНК. Локалізований у мітохондрії, мітохондріальному нуклеоїді.
Література
ред.- Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Antonicka H., Shoubridge E.A. (2015). Mitochondrial RNA granules are centers for posttranscriptional RNA processing and ribosome biogenesis. Cell Rep.: —. PMID 25683715 DOI:10.1016/j.celrep.2015.01.030
Примітки
ред.- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з FAST kinase domains 5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25790 (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q7L8L6 (англ.) . Архів оригіналу за 3 грудня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |