FAAP100

FAAP100 (англ. Fanconi anemia core complex associated protein 100) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 17-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 881 амінокислот, а молекулярна маса — 93 433.

FAAP100
Ідентифікатори
Символи	FAAP100, C17orf70, Fanconi anemia core complex associated protein 100, FA core complex associated protein 100
Зовнішні ІД	OMIM: 611301 MGI: 1919135 HomoloGene: 69394 GeneCards: FAAP100
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • intermediate filament cytoskeleton • Fanconi anaemia nuclear complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • interstrand cross-link repair • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0100026 Репарація ДНК Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80233	71885
Ensembl	ENSG00000185504	ENSMUSG00000025384
UniProt	Q0VG06	A2ACJ2
RefSeq (мРНК)	NM_025161	NM_027980
RefSeq (білок)	NP_079437	NP_082256
Локус (UCSC)	Хр. 17: 81.54 – 81.55 Mb	Хр. 11: 120.26 – 120.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGAAPRVRY		LAGFCCPLGG		LAAGKPRVLC		HEAEVFLSTG		SELVYVYDQE
GGLLTAAFRF		PDQVWHLELL		APRRLLYALC		ARRGLYCLSL		DHPGRSRSTS
QDDRDSEDGD		QPSPVIPVDP		DACILPDAAL		CAFTLLDSVL		VTLVQGPARW
KMQLFEQPCP		GEDPRPGGQI		GEVELSSYTP		PAGVPGKPAA		PHFLPVLCSV
SPSGSRVPHD		LLGGSGGFTL		EDALFGLLFG		ADATLLQSPV		VLCGLPDGQL
CCVILKALVT		SRSAPGDPNA		LVKILHHLEE		PVIFIGALKT		EPQAAEAAEN
FLPDEDVHCD		CLVAFGHHGR		MLAIKASWDE		SGKLVPELRE		YCLPGPVLCA
ACGGGGRVYH		STPSDLCVVD		LSRGSTPLGP		EQPEEGPGGL		PPMLCPASLN
ICSVVSLSAS		PRTHEGGTKL		LALSAKGRLM		TCSLDLDSEM		PGPARMTTES
AGQKIKELLS		GIGNISERVS		FLKKAVDQRN		KALTSLNEAM		NVSCALLSSG
TGPRPISCTT		STTWSRLQTQ		DVLMATCVLE		NSSSFSLDQG		WTLCIQVLTS
SCALDLDSAC		SAITYTIPVD		QLGPGARREV		TLPLGPGENG		GLDLPVTVSC
TLFYSLREVV		GGALAPSDSE		DPFLDECPSD		VLPEQEGVCL		PLSRHTVDML
QCLRFPGLAP		PHTRAPSPLG		PTRDPVATFL		ETCREPGSQP		AGPASLRAEY
LPPSVASIKV		SAELLRAALK		DGHSGVPLCC		ATLQWLLAEN		AAVDVVRARA
LSSIQGVAPD		GANVHLIVRE		VAMTDLCPAG		PIQAVEIQVE		SSSLADICRA
HHAVVGRMQT		MVTEQATQGS		SAPDLRVQYL		RQIHANHETL		LREVQTLRDR
LCTEDEASSC		ATAQRLLQVY		RQLRHPSLIL		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 17