DENND1B

DENND1B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3TW8
Ідентифікатори
Символи	DENND1B, C1ORF18, C1orf218, FAM31B, DENN domain containing 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 613292 MGI: 2447812 HomoloGene: 11739 GeneCards: DENND1B
Пов'язані генетичні захворювання
	Хвороба Крона
Онтологія гена
Молекулярна функція	• guanyl-nucleotide exchange factor activity; • phosphatidylinositol phosphate binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • clathrin-coated vesicle; • гіалоплазма; • nuclear speck; • внутрішньоклітинна мембранна органела;
Біологічний процес	• protein transport; • T-helper 2 cell cytokine production; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • T cell receptor signaling pathway; • regulation of immune response; • endocytic recycling; • ендоцитоз;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	163486
	329260
	ENSG00000213047
	ENSMUSG00000056268
	Q6P3S1
	Q3U1T9
NM_001142795; NM_001195215; NM_001195216; NM_001300858; NM_019049;
	NM_144977
	NM_001166501; NM_181347; NM_183217
	NP_001182144; NP_001182145; NP_001287787; NP_659414
	NP_001159973; NP_851992
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DENND1B (англ. DENN domain containing 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 775 амінокислот, а молекулярна маса — 86 552^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDCRTKANPD	RTFDLVLKVK	CHASENEDPV	VLWKFPEDFG	DQEILQSVPK
FCFPFDVERV	SQNQVGQHFT	FVLTDIESKQ	RFGFCRLTSG	GTICLCILSY
LPWFEVYYKL	LNTLADYLAK	ELENDLNETL	RSLYNHPVPK	ANTPVNLSVN
QEIFIACEQV	LKDQPALVPH	SYFIAPDVTG	LPTIPESRNL	TEYFVAVDVN
NMLQLYASML	HERRIVIISS	KLSTLTACIH	GSAALLYPMY	WQHIYIPVLP
PHLLDYCCAP	MPYLIGIHSS	LIERVKNKSL	EDVVMLNVDT	NTLESPFSDL
NNLPSDVVSA	LKNKLKKQST	ATGDGVARAF	LRAQAALFGS	YRDALRYKPG
EPITFCEESF	VKHRSSVMKQ	FLETAINLQL	FKQFIDGRLA	KLNAGRGFSD
VFEEEITSGG	FCGGNPRSYQ	QWVHTVKKGG	ALFNTAMTKA	TPAVRTAYKF
AKNHAKLGLK	EVKSKLKHKE	NEEDYGTCSS	SVQYTPVYKL	HNEKGGNSEK
RKLAQARLKR	PLKSLDGALY	DDEDDDDIER	ASKLSSEDGE	EASAYLYESD
DSVETRVKTP	YSGEMDLLGE	ILDTLSTHSS	DQGKLAAAKS	LDFFRSMDDI
DYKPTNKSNA	PSENNLAFLC	GGSGDQAEWN	LGQDDSALHG	KHLPPSPRKR
VSSSGLTDSL	FILKEENSNK	HLGADNVSDP	TSGLDFQLTS	PEVSQTDKGK
TEKRETLSQI	SDDLLIPGLG	RHSSTFVPWE	KEGKEAKETS	EDIGLLHEVV
SLCHMTSDFQ	QSLNISDKNT	NGNQT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоплазматичних везикулах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Marat A.L., McPherson P.S. (2010). The connecdenn family, Rab35 guanine nucleotide exchange factors interfacing with the clathrin machinery. J. Biol. Chem. 285: 10627—10637. PMID 20154091 DOI:10.1074/jbc.M109.050930
Yoshimura S., Gerondopoulos A., Linford A., Rigden D.J., Barr F.A. (2010). Family-wide characterization of the DENN domain Rab GDP-GTP exchange factors. J. Cell Biol. 191: 367—381. PMID 20937701 DOI:10.1083/jcb.201008051