DACH1

DACH1 (англ. Dachshund family transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 760 амінокислот, а молекулярна маса — 78 676.

DACH1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1L8R
Ідентифікатори
Символи	DACH1, DACH, dachshund family transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603803 MGI: 1277991 HomoloGene: 7288 GeneCards: DACH1
Пов'язані генетичні захворювання
бічний аміотрофічний склероз, захворювання нирок
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • transcription regulator complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of transcription by competitive promoter binding • RNA polymerase II preinitiation complex assembly • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • respiratory gaseous exchange by respiratory system • transcription, DNA-templated • development of primary female sexual characteristics • negative regulation of cell migration • regulation of nuclear cell cycle DNA replication • negative regulation of cell proliferation involved in contact inhibition • проліферація • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of fibroblast proliferation • negative regulation of DNA biosynthetic process • suckling behavior • multicellular organism development • transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1602	13134
Ensembl	ENSG00000276644	ENSMUSG00000055639
UniProt	Q9UI36	Q9QYB2
RefSeq (мРНК)	NM_004392 NM_080759 NM_080760 NM_001366712	NM_001038610 NM_007826
RefSeq (білок)	NP_004383 NP_542937 NP_542938 NP_001353641	NP_001033699 NP_031852
Локус (UCSC)	Хр. 13: 71.44 – 71.87 Mb	Хр. 14: 98.02 – 98.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVPAALIPP		TQLVPPQPPI		STSASSSGTT		TSTSSATSSP		APSIGPPASS
GPTLFRPEPI		ASAAAAAATV		TSTGGGGGGG		GGGSGGGGGS		SGNGGGGGGG
GGGSNCNPNL		AAASNGSGGG		GGGISAGGGV		ASSTPINAST		GSSSSSSSSS
SSSSSSSSSS		SSSSSCGPLP		GKPVYSTPSP		VENTPQNNEC		KMVDLRGAKV
ASFTVEGCEL		ICLPQAFDLF		LKHLVGGLHT		VYTKLKRLEI		TPVVCNVEQV
RILRGLGAIQ		PGVNRCKLIS		RKDFETLYND		CTNASSRPGR		PPKRTQSVTS
PENSHIMPHS		VPGLMSPGII		PPTGLTAAAA		AAAAATNAAI		AEAMKVKKIK
LEAMSNYHAS		NNQHGADSEN		GDMNSSVGSS		DGSWDKETLP		SSPSQGPQAS
ITHPRMPGAR		SLPLSHPLNH		LQQSHLLPNG		LELPFMMMPH		PLIPVSLPPA
SVTMAMSQMN		HLSTIANMAA		AAQVQSPPSR		VETSVIKERV		PDSPSPAPSL
EEGRRPGSHP		SSHRSSSVSS		SPARTESSSD		RIPVHQNGLS		MNQMLMGLSP
NVLPGPKEGD		LAGHDMGHES		KRMHIEKDET		PLSTPTARDS		LDKLSLTGHG
QPLPPGFPSP		FLFPDGLSSI		ETLLTNIQGL		LKVAIDNARA		QEKQVQLEKT
ELKMDFLRER		ELRETLEKQL		AMEQKNRAIV		QKRLKKEKKA		KRKLQEALEF
ETKRREQAEQ		TLKQAASTDS		LRVLNDSLTP		EIEADRSGGR		TDAERTIQDG
RLYLKTTVMY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Hammond K.L., Hanson I.M., Brown A.G., Lettice L.A., Hill R.E. (1998). Mammalian and Drosophila dachshund genes are related to the Ski proto-oncogene and are expressed in eye and limb. Mech. Dev. 74: 121—131. PMID 9651501 DOI:10.1016/S0925-4773(98)00071-9
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 13