CUX1

CUX1 (англ. Homeobox protein cut-like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 505 амінокислот, а молекулярна маса — 164 187.

CUX1
Ідентифікатори
Символи	CUX1, CASP, CDP, CDP/Cut, CDP1, COY1, CUTL1, CUX, Clox, Cux/CDP, GOLIM6, Nbla10317, p100, p110, p200, p75, cut like homeobox 1, GDDI
Зовнішні ІД	OMIM: 116896 HomoloGene: 22551 GeneCards: CUX1
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • protein tyrosine kinase activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein-macromolecule adaptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • клітинне ядро • Нуклеоплазма • Golgi membrane • integral component of membrane • integral component of Golgi membrane • мембрана Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • multicellular organism development • retrograde transport, vesicle recycling within Golgi • positive regulation of dendrite morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • peptidyl-tyrosine phosphorylation • Golgi vesicle transport • intra-Golgi vesicle-mediated transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1523	116639
Ensembl	ENSG00000257923	ENSRNOG00000001424
UniProt	P39880 Q13948	P53565
RefSeq (мРНК)	NM_001202543 NM_001202544 NM_001202545 NM_001202546 NM_001913 NM_181500 NM_181552	NM_053860
RefSeq (білок)	NP_001189472 NP_001189473 NP_001189474 NP_001189475 NP_001904 NP_852477 NP_853530 NP_001189473.1 NP_001189474.1 NP_001189475.1 NP_001904.2 NP_852477.1	NP_446312
Локус (UCSC)	Хр. 7: 101.82 – 102.28 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLCVAGARLK		RELDATATVL		ANRQDESEQS		RKRLIEQSRE		FKKNTPEDLR
KQVAPLLKSF		QGEIDALSKR		SKEAEAAFLN		VYKRLIDVPD		PVPALDLGQQ
LQLKVQRLHD		IETENQKLRE		TLEEYNKEFA		EVKNQEVTIK		ALKEKIREYE
QTLKNQAETI		ALEKEQKLQN		DFAEKERKLQ		ETQMSTTSKL		EEAEHKVQSL
QTALEKTRTE		LFDLKTKYDE		ETTAKADEIE		MIMTDLERAN		QRAEVAQREA
ETLREQLSSA		NHSLQLASQI		QKAPDVEQAI		EVLTRSSLEV		ELAAKEREIA
QLVEDVQRLQ		ASLTKLRENS		ASQISQLEQQ		LSAKNSTLKQ		LEEKLKGQAD
YEEVKKELNI		LKSMEFAPSE		GAGTQDAAKP		LEVLLLEKNR		SLQSENAALR
ISNSDLSGSA		RRKGKDQPES		RRPGSLPAPP		PSQLPRNPGE		QASNTNGTHQ
FSPAGLSQDF		FSSSLASPSL		PLASTGKFAL		NSLLQRQLMQ		SFYSKAMQEA
GSTSMIFSTG		PYSTNSISSQ		SPLQQSPDVN		GMAPSPSQSE		SAGSVSEGEE
MDTAEIARQV		KEQLIKHNIG		QRIFGHYVLG		LSQGSVSEIL		ARPKPWNKLT
VRGKEPFHKM		KQFLSDEQNI		LALRSIQGRQ		RENPGQSLNR		LFQEVPKRRN
GSEGNITTRI		RASETGSDEA		IKSILEQAKR		ELQVQKTAEP		AQPSSASGSG
NSDDAIRSIL		QQARREMEAQ		QAALDPALKQ		APLSQSDITI		LTPKLLSTSP
MPTVSSYPPL		AISLKKPSAA		PEAGASALPN		PPALKKEAQD		APGLDPQGAA
DCAQGVLRQV		KNEVGRSGAW		KDHWWSAVQP		ERRNAASSEE		AKAEETGGGK
EKGSGGSGGG		SQPRAERSQL		QGPSSSEYWK		EWPSAESPYS		QSSELSLTGA
SRSETPQNSP		LPSSPIVPMS		KPTKPSVPPL		TPEQYEVYMY		QEVDTIELTR
QVKEKLAKNG		ICQRIFGEKV		LGLSQGSVSD		MLSRPKPWSK		LTQKGREPFI
RMQLWLNGEL		GQGVLPVQGQ		QQGPVLHSVT		SLQDPLQQGC		VSSESTPKTS
ASCSPAPESP		MSSSESVKSL		TELVQQPCPP		IEASKDSKPP		EPSDPPASDS
QPTTPLPLSG		HSALSIQELV		AMSPELDTYG		ITKRVKEVLT		DNNLGQRLFG
ETILGLTQGS		VSDLLARPKP		WHKLSLKGRE		PFVRMQLWLN		DPNNVEKLMD
MKRMEKKAYM		KRRHSSVSDS		QPCEPPSVGT		EYSQGASPQP		QHQLKKPRVV
LAPEEKEALK		RAYQQKPYPS		PKTIEDLATQ		LNLKTSTVIN		WFHNYRSRIR
RELFIEEIQA		GSQGQAGASD		SPSARSGRAA		PSSEGDSCDG		VEATEGPGSA
DTEEPKSQGE		AEREEVPRPA		EQTEPPPSGT		PGPDDARDDD		HEGGPVEGPG
PLPSPASATA		TAAPAAPEDA		ATSAAAAPGE		GPAAPSSAPP		PSNSSSSSAP
RRPSSLQSLF		GLPEAAGARD		SRDNPLRKKK		AANLNSIIHR		LEKAASREEP
IEWEF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Neufeld E.J., Skalnik D.G., Lievens P.M.-J., Orkin S.H. (1992). Human CCAAT displacement protein is homologous to the Drosophila homeoprotein, cut. Nat. Genet. 1: 50—55. PMID 1301999 DOI:10.1038/ng0492-50
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 7