COL4A6
білок людини
COL4A6 (англ. Collagen type IV alpha 6 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 691 амінокислот, а молекулярна маса — 163 807[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MLINKLWLLL | VTLCLTEELA | AAGEKSYGKP | CGGQDCSGSC | QCFPEKGARG | ||||
RPGPIGIQGP | TGPQGFTGST | GLSGLKGERG | FPGLLGPYGP | KGDKGPMGVP | ||||
GFLGINGIPG | HPGQPGPRGP | PGLDGCNGTQ | GAVGFPGPDG | YPGLLGPPGL | ||||
PGQKGSKGDP | VLAPGSFKGM | KGDPGLPGLD | GITGPQGAPG | FPGAVGPAGP | ||||
PGLQGPPGPP | GPLGPDGNMG | LGFQGEKGVK | GDVGLPGPAG | PPPSTGELEF | ||||
MGFPKGKKGS | KGEPGPKGFP | GISGPPGFPG | LGTTGEKGEK | GEKGIPGLPG | ||||
PRGPMGSEGV | QGPPGQQGKK | GTLGFPGLNG | FQGIEGQKGD | IGLPGPDVFI | ||||
DIDGAVISGN | PGDPGVPGLP | GLKGDEGIQG | LRGPSGVPGL | PALSGVPGAL | ||||
GPQGFPGLKG | DQGNPGRTTI | GAAGLPGRDG | LPGPPGPPGP | PSPEFETETL | ||||
HNKESGFPGL | RGEQGPKGNL | GLKGIKGDSG | FCACDGGVPN | TGPPGEPGPP | ||||
GPWGLIGLPG | LKGARGDRGS | GGAQGPAGAP | GLVGPLGPSG | PKGKKGEPIL | ||||
STIQGMPGDR | GDSGSQGFRG | VIGEPGKDGV | PGLPGLPGLP | GDGGQGFPGE | ||||
KGLPGLPGEK | GHPGPPGLPG | NGLPGLPGPR | GLPGDKGKDG | LPGQQGLPGS | ||||
KGITLPCIIP | GSYGPSGFPG | TPGFPGPKGS | RGLPGTPGQP | GSSGSKGEPG | ||||
SPGLVHLPEL | PGFPGPRGEK | GLPGFPGLPG | KDGLPGMIGS | PGLPGSKGAT | ||||
GDIFGAENGA | PGEQGLQGLT | GHKGFLGDSG | LPGLKGVHGK | PGLLGPKGER | ||||
GSPGTPGQVG | QPGTPGSSGP | YGIKGKSGLP | GAPGFPGISG | HPGKKGTRGK | ||||
KGPPGSIVKK | GLPGLKGLPG | NPGLVGLKGS | PGSPGVAGLP | ALSGPKGEKG | ||||
SVGFVGFPGI | PGLPGIPGTR | GLKGIPGSTG | KMGPSGRAGT | PGEKGDRGNP | ||||
GPVGIPSPRR | PMSNLWLKGD | KGSQGSAGSN | GFPGPRGDKG | EAGRPGPPGL | ||||
PGAPGLPGII | KGVSGKPGPP | GFMGIRGLPG | LKGSSGITGF | PGMPGESGSQ | ||||
GIRGSPGLPG | ASGLPGLKGD | NGQTVEISGS | PGPKGQPGES | GFKGTKGRDG | ||||
LIGNIGFPGN | KGEDGKVGVS | GDVGLPGAPG | FPGVAGMRGE | PGLPGSSGHQ | ||||
GAIGPLGSPG | LIGPKGFPGF | PGLHGLNGLP | GTKGTHGTPG | PSITGVPGPA | ||||
GLPGPKGEKG | YPGIGIGAPG | KPGLRGQKGD | RGFPGLQGPA | GLPGAPGISL | ||||
PSLIAGQPGD | PGRPGLDGER | GRPGPAGPPG | PPGPSSNQGD | TGDPGFPGIP | ||||
GPKGPKGDQG | IPGFSGLPGE | LGLKGMRGEP | GFMGTPGKVG | PPGDPGFPGM | ||||
KGKAGPRGSS | GLQGDPGQTP | TAEAVQVPPG | PLGLPGIDGI | PGLTGDPGAQ | ||||
GPVGLQGSKG | LPGIPGKDGP | SGLPGPPGAL | GDPGLPGLQG | PPGFEGAPGQ | ||||
QGPFGMPGMP | GQSMRVGYTL | VKHSQSEQVP | PCPIGMSQLW | VGYSLLFVEG | ||||
QEKAHNQDLG | FAGSCLPRFS | TMPFIYCNIN | EVCHYARRND | KSYWLSTTAP | ||||
IPMMPVSQTQ | IPQYISRCSV | CEAPSQAIAV | HSQDITIPQC | PLGWRSLWIG | ||||
YSFLMHTAAG | AEGGGQSLVS | PGSCLEDFRA | TPFIECSGAR | GTCHYFANKY | ||||
SFWLTTVEER | QQFGELPVSE | TLKAGQLHTR | VSRCQVCMKS | L |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
ред.- Zhang X., Zhou J., Reeders S.T., Tryggvason K. (1996). Structure of the human type IV collagen COL4A6 gene, which is mutated in Alport syndrome-associated leiomyomatosis. Genomics. 33: 473—479. PMID 8661006 DOI:10.1006/geno.1996.0222
- Oohashi T., Sugimoto M., Mattei M.-G., Ninomiya Y. (1994). Identification of a new collagen IV chain, alpha 6(IV), by cDNA isolation and assignment of the gene to chromosome Xq22, which is the same locus for COL4A5. J. Biol. Chem. 269: 7520—7526. PMID 8125972
- Zhou J., Ding M., Zhao Z., Reeders S.T. (1994). Complete primary structure of the sixth chain of human basement membrane collagen, alpha 6(IV). Isolation of the cDNAs for alpha 6(IV) and comparison with five other type IV collagen chains. J. Biol. Chem. 269: 13193—13199. PMID 8175748
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2208 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q14031 (англ.) . Архів оригіналу за 8 квітня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |