CHD4
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
CHD4 (англ. Chromodomain helicase DNA binding protein 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 912 амінокислот, а молекулярна маса — 218 005[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MASGLGSPSP | CSAGSEEEDM | DALLNNSLPP | PHPENEEDPE | EDLSETETPK | ||||
LKKKKKPKKP | RDPKIPKSKR | QKKERMLLCR | QLGDSSGEGP | EFVEEEEEVA | ||||
LRSDSEGSDY | TPGKKKKKKL | GPKKEKKSKS | KRKEEEEEED | DDDDSKEPKS | ||||
SAQLLEDWGM | EDIDHVFSEE | DYRTLTNYKA | FSQFVRPLIA | AKNPKIAVSK | ||||
MMMVLGAKWR | EFSTNNPFKG | SSGASVAAAA | AAAVAVVESM | VTATEVAPPP | ||||
PPVEVPIRKA | KTKEGKGPNA | RRKPKGSPRV | PDAKKPKPKK | VAPLKIKLGG | ||||
FGSKRKRSSS | EDDDLDVESD | FDDASINSYS | VSDGSTSRSS | RSRKKLRTTK | ||||
KKKKGEEEVT | AVDGYETDHQ | DYCEVCQQGG | EIILCDTCPR | AYHMVCLDPD | ||||
MEKAPEGKWS | CPHCEKEGIQ | WEAKEDNSEG | EEILEEVGGD | LEEEDDHHME | ||||
FCRVCKDGGE | LLCCDTCPSS | YHIHCLNPPL | PEIPNGEWLC | PRCTCPALKG | ||||
KVQKILIWKW | GQPPSPTPVP | RPPDADPNTP | SPKPLEGRPE | RQFFVKWQGM | ||||
SYWHCSWVSE | LQLELHCQVM | FRNYQRKNDM | DEPPSGDFGG | DEEKSRKRKN | ||||
KDPKFAEMEE | RFYRYGIKPE | WMMIHRILNH | SVDKKGHVHY | LIKWRDLPYD | ||||
QASWESEDVE | IQDYDLFKQS | YWNHRELMRG | EEGRPGKKLK | KVKLRKLERP | ||||
PETPTVDPTV | KYERQPEYLD | ATGGTLHPYQ | MEGLNWLRFS | WAQGTDTILA | ||||
DEMGLGKTVQ | TAVFLYSLYK | EGHSKGPFLV | SAPLSTIINW | EREFEMWAPD | ||||
MYVVTYVGDK | DSRAIIRENE | FSFEDNAIRG | GKKASRMKKE | ASVKFHVLLT | ||||
SYELITIDMA | ILGSIDWACL | IVDEAHRLKN | NQSKFFRVLN | GYSLQHKLLL | ||||
TGTPLQNNLE | ELFHLLNFLT | PERFHNLEGF | LEEFADIAKE | DQIKKLHDML | ||||
GPHMLRRLKA | DVFKNMPSKT | ELIVRVELSP | MQKKYYKYIL | TRNFEALNAR | ||||
GGGNQVSLLN | VVMDLKKCCN | HPYLFPVAAM | EAPKMPNGMY | DGSALIRASG | ||||
KLLLLQKMLK | NLKEGGHRVL | IFSQMTKMLD | LLEDFLEHEG | YKYERIDGGI | ||||
TGNMRQEAID | RFNAPGAQQF | CFLLSTRAGG | LGINLATADT | VIIYDSDWNP | ||||
HNDIQAFSRA | HRIGQNKKVM | IYRFVTRASV | EERITQVAKK | KMMLTHLVVR | ||||
PGLGSKTGSM | SKQELDDILK | FGTEELFKDE | ATDGGGDNKE | GEDSSVIHYD | ||||
DKAIERLLDR | NQDETEDTEL | QGMNEYLSSF | KVAQYVVREE | EMGEEEEVER | ||||
EIIKQEESVD | PDYWEKLLRH | HYEQQQEDLA | RNLGKGKRIR | KQVNYNDGSQ | ||||
EDRDWQDDQS | DNQSDYSVAS | EEGDEDFDER | SEAPRRPSRK | GLRNDKDKPL | ||||
PPLLARVGGN | IEVLGFNARQ | RKAFLNAIMR | YGMPPQDAFT | TQWLVRDLRG | ||||
KSEKEFKAYV | SLFMRHLCEP | GADGAETFAD | GVPREGLSRQ | HVLTRIGVMS | ||||
LIRKKVQEFE | HVNGRWSMPE | LAEVEENKKM | SQPGSPSPKT | PTPSTPGDTQ | ||||
PNTPAPVPPA | EDGIKIEENS | LKEEESIEGE | KEVKSTAPET | AIECTQAPAP | ||||
ASEDEKVVVE | PPEGEEKVEK | AEVKERTEEP | METEPKGAAD | VEKVEEKSAI | ||||
DLTPIVVEDK | EEKKEEEEKK | EVMLQNGETP | KDLNDEKQKK | NIKQRFMFNI | ||||
ADGGFTELHS | LWQNEERAAT | VTKKTYEIWH | RRHDYWLLAG | IINHGYARWQ | ||||
DIQNDPRYAI | LNEPFKGEMN | RGNFLEIKNK | FLARRFKLLE | QALVIEEQLR | ||||
RAAYLNMSED | PSHPSMALNT | RFAEVECLAE | SHQHLSKESM | AGNKPANAVL | ||||
HKVLKQLEEL | LSDMKADVTR | LPATIARIPP | VAVRLQMSER | NILSRLANRA | ||||
PEPTPQQVAQ |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.
Література
ред.- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., Kingston R.E., Schreiber S.L. (1998). Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex. Nature. 395: 917—921. PMID 9804427 DOI:10.1038/27699
- Schmidt D.R., Schreiber S.L. (1999). Molecular association between ATR and two components of the nucleosome remodeling and deacetylating complex, HDAC2 and CHD4. Biochemistry. 38: 14711—14717. PMID 10545197 DOI:10.1021/bi991614n
- Sillibourne J.E., Delaval B., Redick S., Sinha M., Doxsey S.J. (2007). Chromatin remodeling proteins interact with pericentrin to regulate centrosome integrity. Mol. Biol. Cell. 18: 3667—3680. PMID 17626165 DOI:10.1091/mbc.E06-07-0604
- Yuce O., West S.C. (2013). Senataxin, defective in the neurodegenerative disorder ataxia with oculomotor apraxia 2, lies at the interface of transcription and the DNA damage response. Mol. Cell. Biol. 33: 406—417. PMID 23149945 DOI:10.1128/MCB.01195-12
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Примітки
ред.- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CHD4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1919 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q14839 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |