CHD3

CHD3 (англ. Chromodomain helicase DNA binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 000 амінокислот, а молекулярна маса — 226 592.

CHD3
Ідентифікатори
Символи	CHD3, Mi-2a, Mi2-ALPHA, ZFH, chromodomain helicase DNA binding protein 3, SNIBCPS
Зовнішні ІД	OMIM: 602120 MGI: 1344395 HomoloGene: 62693 GeneCards: CHD3
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • nucleotide binding • GO:0004003 DNA helicase activity • GO:0008026 helicase activity • hydrolase activity • ATP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • histone deacetylase activity • RNA binding • zinc ion binding • ATPase activity • GO:0033676 double-stranded DNA helicase activity Клітинна компонента • ядерце • нуклеоплазма • цитоплазма • клітинне ядро • NuRD complex • центросома • цитоскелет • центр організації мікротрубочок Біологічний процес • transcription, DNA-templated • GO:0043146 spindle organization • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • histone deacetylation • DNA duplex unwinding • regulation of signal transduction by p53 class mediator • centrosome cycle Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1107	216848
Ensembl	ENSG00000170004	ENSMUSG00000018474
UniProt	Q12873	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001005271 NM_001005273 NM_005852 NM_001272	NM_146019
RefSeq (білок)	NP_001005271 NP_001005273 NP_005843	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 17: 7.88 – 7.91 Mb	Хр. 11: 69.23 – 69.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKAADTVILW		ARSKNDQLRI		SFPPGLCWGD		RMPDKDDIRL		LPSALGVKKR
KRGPKKQKEN		KPGKPRKRKK		RDSEEEFGSE		RDEYREKSES		GGSEYGTGPG
RKRRRKHREK		KEKKTKRRKK		GEGDGGQKQV		EQKSSATLLL		TWGLEDVEHV
FSEEDYHTLT		NYKAFSQFMR		PLIAKKNPKI		PMSKMMTILG		AKWREFSANN
PFKGSAAAVA		AAAAAAAAAV		AEQVSAAVSS		ATPIAPSGPP		ALPPPPAADI
QPPPIRRAKT		KEGKGPGHKR		RSKSPRVPDG		RKKLRGKKMA		PLKIKLGLLG
GKRKKGGSYV		FQSDEGPEPE		AEESDLDSGS		VHSASGRPDG		PVRTKKLKRG
RPGRKKKKVL		GCPAVAGEEE		VDGYETDHQD		YCEVCQQGGE		IILCDTCPRA
YHLVCLDPEL		DRAPEGKWSC		PHCEKEGVQW		EAKEEEEEYE		EEGEEEGEKE
EEDDHMEYCR		VCKDGGELLC		CDACISSYHI		HCLNPPLPDI		PNGEWLCPRC
TCPVLKGRVQ		KILHWRWGEP		PVAVPAPQQA		DGNPDVPPPR		PLQGRSEREF
FVKWVGLSYW		HCSWAKELQL		EIFHLVMYRN		YQRKNDMDEP		PPLDYGSGED
DGKSDKRKVK		DPHYAEMEEK		YYRFGIKPEW		MTVHRIINHS		VDKKGNYHYL
VKWRDLPYDQ		STWEEDEMNI		PEYEEHKQSY		WRHRELIMGE		DPAQPRKYKK
KKKELQGDGP		PSSPTNDPTV		KYETQPRFIT		ATGGTLHMYQ		LEGLNWLRFS
WAQGTDTILA		DEMGLGKTIQ		TIVFLYSLYK		EGHTKGPFLV		SAPLSTIINW
EREFQMWAPK		FYVVTYTGDK		DSRAIIRENE		FSFEDNAIKG		GKKAFKMKRE
AQVKFHVLLT		SYELITIDQA		ALGSIRWACL		VVDEAHRLKN		NQSKFFRVLN
GYKIDHKLLL		TGTPLQNNLE		ELFHLLNFLT		PERFNNLEGF		LEEFADISKE
DQIKKLHDLL		GPHMLRRLKA		DVFKNMPAKT		ELIVRVELSP		MQKKYYKYIL
TRNFEALNSR		GGGNQVSLLN		IMMDLKKCCN		HPYLFPVAAM		ESPKLPSGAY
EGGALIKSSG		KLMLLQKMLR		KLKEQGHRVL		IFSQMTKMLD		LLEDFLDYEG
YKYERIDGGI		TGALRQEAID		RFNAPGAQQF		CFLLSTRAGG		LGINLATADT
VIIFDSDWNP		HNDIQAFSRA		HRIGQANKVM		IYRFVTRASV		EERITQVAKR
KMMLTHLVVR		PGLGSKAGSM		SKQELDDILK		FGTEELFKDE		NEGENKEEDS
SVIHYDNEAI		ARLLDRNQDA		TEDTDVQNMN		EYLSSFKVAQ		YVVREEDKIE
EIEREIIKQE		ENVDPDYWEK		LLRHHYEQQQ		EDLARNLGKG		KRVRKQVNYN
DAAQEDQDNQ		SEYSVGSEEE		DEDFDERPEG		RRQSKRQLRN		EKDKPLPPLL
ARVGGNIEVL		GFNTRQRKAF		LNAVMRWGMP		PQDAFTTQWL		VRDLRGKTEK
EFKAYVSLFM		RHLCEPGADG		SETFADGVPR		EGLSRQQVLT		RIGVMSLVKK
KVQEFEHING		RWSMPELMPD		PSADSKRSSR		ASSPTKTSPT		TPEASATNSP
CTSKPATPAP		SEKGEGIRTP		LEKEEAENQE		EKPEKNSRIG		EKMETEADAP
SPAPSLGERL		EPRKIPLEDE		VPGVPGEMEP		EPGYRGDREK		SATESTPGER
GEEKPLDGQE		HRERPEGETG		DLGKREDVKG		DRELRPGPRD		EPRSNGRREE
KTEKPRFMFN		IADGGFTELH		TLWQNEERAA		ISSGKLNEIW		HRRHDYWLLA
GIVLHGYARW		QDIQNDAQFA		IINEPFKTEA		NKGNFLEMKN		KFLARRFKLL
EQALVIEEQL		RRAAYLNLSQ		EPAHPAMALH		ARFAEAECLA		ESHQHLSKES
LAGNKPANAV		LHKVLNQLEE		LLSDMKADVT		RLPATLSRIP		PIAARLQMSE
RSILSRLASK		GTEPHPTPAY		PPGPYATPPG		YGAAFSAAPV		GALAAAGANY
SQMPAGSFIT		AATNGPPVLV		KKEKEMVGAL		VSDGLDRKEP		RAGEVICIDD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

• Aubry F., Mattei M.-G., Galibert F. (1998). Identification of a human 17p-located cDNA encoding a protein of the Snf2-like helicase family. Eur. J. Biochem. 254: 558—564. PMID 9688266 DOI:10.1046/j.1432-1327.1998.2540558.x
• Woodage T., Basrai M.A., Baxevanis A.D., Hieter P., Collins F.S. (1997). Characterization of the CHD family of proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 11472—11477. PMID 9326634 DOI:10.1073/pnas.94.21.11472
• Ge Q., Nilasena D.S., O'Brien C.A., Frank M.B., Targoff I.N. (1995). Molecular analysis of a major antigenic region of the 240 kD protein of Mi-2 autoantigen. J. Clin. Invest. 96: 1730—1737. PMID 7560064 DOI:10.1172/JCI118218
• Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., Kingston R.E., Schreiber S.L. (1998). Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex. Nature. 395: 917—921. PMID 9804427 DOI:10.1038/27699
• Schultz D.C., Friedman J.R., Rauscher F.J. III (2001). Targeting histone deacetylase complexes via KRAB-zinc finger proteins: the PHD and bromodomains of KAP-1 form a cooperative unit that recruits a novel isoform of the Mi-2alpha subunit of NuRD. Genes Dev. 15: 428—443. PMID 11230151 DOI:10.1101/gad.869501
• Lemos T.A., Passos D.O., Nery F.C., Kobarg J. (2003). Characterization of a new family of proteins that interact with the C-terminal region of the chromatin-remodeling factor CHD-3. FEBS Lett. 533: 14—20. PMID 12505151 DOI:10.1016/S0014-5793(02)03737-7

Див. також

• Хромосома 17