CDYL

CDYL
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2DNT, 2GTR
Ідентифікатори
Символи	CDYL, CDYL1, chromodomain protein, Y-like, chromodomain Y like
Зовнішні ІД	OMIM: 603778 MGI: 1339956 HomoloGene: 3548 GeneCards: CDYL
Пов'язані генетичні захворювання
	хронічне обструктивне захворювання легень
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • methylated histone binding; • каталітична активність; • protein-macromolecule adaptor activity; • lyase activity; • crotonyl-CoA hydratase activity; • chromatin binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • nuclear speck; • хромосома;
Біологічний процес	• обмін речовин; • transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of nucleic acid-templated transcription; • Сперматогенез; • диференціація клітин; • spermatid development; • random inactivation of X chromosome; • negative regulation of peptidyl-lysine crotonylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	9425
	12593
	ENSG00000153046
	ENSMUSG00000059288
	Q9Y232
	Q9WTK2
NM_001143970; NM_001143971; NM_004824; NM_170752; NM_001368125;
	NM_001368126; NM_001368127
	NM_001123386; NM_009881; NM_001378941; NM_001378942
NP_001137442; NP_001137443; NP_004815; NP_001355054; NP_001355055;
	NP_001355056
	NP_001116858; NP_034011; NP_001365870; NP_001365871
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CDYL (англ. Chromodomain Y like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 598 амінокислот, а молекулярна маса — 66 482^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTFQASHRSA	WGKSRKKNWQ	YEGPTQKLFL	KRNNVSAPDG	PSDPSISVSS
EQSGAQQPPA	LQVERIVDKR	KNKKGKTEYL	VRWKGYDSED	DTWEPEQHLV
NCEEYIHDFN	RRHTEKQKES	TLTRTNRTSP	NNARKQISRS	TNSNFSKTSP
KALVIGKDHE	SKNSQLFAAS	QKFRKNTAPS	LSSRKNMDLA	KSGIKILVPK
SPVKSRTAVD	GFQSESPEKL	DPVEQGQEDT	VAPEVAAEKP	VGALLGPGAE
RARMGSRPRI	HPLVPQVPGP	VTAAMATGLA	VNGKGTSPFM	DALTANGTTN
IQTSVTGVTA	SKRKFIDDRR	DQPFDKRLRF	SVRQTESAYR	YRDIVVRKQD
GFTHILLSTK	SSENNSLNPE	VMREVQSALS	TAAADDSKLV	LLSAVGSVFC
CGLDFIYFIR	RLTDDRKRES	TKMAEAIRNF	VNTFIQFKKP	IIVAVNGPAI
GLGASILPLC	DVVWANEKAW	FQTPYTTFGQ	SPDGCSTVMF	PKIMGGASAN
EMLLSGRKLT	AQEACGKGLV	SQVFWPGTFT	QEVMVRIKEL	ASCNPVVLEE
SKALVRCNMK	MELEQANERE	CEVLKKIWGS	AQGMDSMLKY	LQRKIDEF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, ацилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг, метилювання. Локалізований у ядрі.

Література

Lahn B.T., Page D.C. (1999). Retroposition of autosomal mRNA yielded testis-specific gene family on human Y chromosome. Nat. Genet. 21: 429—433. PMID 10192397 DOI:10.1038/7771
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fischle W., Franz H., Jacobs S.A., Allis C.D., Khorasanizadeh S. (2008). Specificity of the chromodomain Y chromosome family of chromodomains for lysine-methylated ARK(S/T) motifs. J. Biol. Chem. 283: 19626—19635. PMID 18450745 DOI:10.1074/jbc.M802655200
Franz H., Mosch K., Soeroes S., Urlaub H., Fischle W. (2009). Multimerization and H3K9me3 binding are required for CDYL1b heterochromatin association. J. Biol. Chem. 284: 35049—35059. PMID 19808672 DOI:10.1074/jbc.M109.052332
Wu H., Min J., Antoshenko T., Plotnikov A.N. (2009). Crystal structures of human CDY proteins reveal a crotonase-like fold. Proteins. 76: 1054—1061. PMID 19507244 DOI:10.1002/prot.22472
Franz H., Mosch K., Soeroes S., Urlaub H., Fischle W. (2010). J. Biol. Chem. 285: 11754—11754. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)