CDY2B

CDY2B (англ. Chromodomain Y-linked 2A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі Y-хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 541 амінокислот, а молекулярна маса — 60 524.

CDY2B
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2FW2
Ідентифікатори
Символи	CDY2B, CDY, chromodomain protein, Y-linked, 2B, chromodomain Y-linked 2B
Зовнішні ІД	HomoloGene: 36165 GeneCards: CDY2B
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • acyltransferase activity • каталітична активність • histone acetyltransferase activity • GO:0001106 transcription corepressor activity Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • обмін речовин • histone acetylation • Сперматогенез • negative regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	203611	н/д
Ensembl	ENSG00000129873	н/д
UniProt	Q9Y6F7	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001001722	н/д
RefSeq (білок)	NP_004816	н/д
Локус (UCSC)	Хр. Y: 17.88 – 17.88 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASQEFEVEA		IVDKRQDKNG		NTQYLVRWKG		YDKQDDTWEP		EQHLMNCEKC
VHDFNRRQTE		KQKKLTWTTT		SRIFSNNARR		RTSRSTKANY		SKNSPKTPVT
DKHHRSKNCK		LFAASKNVRR		KAASTLSDTK		NMEIINSTIE		TLAPDSPFDH
KKTVSGFQKL		EKLDPIAADQ		QDTVVFKVTE		GKLLRDPLSH		PGAEQTGIQN
KTQMHPLMSQ		MSGSVTASMA		TGSATRKGIV		VLIDPLAANG		TTDMHTSVPR
VKGGQRNITD		DSRGQPFIKK		MHFTIRLTES		AITYRDIVVK		KEDGFTQIVL
STRSTEKNAL		NTEVIKEMVN		ALNSAAADDS		KLVLFSAAGS		VFCCGLDFGY
FVRHLRNDRN		TASLEMVDTI		KNFVNTFIQF		KKPIVVSVNG		PAIGLGASIL
PLCDLVWANE		KAWFQTPYTT		FGQSPDGCSS		ITFPKMMGKA		SANEMLIAGR
KLTAREACAK		GLVSQVFLTG		TFTQEVMIQI		KELASYNAIV		LEECKALVRC
NIKLELEQAN		ERECEVLRKI		WSSAQGIESM		LKYVENKIDE		F

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ацилтрансфераз. Локалізований у ядрі.

Література

• Lahn B.T., Page D.C. (1999). Retroposition of autosomal mRNA yielded testis-specific gene family on human Y chromosome. Nat. Genet. 21: 429—433. PMID 10192397 DOI:10.1038/7771
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wu H., Min J., Antoshenko T., Plotnikov A.N. (2009). Crystal structures of human CDY proteins reveal a crotonase-like fold. Proteins. 76: 1054—1061. PMID 19507244 DOI:10.1002/prot.22472

Див. також

• Хромосома Y