CARM1

CARM1 (англ. Coactivator associated arginine methyltransferase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 608 амінокислот, а молекулярна маса — 65 854.

CARM1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2Y1W, 2Y1X, 4IKP, 5DX1, 5DX8, 5DXJ, 5DX0, 5DWQ, 5DXA
Ідентифікатори
Символи	CARM1, PRMT4, coactivator associated arginine methyltransferase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603934 MGI: 1913208 HomoloGene: 10990 GeneCards: CARM1
шифр КФ	2.1.1.321
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • histone methyltransferase activity • transferase activity • beta-catenin binding • protein homodimerization activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear receptor coactivator activity • lysine-acetylated histone binding • protein methyltransferase activity • histone methyltransferase activity (H3-R17 specific) • histone-arginine N-methyltransferase activity • protein-arginine N-methyltransferase activity • protein-arginine omega-N asymmetric methyltransferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex • клітинне ядро • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • regulation of growth plate cartilage chondrocyte proliferation • regulation of mRNA binding • histone H3-R17 methylation • peptidyl-arginine N-methylation • GO:0010260 старіння людини • regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway • intracellular steroid hormone receptor signaling pathway • negative regulation of protein binding • transcription, DNA-templated • negative regulation of dendrite development • histone H3-R2 methylation • histone arginine methylation • Метилювання • peptidyl-arginine methylation, to asymmetrical-dimethyl arginine • positive regulation of cell population proliferation • histone methylation • response to cAMP • GO:0022415 viral process • positive regulation of fat cell differentiation • endochondral bone morphogenesis • intracellular estrogen receptor signaling pathway • Метилювання білків • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • protein localization to chromatin • regulation of lipid metabolic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10498	59035
Ensembl	ENSG00000142453	ENSMUSG00000032185
UniProt	Q86X55	Q9WVG6
RefSeq (мРНК)	NM_199141 NM_001370088 NM_001370089	NM_021531 NM_153141
RefSeq (білок)	NP_954592 NP_001357017 NP_001357018	NP_067506 NP_694781
Локус (UCSC)	Хр. 19: 10.87 – 10.92 Mb	Хр. 9: 21.46 – 21.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAAAAVGP		GAGGAGSAVP		GGAGPCATVS		VFPGARLLTI		GDANGEIQRH
AEQQALRLEV		RAGPDSAGIA		LYSHEDVCVF		KCSVSRETEC		SRVGKQSFII
TLGCNSVLIQ		FATPNDFCSF		YNILKTCRGH		TLERSVFSER		TEESSAVQYF
QFYGYLSQQQ		NMMQDYVRTG		TYQRAILQNH		TDFKDKIVLD		VGCGSGILSF
FAAQAGARKI		YAVEASTMAQ		HAEVLVKSNN		LTDRIVVIPG		KVEEVSLPEQ
VDIIISEPMG		YMLFNERMLE		SYLHAKKYLK		PSGNMFPTIG		DVHLAPFTDE
QLYMEQFTKA		NFWYQPSFHG		VDLSALRGAA		VDEYFRQPVV		DTFDIRILMA
KSVKYTVNFL		EAKEGDLHRI		EIPFKFHMLH		SGLVHGLAFW		FDVAFIGSIM
TVWLSTAPTE		PLTHWYQVRC		LFQSPLFAKA		GDTLSGTCLL		IANKRQSYDI
SIVAQVDQTG		SKSSNLLDLK		NPFFRYTGTT		PSPPPGSHYT		SPSENMWNTG
STYNLSSGMA		VAGMPTAYDL		SSVIASGSSV		GHNNLIPLAN		TGIVNHTHSR
MGSIMSTGIV		QGSSGAQGSG		GGSTSAHYAV		NSQFTMGGPA		ISMASPMSIP
TNTMHYGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ananthanarayanan M., Li S., Balasubramaniyan N., Suchy F.J., Walsh M.J. (2004). Ligand-dependent activation of the farnesoid X-receptor directs arginine methylation of histone H3 by CARM1. J. Biol. Chem. 279: 54348—54357. PMID 15471871 DOI:10.1074/jbc.M410021200
• Lee Y.-H., Coonrod S.A., Kraus W.L., Jelinek M.A., Stallcup M.R. (2005). Regulation of coactivator complex assembly and function by protein arginine methylation and demethylimination. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 3611—3616. PMID 15731352 DOI:10.1073/pnas.0407159102
• Miao F., Li S., Chavez V., Lanting L., Natarajan R. (2006). Coactivator-associated arginine methyltransferase-1 enhances nuclear factor-kappaB-mediated gene transcription through methylation of histone H3 at arginine 17. Mol. Endocrinol. 20: 1562—1573. PMID 16497732 DOI:10.1210/me.2005-0365
• Lakowski T.M., Frankel A. (2009). Kinetic analysis of human protein arginine N-methyltransferase 2: formation of monomethyl- and asymmetric dimethyl-arginine residues on histone H4. Biochem. J. 421: 253—261. PMID 19405910 DOI:10.1042/BJ20090268

Див. також

• Хромосома 19