CAPN5

CAPN5 (англ. Calpain 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 640 амінокислот, а молекулярна маса — 73 169.

CAPN5
Ідентифікатори
Символи	CAPN5, ADNIV, HTRA3, VRNI, nCL-3, calpain 5
Зовнішні ІД	OMIM: 602537 MGI: 1100859 HomoloGene: 31212 GeneCards: CAPN5
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • cell surface • екзосома • внутрішньоклітинний • focal adhesion • цитоплазма Біологічний процес • GO:0072468 сигнальна трансдукція • протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	726	12337
Ensembl	ENSG00000149260	ENSMUSG00000035547
UniProt	O15484	O08688
RefSeq (мРНК)	NM_004055	NM_001301250 NM_007602
RefSeq (білок)	NP_004046	NP_001288179 NP_031628
Локус (UCSC)	Хр. 11: 77.07 – 77.13 Mb	Хр. 7: 98.12 – 98.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFSCVKPYED		QNYSALRRDC		RRRKVLFEDP		LFPATDDSLY		YKGTPGPAVR
WKRPKGICED		PRLFVDGISS		HDLHQGQVGN		CWFVAACSSL		ASRESLWQKV
IPDWKEQEWD		PEKPNAYAGI		FHFHFWRFGE		WVDVVIDDRL		PTVNNQLIYC
HSNSRNEFWC		ALVEKAYAKL		AGCYQALDGG		NTADALVDFT		GGVSEPIDLT
EGDFANDETK		RNQLFERMLK		VHSRGGLISA		SIKAVTAADM		EARLACGLVK
GHAYAVTDVR		KVRLGHGLLA		FFKSEKLDMI		RLRNPWGERE		WNGPWSDTSE
EWQKVSKSER		EKMGVTVQDD		GEFWMTFEDV		CRYFTDIIKC		RVINTSHLSI
HKTWEEARLH		GAWTLHEDPR		QNRGGGCINH		KDTFFQNPQY		IFEVKKPEDE
VLICIQQRPK		RSTRREGKGE		NLAIGFDIYK		VEENRQYRMH		SLQHKAASSI
YINSRSVFLR		TDQPEGRYVI		IPTTFEPGHT		GEFLLRVFTD		VPSNCRELRL
DEPPHTCWSS		LCGYPQLVTQ		VHVLGAAGLK		DSPTGANSYV		IIKCEGDKVR
SAVQKGTSTP		EYNVKGIFYR		KKLSQPITVQ		VWNHRVLKDE		FLGQVHLKAD
PDNLQALHTL		HLRDRNSRQP		SNLPGTVAVH		ILSSTSLMAV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз.

Література

• Mugita N., Kimura Y., Ogawa M., Saya H., Nakao M. (1997). Identification of a novel, tissue-specific calpain htra-3; a human homologue of the Caenorhabditis elegans sex determination gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 239: 845—850. PMID 9367857 DOI:10.1006/bbrc.1997.7571
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Dear T.N., Matena K., Vingron M., Boehm T. (1997). A new subfamily of vertebrate calpains lacking a calmodulin-like domain: implications for calpain regulation and evolution. Genomics. 45: 175—184. PMID 9339374 DOI:10.1006/geno.1997.4870

Див. також

• Хромосома 11