ATF6B

ATF6B (англ. Activating transcription factor 6 beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 703 амінокислот, а молекулярна маса — 76 709.

ATF6B
Ідентифікатори
Символи	ATF6B, CREB-RP, CREBL1, G13, activating transcription factor 6 beta
Зовнішні ІД	OMIM: 600984 MGI: 105121 HomoloGene: 31238 GeneCards: ATF6B
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cAMP response element binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • внутрішньоклітинний • integral component of endoplasmic reticulum membrane • protein-DNA complex • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • система ендомембран • ядерце • RNA polymerase II transcription regulator complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • Відповідь на незгорнуті білки • ATF6-mediated unfolded protein response • response to unfolded protein • GO:0072468 сигнальна трансдукція • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of ATF6-mediated unfolded protein response Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1388	12915
Ensembl	ENSG00000213676 ENSG00000228628 ENSG00000234539 ENSG00000168468	ENSMUSG00000015461
UniProt	Q99941	O35451
RefSeq (мРНК)	NM_004381 NM_001136153	NM_017406
RefSeq (білок)	NP_001129625 NP_004372	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 6: 32.12 – 32.13 Mb	Хр. 17: 34.87 – 34.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAELMLLSEI		ADPTRFFTDN		LLSPEDWGLQ		NSTLYSGLDE		VAEEQTQLFR
CPEQDVPFDG		SSLDVGMDVS		PSEPPWELLP		IFPDLQVKSE		PSSPCSSSSL
SSESSRLSTE		PSSEALGVGE		VLHVKTESLA		PPLCLLGDDP		TSSFETVQIN
VIPTSDDSSD		VQTKIEPVSP		CSSVNSEASL		LSADSSSQAF		IGEEVLEVKT
ESLSPSGCLL		WDVPAPSLGA		VQISMGPSLD		GSSGKALPTR		KPPLQPKPVV
LTTVPMPSRA		VPPSTTVLLQ		SLVQPPPVSP		VVLIQGAIRV		QPEGPAPSLP
RPERKSIVPA		PMPGNSCPPE		VDAKLLKRQQ		RMIKNRESAC		QSRRKKKEYL
QGLEARLQAV		LADNQQLRRE		NAALRRRLEA		LLAENSELKL		GSGNRKVVCI
MVFLLFIAFN		FGPVSISEPP		SAPISPRMNK		GEPQPRRHLL		GFSEQEPVQG
VEPLQGSSQG		PKEPQPSPTD		QPSFSNLTAF		PGGAKELLLR		DLDQLFLSSD
CRHFNRTESL		RLADELSGWV		QRHQRGRRKI		PQRAQERQKS		QPRKKSPPVK
AVPIQPPGPP		ERDSVGQLQL		YRHPDRSQPA		FLDAIDRRED		TFYVVSFRRD
HLLLPAISHN		KTSRPKMSLV		MPAMAPNETL		SGRGAPGDYE		EMMQIECEVM
DTRVIHIKTS		TVPPSLRKQP		SPTPGNATGG		PLPVSAASQA		HQASHQPLYL
NHP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, відповідь на порушення конформації білку, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Khanna A., Campbell R.D. (1996). The gene G13 in the class III region of the human MHC encodes a potential DNA-binding protein. Biochem. J. 319: 81—89. PMID 8870652 DOI:10.1042/bj3190081
• Speek M., Barry F., Miller W.L. (1996). Alternate promoters and alternate splicing of human tenascin-X, a gene with 5' and 3' ends buried in other genes. Hum. Mol. Genet. 5: 1749—1758. PMID 8923003 DOI:10.1093/hmg/5.11.1749

Див. також

• Хромосома 6