ASCL1

ASCL1 (англ. Achaete-scute family bHLH transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 236 амінокислот, а молекулярна маса — 25 454.

ASCL1
Ідентифікатори
Символи	ASCL1, ASH1, HASH1, MASH1, bHLHa46, achaete-scute family bHLH transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 100790 MGI: 96919 HomoloGene: 31234 GeneCards: ASCL1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • bHLH transcription factor binding • E-box binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • double-stranded DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding Клітинна компонента • neuronal cell body • клітинне ядро • RNA polymerase II transcription regulator complex Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • commitment of neuronal cell to specific neuron type in forebrain • sympathetic ganglion development • pattern specification process • noradrenergic neuron development • cerebral cortex GABAergic interneuron differentiation • Нейрогенез • диференціація клітин • stomach neuroendocrine cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of neuron differentiation • response to retinoic acid • spinal cord association neuron differentiation • sympathetic nervous system development • neuroblast fate determination • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • spinal cord oligodendrocyte cell fate specification • musculoskeletal movement, spinal reflex action • negative regulation of apoptotic process • neuron migration • glial cell differentiation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cell maturation • cellular response to magnetism • oligodendrocyte differentiation • olfactory pit development • transcription, DNA-templated • lung neuroendocrine cell differentiation • нейробіологія розвитку • generation of neurons • response to lithium ion • multicellular organism development • positive regulation of neural precursor cell proliferation • adrenal chromaffin cell differentiation • positive regulation of neurogenesis • positive regulation of neuron apoptotic process • ventral spinal cord interneuron fate commitment • central nervous system neuron development • positive regulation of cell cycle • response to epidermal growth factor • regulation of cell population proliferation • vestibular nucleus development • positive regulation of neuron differentiation • regulation of mitotic cell cycle • forebrain neuron differentiation • cerebral cortex development • регуляція експресії генів • neuroblast proliferation • subpallium neuron fate commitment • regulation of timing of subpallium neuron differentiation • oligodendrocyte development • lung epithelial cell differentiation • carotid body glomus cell differentiation • response to folic acid • spinal cord oligodendrocyte cell differentiation • regulation of epithelial cell differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • noradrenergic neuron fate commitment • regulation of Notch signaling pathway • regulation of neurogenesis • positive regulation of Notch signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • oligodendrocyte cell fate commitment • neuron differentiation • neuron fate commitment • neuron fate specification • neuron development • heart development • sensory organ development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	429	17172
Ensembl	ENSG00000139352	ENSMUSG00000020052
UniProt	P50553	Q02067
RefSeq (мРНК)	NM_004316	NM_008553
RefSeq (білок)	NP_004307	NP_032579
Локус (UCSC)	Хр. 12: 102.96 – 102.96 Mb	Хр. 10: 87.33 – 87.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESSAKMESG		GAGQQPQPQP		QQPFLPPAAC		FFATAAAAAA		AAAAAAAQSA
QQQQQQQQQQ		QQAPQLRPAA		DGQPSGGGHK		SAPKQVKRQR		SSSPELMRCK
RRLNFSGFGY		SLPQQQPAAV		ARRNERERNR		VKLVNLGFAT		LREHVPNGAA
NKKMSKVETL		RSAVEYIRAL		QQLLDEHDAV		SAAFQAGVLS		PTISPNYSND
LNSMAGSPVS		SYSSDEGSYD		PLSPEEQELL		DFTNWF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Persson P., Joegi A., Grynfeld A., Paahlman S., Axelson H. (2000). HASH-1 and E2-2 are expressed in human neuroblastoma cells and form a functional complex. Biochem. Biophys. Res. Commun. 274: 22—31. PMID 10903890 DOI:10.1006/bbrc.2000.3090

Див. також

• Хромосома 12