ARID5A

ARID5A (англ. AT-rich interaction domain 5A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 594 амінокислот, а молекулярна маса — 64 074.

ARID5A
Ідентифікатори
Символи	ARID5A, MRF-1, MRF1, RP11-363D14, AT-rich interaction domain 5A
Зовнішні ІД	OMIM: 611583 MGI: 2443039 HomoloGene: 140573 GeneCards: ARID5A
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • transcription factor binding • estrogen receptor binding • retinoid X receptor binding • thyroid hormone receptor binding • androgen receptor binding • RNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • ядерце • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to estrogen stimulus • процес імунної системи • вроджений імунітет • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10865	214855
Ensembl	ENSG00000196843	ENSMUSG00000037447
UniProt	Q03989	Q3U108
RefSeq (мРНК)	NM_006673 NM_212481 NM_001319085 NM_001319087 NM_001319092 NM_001319093 NM_001319094 NM_001319096	NM_001172205 NM_001172206 NM_001290726 NM_001290727 NM_145996
RefSeq (білок)	NP_001306014 NP_001306016 NP_001306021 NP_001306022 NP_001306023 NP_001306025 NP_997646 NP_001306021.1	NP_001165676 NP_001165677 NP_001277655 NP_001277656 NP_666108
Локус (UCSC)	Хр. 2: 96.54 – 96.55 Mb	Хр. 1: 36.35 – 36.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAPVKGNRK		QSTEGDALDP		PASPKPAGKQ		NGIQNPISLE		DSPEAGGERE
EEQEREEEQA		FLVSLYKFMK		ERHTPIERVP		HLGFKQINLW		KIYKAVEKLG
AYELVTGRRL		WKNVYDELGG		SPGSTSAATC		TRRHYERLVL		PYVRHLKGED
DKPLPTSKPR		KQYKMAKENR		GDDGATERPK		KAKEERRMDQ		MMPGKTKADA
ADPAPLPSQE		PPRNSTEQQG		LASGSSVSFV		GASGCPEAYK		RLLSSFYCKG
THGIMSPLAK		KKLLAQVSKV		EALQCQEEGC		RHGAEPQASP		AVHLPESPQS
PKGLTENSRH		RLTPQEGLQA		PGGSLREEAQ		AGPCPAAPIF		KGCFYTHPTE
VLKPVSQHPR		DFFSRLKDGV		LLGPPGKEGL		SVKEPQLVWG		GDANRPSAFH
KGGSRKGILY		PKPKACWVSP		MAKVPAESPT		LPPTFPSSPG		LGSKRSLEEE
GAAHSGKRLR		AVSPFLKEAD		AKKCGAKPAG		SGLVSCLLGP		ALGPVPPEAY
RGTMLHCPLN		FTGTPGPLKG		QAALPFSPLV		IPAFPAHFLA		TAGPSPMAAG
LMHFPPTSFD		SALRHRLCPA		SSAWHAPPVT		TYAAPHFFHL		NTKL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2