AEBP1

AEBP1 (англ. AE binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 158 амінокислот, а молекулярна маса — 130 929.

AEBP1
Ідентифікатори
Символи	AEBP1, ACLP, AE binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602981 MGI: 1197012 HomoloGene: 878 GeneCards: AEBP1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • calmodulin binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • metallocarboxypeptidase activity • carboxypeptidase activity • serine-type carboxypeptidase activity • extracellular matrix structural constituent • collagen binding Клітинна компонента • цитоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • екзосома • клітинне ядро • міжклітинний простір • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • skeletal system development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • peptide metabolic process • protein processing • muscle organ development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • протеоліз • regulation of collagen fibril organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	165	11568
Ensembl	ENSG00000106624	ENSMUSG00000020473
UniProt	Q8IUX7	Q640N1
RefSeq (мРНК)	NM_001129	NM_001291857 NM_009636
RefSeq (білок)	NP_001120	NP_001278786 NP_033766
Локус (UCSC)	Хр. 7: 44.1 – 44.11 Mb	Хр. 11: 5.81 – 5.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAVRGAPLL		SCLLALLALC		PGGRPQTVLT		DDEIEEFLEG		FLSELEPEPR
EDDVEAPPPP		EPTPRVRKAQ		AGGKPGKRPG		TAAEVPPEKT		KDKGKKGKKD
KGPKVPKESL		EGSPRPPKKG		KEKPPKATKK		PKEKPPKATK		KPKEKPPKAT
KKPKEKPPKA		TKKPPSGKRP		PILAPSETLE		WPLPPPPSPG		PEELPQEGGA
PLSNNWQNPG		EETHVEAREH		QPEPEEETEQ		PTLDYNDQIE		REDYEDFEYI
RRQKQPRPPP		SRRRRPERVW		PEPPEEKAPA		PAPEERIEPP		VKPLLPPLPP
DYGDGYVIPN		YDDMDYYFGP		PPPQKPDAER		QTDEEKEELK		KPKKEDSSPK
EETDKWAVEK		GKDHKEPRKG		EELEEEWTPT		EKVKCPPIGM		ESHRIEDNQI
RASSMLRHGL		GAQRGRLNMQ		TGATEDDYYD		GAWCAEDDAR		TQWIEVDTRR
TTRFTGVITQ		GRDSSIHDDF		VTTFFVGFSN		DSQTWVMYTN		GYEEMTFHGN
VDKDTPVLSE		LPEPVVARFI		RIYPLTWNGS		LCMRLEVLGC		SVAPVYSYYA
QNEVVATDDL		DFRHHSYKDM		RQLMKVVNEE		CPTITRTYSL		GKSSRGLKIY
AMEISDNPGE		HELGEPEFRY		TAGIHGNEVL		GRELLLLLMQ		YLCREYRDGN
PRVRSLVQDT		RIHLVPSLNP		DGYEVAAQMG		SEFGNWALGL		WTEEGFDIFE
DFPDLNSVLW		GAEERKWVPY		RVPNNNLPIP		ERYLSPDATV		STEVRAIIAW
MEKNPFVLGA		NLNGGERLVS		YPYDMARTPT		QEQLLAAAMA		AARGEDEDEV
SEAQETPDHA		IFRWLAISFA		SAHLTLTEPY		RGGCQAQDYT		GGMGIVNGAK
WNPRTGTIND		FSYLHTNCLE		LSFYLGCDKF		PHESELPREW		ENNKEALLTF
MEQVHRGIKG		VVTDEQGIPI		ANATISVSGI		NHGVKTASGG		DYWRILNPGE
YRVTAHAEGY		TPSAKTCNVD		YDIGATQCNF		ILARSNWKRI		REIMAMNGNR
PIPHIDPSRP		MTPQQRRLQQ		RRLQHRLRLR		AQMRLRRLNA		TTTLGPHTVP
PTLPPAPATT		LSTTIEPWGL		IPPTTAGWEE		SETETYTEVV		TEFGTEVEPE
FGTKVEPEFE		TQLEPEFETQ		LEPEFEEEEE		EEKEEEIATG		QAFPFTTVET
YTVNFGDF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7