ABT1

ABT1 (англ. Activator of basal transcription 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 272 амінокислот, а молекулярна маса — 31 079.

ABT1
Ідентифікатори
Символи	ABT1, hactivator of basal transcription 1, Esf2
Зовнішні ІД	MGI: 1353636 HomoloGene: 134288 GeneCards: ABT1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • transcription regulator complex Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • small-subunit processome assembly • spinal cord motor neuron differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • transcription by RNA polymerase II • endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • transcription, DNA-templated • endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • positive regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29777	30946
Ensembl	ENSG00000146109	ENSMUSG00000036376
UniProt	Q9ULW3	Q9QYL7
RefSeq (мРНК)	NM_013375	NM_013924
RefSeq (білок)	NP_037507	NP_038952
Локус (UCSC)	Хр. 6: 26.6 – 26.6 Mb	Хр. 13: 23.6 – 23.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAEESEKAA		TEQEPLEGTE		QTLDAEEEQE		ESEEAACGSK		KRVVPGIVYL
GHIPPRFRPL		HVRNLLSAYG		EVGRVFFQAE		DRFVRRKKKA		AAAAGGKKRS
YTKDYTEGWV		EFRDKRIAKR		VAASLHNTPM		GARRRSPFRY		DLWNLKYLHR
FTWSHLSEHL		AFERQVRRQR		LRAEVAQAKR		ETDFYLQSVE		RGQRFLAADG
DPARPDGSWT		FAQRPTEQEL		RARKAARPGG		RERARLATAQ		DKARSNKGLL
ARIFGAPPPS		ESMEGPSLVR		DS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• de Planell-Saguer M., Schroeder D.G., Rodicio M.C., Cox G.A., Mourelatos Z. (2009). Biochemical and genetic evidence for a role of IGHMBP2 in the translational machinery. Hum. Mol. Genet. 18: 2115—2126. PMID 19299493 DOI:10.1093/hmg/ddp134

Див. також

• Хромосома 6