У Лізі Європи УЄФА 2015-16 узяли участь 191 команда з усіх 54 асоціацій членів УЄФА. Рейтинг асоціацій, оснований на таблиці коефіцієнтів УЄФА, використовується для визначення кількості команд-учасниць для кожної асоціації:
Асоціації 1-51 (крім Ліхтенштейну) представлені трьома (3) командами
Починаючи з сезону 2015/2016 переможець Ліги Європи попереднього сезону кваліфікується в Лігу чемпіонів. Якщо чинний переможець Ліги чемпіонів пробивається в груповий етап, здобувши необхідний результат у національній першості, то переможець Ліги Європи теж потрапляє в основну сітку.
У кваліфікаційних раундах і плей-оф команди розподіляються на сіяні та несіяні відповідно до їхнього рейтингу у таблиці коефіцієнтів УЄФА—2015,[2] за якими проводиться жеребкування, що розподіляє пари у двоматчевому протистоянні. Команди з однієї країни не грають одна з одною.
У груповому раунді беруть участь 48 команд: 16 команд, які автоматично потрапили в груповий етап, 22 переможці раунду плей-оф та 10 команд, які програли в раунді плей-оф Ліги Чемпіонів.
48 команд будуть розподілені за клубним рейтингом УЄФА 2015. За допомогою жеребкування команди будуть розподілені на 12 груп по 4 команди у кожній. Команди з однієї асоціації не можуть бути в одній групі.
У кожній групі команди грають одна з одною по 2 матчі: вдома та на виїзді (по круговій системі). Команди, що посіли перше та друге місця виходять у плей-оф.
У плей-оф братимуть участь 32 клуби: 24 клуби, що зайняли перші два місця на груповому етапі, і 8 клубів, що зайняли 3-і місця на груповому етапі Ліги чемпіонів.