ZZEF1
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
ZZEF1 (англ. Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 961 амінокислот, а молекулярна маса — 331 075[4].
ZZEF1 | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||
Символи | ZZEF1, ZZZ4, zinc finger ZZ-type and EF-hand domain containing 1 | ||||||
Зовнішні ІД | MGI: 2444286 HomoloGene: 9027 GeneCards: ZZEF1 | ||||||
Ортологи | |||||||
Види | Людина | Миша | |||||
Entrez |
|
|
|||||
Ensembl |
|
|
|||||
UniProt |
|
|
|||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||
Локус (UCSC) | Хр. 17: 4 – 4.14 Mb | Хр. 11: 72.69 – 72.82 Mb | |||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||
Вікідані | |||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGNAPSHSSE | DEAAAAGGEG | WGPHQDWAAV | SGTTPGPGVA | APALPPAAAL | ||||
LEPARLREAA | AALLPTPPCE | SLVSRHRGAL | FRWLEERLGR | GEESVTLEQF | ||||
RELLEARGAG | CSSEQFEEAF | AQFDAEGDGT | VDAENMLEAL | KNSSGANLQG | ||||
ELSHIIRQLQ | ACSLVPGFTD | IFSESKEGLD | IHSSMILRFL | HRNRLSSAVM | ||||
PYPMLEHCNN | MCTMRSSVLK | ESLDQLVQKE | KESPGDLTRS | PEMDKLKSVA | ||||
KCYAYIETSS | NSADIDKMTN | GETSSYWQSD | GSACSHWIRL | KMKPDVVLRH | ||||
LSIAVAATDQ | SYMPQQVTVA | VGRNASDLQE | VRDVHIPSNV | TGYVTLLENA | ||||
NVSQLYVQIN | IKRCLSDGCD | TRIHGLRAVG | FQRVKKSGVS | VSDASAIWYW | ||||
SLLTSLVTAS | METNPAFVQT | VLHNTQKALR | HMPPLSLSPG | STDFSTFLSP | ||||
NVLEEVDSFL | IRITSCCSTP | EVELTLLAFA | LARGSVAKVM | SSLCTITDHL | ||||
DTQYDASSLI | LSMASVRQNL | LLKYGKPLQL | TLQACDVKGK | EDKSGPENLL | ||||
VEPWTRDGFL | TETGKTRAST | IFSTGTESAF | QVTQIRIMVR | RGGIGAQCGL | ||||
VFAYNSSSDK | FCAEEHFKRF | EKYDKWKLQE | LRQFVKSRIG | CSSDDLGEDD | ||||
PIGWFELEEE | WDEADVKLQQ | CRVAKYLMVK | FLCTRQESAE | RLGVQGLTIS | ||||
GYLRPARAEA | EQSVTCAHCR | KDTEESVCGA | TLLLRTLQFI | QQLAHDLVQQ | ||||
KESGLKYKSF | LDFAGLDLQI | FWNFYSKLKQ | NPREECVSAQ | TLLLQLLQSC | ||||
FSVLQGDVLA | ASEEEKAPIQ | SPKGVEAAKE | LYTHLCDVVD | KVDGDSVPME | ||||
ILKQEVRNTL | LNGAAIFFPN | RQTRRNHLFT | MMNVTEQEHK | QSLQLTFRSL | ||||
CTYFSDKDPG | GLLLLPEKND | LAKMNISEVL | AVMDTLVSVA | ARECELLMLS | ||||
GAPGEVGSVL | FSLFWSVQGS | LLSWCYLQLK | STDSGAKDLA | VDLIEKYVGQ | ||||
FLASMRAILE | SLFSQYSGKT | IVERLCNSVF | SMAARQLVIF | LLDFCTLDIP | ||||
HCVLLREFSV | LTELLKKLCS | GPEGGLRKLD | VETWQQEQPV | VLHTWTKESA | ||||
HNYENNCHEV | SVFVSPGATY | FEVEFDDRCE | TEKRYDYLEF | TDARGRKTRY | ||||
DTKVGTDKWP | KKVTFKAGPR | LQFLFHSDSS | HNEWGYKFTV | TACGLPDVAV | ||||
SWGLDLQLLV | SRLMGRLASQ | CMALKSVRQL | GSNMVVPQAK | MALVLSSPLW | ||||
KPVFRHQVCP | ELELEASWPT | HPHRNSKEVK | NIPDDPCRHF | LLDFAQSEPA | ||||
QNFCGPYSEL | FKGFIQACRK | QAPKTDIVAG | STIDQAVNAT | FAALVYRTPD | ||||
LYEKLQKYVN | SGGKIALSEE | FAQVYSLADG | IRIWMLEMKQ | KSLMSLGNEA | ||||
EEKHSSEATE | VNPESLAKEC | IEKSLLLLKF | LPTGISSKES | CEKLETADET | ||||
SHLQPLNKRQ | RTSSVVEEHF | QASVSPTEAA | PPATGDQSPG | LGTQPKLPSS | ||||
SGLPAADVSP | ATAEEPLSPS | TPTRRPPFTR | GRLRLLSFRS | MEEARLVPTV | ||||
KEKYPVLKDV | MDFIKDQSLS | HRSVVKVLSL | RKAQAQSILE | VLKITQHCAE | ||||
SLGQPHCFHP | PFILFLLELL | TCQKDFTNYF | GHLEGCGADL | HKEIRDTYYQ | ||||
LVLFLVKAVK | GFSSLNDRSL | LPALSCVQTA | LLHLLDMGWE | PNDLAFFVDI | ||||
QLPDLLMKMS | QENISVHDSV | ISQWSEEDEL | ADAKQNSEWM | DECQDGMFEA | ||||
WYEKIAQEDP | EKQRKMHMFI | ARYCDLLNVD | ISCDGCDEIA | PWHRYRCLQC | ||||
SDMDLCKTCF | LGGVKPEGHG | DDHEMVNMEF | TCDHCQGLII | GRRMNCNVCD | ||||
DFDLCYGCYA | AKKYSYGHLP | THSITAHPMV | TIRISDRQRL | IQPYIHNYSW | ||||
LLFAALALYS | AHLASAEDVD | GEKLDPQTRS | SATTLRSQCM | QLVGDCLMKA | ||||
HQGKGLKALA | LLGVLPDGDS | SLEDQALPVT | VPTGASEEQL | EKKAVQGAEL | ||||
SEAGNGKRAV | HEEIRPVDFK | QRNKADKGVS | LSKDPSCQTQ | ISDSPADASP | ||||
PTGLPDAEDS | EVSSQKPIEE | KAVTPSPEQV | FAECSQKRIL | GLLAAMLPPL | ||||
KSGPTVPLID | LEHVLPLMFQ | VVISNAGHLN | ETYHLTLGLL | GQLIIRLLPA | ||||
EVDAAVIKVL | SAKHNLFAAG | DSSIVPDGWK | TTHLLFSLGA | VCLDSRVGLD | ||||
WACSMAEILR | SLNSAPLWRD | VIATFTDHCI | KQLPFQLKHT | NIFTLLVLVG | ||||
FPQVLCVGTR | CVYMDNANEP | HNVIILKHFT | EKNRAVIVDV | KTRKRKTVKD | ||||
YQLVQKGGGQ | ECGDSRAQLS | QYSQHFAFIA | SHLLQSSMDS | HCPEAVEATW | ||||
VLSLALKGLY | KTLKAHGFEE | IRATFLQTDL | LKLLVKKCSK | GTGFSKTWLL | ||||
RDLEILSIML | YSSKKEINAL | AEHGDLELDE | RGDREEEVER | PVSSPGDPEQ | ||||
KKLDPLEGLD | EPTRICFLMA | HDALNAPLHI | LRAIYELQMK | KTDYFFLEVQ | ||||
KRFDGDELTT | DERIRSLAQR | WQPSKSLRLE | EQSAKAVDTD | MIILPCLSRP | ||||
ARCDQATAES | NPVTQKLISS | TESELQQSYA | KQRRSKSAAL | LHKELNCKSK | ||||
RAVRDYLFRV | NEATAVLYAR | HVLASLLAEW | PSHVPVSEDI | LELSGPAHMT | ||||
YILDMFMQLE | EKHEWEKILQ | KVLQGCREDM | LGTMALAACQ | FMEEPGMEVQ | ||||
VRESKHPYNN | NTNFEDKVHI | PGAIYLSIKF | DSQCNTEEGC | DELAMSSSSD | ||||
FQQDRHSFSG | SQQKWKDFEL | PGDTLYYRFT | SDMSNTEWGY | RFTVTAGHLG | ||||
RFQTGFEILK | QMLSEERVVP | HLPLAKIWEW | LVGVACRQTG | HQRLKAIHLL | ||||
LRIVRCCGHS | DLCDLALLKP | LWQLFTHMEY | GLFEDVTQPG | ILLPLHRALT | ||||
ELFFVTENRA | QELGVLQDYL | LALTTDDHLL | RCAAQALQNI | AAISLAINYP | ||||
NKATRLWNVE | C |
Кодований геном білок за функціями належить до фосфопротеїнів, ліпопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Література
ред.- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Cvekl A. Jr., Zavadil J., Birshtein B.K., Grotzer M.A., Cvekl A. (2004). Analysis of transcripts from 17p13.3 in medulloblastoma suggests ROX/MNT as a potential tumour suppressor gene. Eur. J. Cancer. 40: 2525—2532. PMID 15519529 DOI:10.1016/j.ejca.2004.08.005
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29027 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O43149 (англ.) . Архів оригіналу за 6 листопада 2016. Процитовано 21 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |