ZMYND8

ZMYND8
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4COS
Ідентифікатори
Символи	ZMYND8, PRKCBP1, PRO2893, RACK7, zinc finger MYND-type containing 8
Зовнішні ІД	OMIM: 615713 MGI: 1918025 HomoloGene: 32679 GeneCards: ZMYND8
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001106 transcription corepressor activity; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • chromatin binding; • GO:0001104 transcription coregulator activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв'язування з іоном металу; • methylated histone binding; • lysine-acetylated histone binding; • protein N-terminus binding; • zinc ion binding; • protein domain specific binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • dendritic shaft; • dendritic spine; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• regulation of postsynaptic density protein 95 clustering; • positive regulation of filopodium assembly; • positive regulation of dendritic spine development; • positive regulation of dendritic spine maintenance; • modulation of excitatory postsynaptic potential; • transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of cell migration; • negative regulation of nucleic acid-templated transcription;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	23613
	228880
	ENSG00000101040
	ENSMUSG00000039671
	Q9ULU4
	н/д
NM_001281769; NM_001281771; NM_001281772; NM_001281773; NM_001281774;
	NM_001281775; NM_001281776; NM_001281777; NM_001281778; NM_001281779; NM_001281780; NM_001281781; NM_001281782; NM_001281783; NM_001281784; NM_012408; NM_183047; NM_183048; NM_001363714; NM_001363741
NM_001252584; NM_001252585; NM_001252587; NM_001281926; NM_001291158;
	NM_027230; NM_172270; NM_001363018; NM_001363019; NM_001363020; NM_001363021
NP_001268698; NP_001268700; NP_001268701; NP_001268702; NP_001268703;
	NP_001268704; NP_001268705; NP_001268706; NP_001268707; NP_001268708; NP_001268709; NP_001268710; NP_001268711; NP_001268712; NP_001268713; NP_036540; NP_898868; NP_898869; NP_001350643; NP_001350670
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ZMYND8 (англ. Zinc finger MYND-type containing 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 186 амінокислот, а молекулярна маса — 131 692^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDISTRSKDP	GSAERTAQKR	KFPSPPHSSN	GHSPQDTSTS	PIKKKKKPGL
LNSNNKEQSE	LRHGPFYYMK	QPLTTDPVDV	VPQDGRNDFY	CWVCHREGQV
LCCELCPRVY	HAKCLRLTSE	PEGDWFCPEC	EKITVAECIE	TQSKAMTMLT
IEQLSYLLKF	AIQKMKQPGT	DAFQKPVPLE	QHPDYAEYIF	HPMDLCTLEK
NAKKKMYGCT	EAFLADAKWI	LHNCIIYNGG	NHKLTQIAKV	VIKICEHEMN
EIEVCPECYL	AACQKRDNWF	CEPCSNPHPL	VWAKLKGFPF	WPAKALRDKD
GQVDARFFGQ	HDRAWVPINN	CYLMSKEIPF	SVKKTKSIFN	SAMQEMEVYV
ENIRRKFGVF	NYSPFRTPYT	PNSQYQMLLD	PTNPSAGTAK	IDKQEKVKLN
FDMTASPKIL	MSKPVLSGGT	GRRISLSDMP	RSPMSTNSSV	HTGSDVEQDA
EKKATSSHFS	ASEESMDFLD	KSTASPASTK	TGQAGSLSGS	PKPFSPQLSA
PITTKTDKTS	TTGSILNLNL	DRSKAEMDLK	ELSESVQQQS	TPVPLISPKR
QIRSRFQLNL	DKTIESCKAQ	LGINEISEDV	YTAVEHSDSE	DSEKSDSSDS
EYISDDEQKS	KNEPEDTEDK	EGCQMDKEPS	AVKKKPKPTN	PVEIKEELKS
TSPASEKADP	GAVKDKASPE	PEKDFSEKAK	PSPHPIKDKL	KGKDETDSPT
VHLGLDSDSE	SELVIDLGED	HSGREGRKNK	KEPKEPSPKQ	DVVGKTPPST
TVGSHSPPET	PVLTRSSAQT	SAAGATATTS	TSSTVTVTAP	APAATGSPVK
KQRPLLPKET	APAVQRVVWN	SSSKFQTSSQ	KWHMQKMQRQ	QQQQQQQNQQ
QQPQSSQGTR	YQTRQAVKAV	QQKEITQSPS	TSTITLVTST	QSSPLVTSSG
SMSTLVSSVN	ADLPIATASA	DVAADIAKYT	SKMMDAIKGT	MTEIYNDLSK
NTTGSTIAEI	RRLRIEIEKL	QWLHQQELSE	MKHNLELTMA	EMRQSLEQER
DRLIAEVKKQ	LELEKQQAVD	ETKKKQWCAN	CKKEAIFYCC	WNTSYCDYPC
QQAHWPEHMK	SCTQSATAPQ	QEADAEVNTE	TLNKSSQGSS	SSTQSAPSET
ASASKEKETS	AEKSKESGST	LDLSGSRETP	SSILLGSNQG	SDHSRSNKSS
WSSSDEKRGS	TRSDHNTSTS	TKSLLPKESR	LDTFWD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9397 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9ULU4 (англ.) . Архів оригіналу за 4 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9397 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9ULU4 (англ.) . Архів оригіналу за 4 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]