ZCCHC3

ZCCHC3 (англ. Zinc finger CCHC-type containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 404 амінокислот, а молекулярна маса — 43 618.

ZCCHC3
Ідентифікатори
Символи	ZCCHC3, C20orf99, zinc finger CCHC-type containing 3
Зовнішні ІД	OMIM: 618326 MGI: 1915167 HomoloGene: 13214 GeneCards: ZCCHC3
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • zinc ion binding • nucleic acid binding • RNA binding • double-stranded DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма Біологічний процес • activation of innate immune response • detection of virus • positive regulation of type I interferon production • defense response to virus • cellular response to exogenous dsRNA • positive regulation of RIG-I signaling pathway • процес імунної системи • вроджений імунітет Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	85364	67917
Ensembl	ENSG00000247315	ENSMUSG00000074682
UniProt	Q9NUD5	Q8BPK2
RefSeq (мРНК)	NM_033089	NM_175126
RefSeq (білок)	NP_149080	NP_780335
Локус (UCSC)	Хр. 20: 0.3 – 0.3 Mb	Хр. 2: 152.25 – 152.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATGGGAEEE		RKRGRPQLLP		PARPAARGEE		ADGGREKMGW		AQVVKNLAEK
KGEFREPRPP		RREEESGGGG		GSAGLGGPAG		LAAPDLGDFP		PAGRGDPKGR
RRDPAGEAVD		PRKKKGAAEA		GRRKKAEAAA		AAMATPARPG		EAEDAAERPL
QDEPAAAAAG		PGKGRFLVRI		CFQGDEGACP		TRDFVVGALI		LRSIGMDPSD
IYAVIQIPGS		REFDVSFRSA		EKLALFLRVY		EEKREQEDCW		ENFVVLGRSK
SSLKTLFILF		RNETVDVEDI		VTWLKRHCDV		LAVPVKVTDR		FGIWTGEYKC
EIELRQGEGG		VRHLPGAFFL		GAERGYSWYK		GQPKTCFKCG		SRTHMSGSCT
QDRCFRCGEE		GHLSPYCRKG		IVCNLCGKRG		HAFAQCPKAV		HNSVAAQLTG
VAGH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20