ZC3H12A

ZC3H12A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3V32, 3V33, 3V34
Ідентифікатори
Символи	ZC3H12A, MCPIP, MCPIP1, dJ423B22.1, zinc finger CCCH-type containing 12A, Reg1, MCPIP-1
Зовнішні ІД	OMIM: 610562 MGI: 2385891 HomoloGene: 11824 GeneCards: ZC3H12A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• miRNA binding; • chromatin binding; • зв'язування з іоном металу; • ribonuclease activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nuclease activity; • endonuclease activity; • mRNA binding; • hydrolase activity; • ribosome binding; • mRNA 3'-UTR binding; • mRNA 3'-UTR AU-rich region binding; • DNA binding; • RNA binding; • endoribonuclease activity; • exoribonuclease activity; • thiol-dependent deubiquitinase; • RNA stem-loop binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • нуклеоплазма; • цитоскелет; • клітинне ядро; • extrinsic component of endoplasmic reticulum membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • rough endoplasmic reticulum membrane; • rough endoplasmic reticulum; • P-body; • мембрана; • cytoplasmic ribonucleoprotein granule; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• positive regulation of p38MAPK cascade; • cellular response to virus; • диференціація клітин; • positive regulation of cell death; • positive regulation of autophagy; • negative regulation of interleukin-6 production; • positive regulation of lipid storage; • negative regulation of macrophage activation; • cellular response to tumor necrosis factor; • negative regulation of gene expression; • positive regulation of angiogenesis; • negative regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA; • positive regulation of endothelial cell migration; • multicellular organism development; • protein deubiquitination; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • positive regulation of reactive oxygen species metabolic process; • protein complex oligomerization; • Ангіогенез; • регуляція експресії генів; • positive regulation of protein import into nucleus; • negative regulation by host of viral genome replication; • negative regulation of tumor necrosis factor production; • positive regulation of miRNA catabolic process; • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • positive regulation of defense response to virus by host; • GO:0097285 апоптоз; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; • процес імунної системи; • negative regulation of muscle cell apoptotic process; • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of fat cell differentiation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, endonucleolytic cleavage-dependent decay; • defense response to virus; • cellular response to glucose starvation; • нейробіологія розвитку; • negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response; • cellular response to sodium arsenite; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation; • cellular response to ionomycin; • positive regulation of mRNA catabolic process; • cellular response to lipopolysaccharide; • cellular response to oxidative stress; • RNA phosphodiester bond hydrolysis; • negative regulation of nitric oxide biosynthetic process; • cellular response to interleukin-1; • positive regulation of protein deubiquitination; • cellular response to chemokine; • inflammatory response; • 3'-UTR-mediated mRNA destabilization; • negative regulation of cardiac muscle contraction; • positive regulation of execution phase of apoptosis; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic; • cellular response to DNA damage stimulus; • immune response-activating signal transduction; • negative regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • T cell receptor signaling pathway; • negative regulation of T-helper 17 cell differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	80149
	230738
	ENSG00000163874
	ENSMUSG00000042677
	Q5D1E8
	Q5D1E7
	NM_025079; NM_001323550; NM_001323551
	NM_153159
	NP_001310479; NP_001310480; NP_079355
	NP_694799
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ZC3H12A (англ. Zinc finger CCCH-type containing 12A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 599 амінокислот, а молекулярна маса — 65 699^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGPCGEKPV	LEASPTMSLW	EFEDSHSRQG	TPRPGQELAA	EEASALELQM
KVDFFRKLGY	SSTEIHSVLQ	KLGVQADTNT	VLGELVKHGT	ATERERQTSP
DPCPQLPLVP	RGGGTPKAPN	LEPPLPEEEK	EGSDLRPVVI	DGSNVAMSHG
NKEVFSCRGI	LLAVNWFLER	GHTDITVFVP	SWRKEQPRPD	VPITDQHILR
ELEKKKILVF	TPSRRVGGKR	VVCYDDRFIV	KLAYESDGIV	VSNDTYRDLQ
GERQEWKRFI	EERLLMYSFV	NDKFMPPDDP	LGRHGPSLDN	FLRKKPLTLE
HRKQPCPYGR	KCTYGIKCRF	FHPERPSCPQ	RSVADELRAN	ALLSPPRAPS
KDKNGRRPSP	SSQSSSLLTE	SEQCSLDGKK	LGAQASPGSR	QEGLTQTYAP
SGRSLAPSGG	SGSSFGPTDW	LPQTLDSLPY	VSQDCLDSGI	GSLESQMSEL
WGVRGGGPGE	PGPPRAPYTG	YSPYGSELPA	TAAFSAFGRA	MGAGHFSVPA
DYPPAPPAFP	PREYWSEPYP	LPPPTSVLQE	PPVQSPGAGR	SPWGRAGSLA
KEQASVYTKL	CGVFPPHLVE	AVMGRFPQLL	DPQQLAAEIL	SYKSQHPSE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, нуклеаз, білків розвитку, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, імунітет, відповідь на стрес, транскрипція, регуляція транскрипції, запальна відповідь, пошкодження ДНК, ангіогенез, диференціація, нейрогенез, антивірусний захист, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, іоном магнію, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Niu J., Azfer A., Zhelyabovska O., Fatma S., Kolattukudy P.E. (2008). Monocyte chemotactic protein (MCP)-1 promotes angiogenesis via a novel transcription factor, MCP-1-induced protein (MCPIP). J. Biol. Chem. 283: 14542—14551. PMID 18364357 DOI:10.1074/jbc.M802139200
Vrotsos E.G., Kolattukudy P.E., Sugaya K. (2009). MCP-1 involvement in glial differentiation of neuroprogenitor cells through APP signaling. Brain Res. Bull. 79: 97—103. PMID 19185603 DOI:10.1016/j.brainresbull.2009.01.004
Roy A., Zhang M., Saad Y., Kolattukudy P.E. (2013). Antidicer RNase activity of monocyte chemotactic protein-induced protein-1 is critical for inducing angiogenesis. Am. J. Physiol. 305: C1021—C1032. PMID 24048733 DOI:10.1152/ajpcell.00203.2013
Uehata T., Akira S. (2013). mRNA degradation by the endoribonuclease Regnase-1/ZC3H12a/MCPIP-1. Biochim. Biophys. Acta. 1829: 708—713. PMID 23500036 DOI:10.1016/j.bbagrm.2013.03.001

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26259 (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q5D1E8 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26259 (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q5D1E8 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]