ZBED9

ZBED9 (англ. Zinc finger BED-type containing 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 325 амінокислот, а молекулярна маса — 151 666.

ZBED9
Ідентифікатори
Символи	ZBED9, Buster4, SCAND3, ZFP38-L, ZNF305P2, ZNF452, dJ1186N24.3, zinc finger BED-type containing 9
Зовнішні ІД	OMIM: 615254 HomoloGene: 62168 GeneCards: ZBED9
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • DNA integration • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	114821	н/д
Ensembl	ENSG00000248496 ENSG00000232040	н/д
UniProt	Q6R2W3	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_052923 NM_001329616	н/д
RefSeq (білок)	NP_001316545 NP_443155	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 6: 28.57 – 28.62 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAVSRVFPA		LAGQAPEEQG		EIIKVKVKEE		DHTWDQESAL		RRNLSYTREL
SRQRFRQFCY		QETPGPREAL		SQLRELCRQW		LNPEIHTKEQ		ILELLVLEQF
LTILPEELQS		WVREHNPESG		EEVVTLLEDL		ERELDEPRQQ		VSQGTYGQEV
SMEEMIPLDS		AKESLGTQLQ		SMEDRMECES		PEPHPLQDNG		SFLWFSMMSQ
SMGGDNLSSL		DTNEAEIEPE		NMREKFFRSL		ARLLENKSNN		TKIFSKAKYC
QLIKEVKEAK		AKAKKESVDY		RRLARFDVIL		VQGNEKLIEA		VNGETDKIRY
YLHSEDLFDI		LHNTHLSIGH		GGRTRMEKEL		QAKYKNITKE		VIMLYLTLCK
PCQQKNSKLK		KVLTSKSIKE		VSSRCQVDLI		DMQLNPDGEY		RFILHYQDLC
TKLTFLRSLK		SKRPTEVAHA		LLDIFTIIGA		PSVLQSDNGR		EFSSQVVSEL
SNIWPELKIV		HGKSQTCQSQ		SSAEQTEDIR		KRIFSWMQTN		NSSHWTEFLW
FIQMSQNQPY		HRSMQQTPCE		SAFSSEAKLG		LSHSQLTEEL		VASLHTENEL
DQADKELENT		LRAQYEENIE		TGTDSSDIEE		NLSVTPKVAE		KSPPESRLRF
LSCVVCEKEC		TGVNSCISCD		GNIHAICGVP		SQHGTEGCGR		QITCSLCYET
STMKRKHDEI		QRSLPVKPSK		MLKPSGTPFS		PDKVGDWMAK		QASLDFFVKK
RHAFSEHSSS		NKRNVNNRSY		PEEGKTKRVH		ASFTRKYDPS		YIEFGFVAVI
DGEVLKPQCI		ICGDVLANEA		MKPSKLKRHL		YSKHKEISSQ		PKEFFERKSS
ELKSQPKQVF		NVSHINISAL		RASYKVALPV		AKSKTPYTIA		ETLVKDCIKE
VCLEMLGESA		AKKVAQVPLS		NDTIARRIQE		LANDMEDQLI		EQIKLAKYFS
LQLDECRDIA		NMIILLVYVR		FEHDDDIKEE		FFFSASLPTN		TTSSELYEAV
KNYIVNKCGL		EFKFCVGVCS		DGAASMTGKH		SEVVTQIKEL		APECKTTHCF
IHRESLAMKK		ISAELNSVLN		DIVKIVNYIK		SNSLNSRLFS		LLCDNMEADH
KQLLLHAEIR		WLSRGKVLSR		MFEIRNELLV		FLQGKKPMWS		QLFKDVNWTA
RLAYLSDIFS		IFNDLNASMQ		GKNATYFSMA		DKVEGQKQKL		EAWKNRISTD
CYDMFHNLTT		IINEVGNDLD		IAHLRKVISE		HLTNLLECFE		FYFPSKEDPR
IGNLWIQNPF		LSSKDNLNLT		VTLQDKLLKL		ATDEGLKISF		ENTASLPSFW
IKAKNDYPEL		AEIALKLLLL		FPSTYLCETG		FSTLSVIKTK		HRNSLNIHYP
LRVALSSIQP		RLDKLTSKKQ		AHLSH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179
• Hayward A., Ghazal A., Andersson G., Andersson L., Jern P. (2013). ZBED evolution: repeated utilization of DNA transposons as regulators of diverse host functions. PLoS ONE. 8: E59940—E59940. PMID 23533661 DOI:10.1371/journal.pone.0059940

Див. також

• Хромосома 6