ZBED4

ZBED4 (англ. Zinc finger BED-type containing 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 171 амінокислот, а молекулярна маса — 130 322.

ZBED4
Ідентифікатори
Символи	ZBED4, zinc finger BED-type containing 4
Зовнішні ІД	OMIM: 612552 HomoloGene: 135729 GeneCards: ZBED4
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • protein dimerization activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9889	315211
Ensembl	ENSG00000100426	ENSRNOG00000004588
UniProt	O75132	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_014838	NM_001134800
RefSeq (білок)	NP_055653	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 22: 49.85 – 49.89 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MENNLKTCPK		EDGDFVSDKI		KFKIEEEDDD		GIPPDSLERM		DFKSEQEDMK
QTDSGGERAG		LGGTGCSCKP		PGKYLSAESE		DDYGALFSQY		SSTLYDVAME
AVTQSLLSSR		NMSSRKKSPA		WKHFFISPRD		STKAICMYCV		KEFSRGKNEK
DLSTSCLMRH		VRRAHPTVLI		QENGSVSAVS		SFPSPSLLLP		PQPADAGDLS
TILSPIKLVQ		KVASKIPSPD		RITEESVSVV		SSEEISSDMS		VSEKCGREEA
LVGSSPHLPA		LHYDEPAENL		AEKSLPLPKS		TSGSRRRSAV		WKHFYLSPLD
NSKAVCIHCM		NEFSRGKNGK		DLGTSCLIRH		MWRAHRAIVL		QENGGTGIPP
LYSTPPTLLP		SLLPPEGELS		SVSSSPVKPV		RESPSASSSP		DRLTEDLQSH
LNPGDGLMED		VAAFSSSDDI		GEASASSPEK		QQADGLSPRL		FESGAIFQQN
KKVMKRLKSE		VWHHFSLAPM		DSLKAECRYC		GCAISRGKKG		DVGTSCLMRH
LYRRHPEVVG		SQKGFLGASL		ANSPYATLAS		AESSSSKLTD		LPTVVTKNNQ
VMFPVNSKKT		SKLWNHFSIC		SADSTKVVCL		HCGRTISRGK		KPTNLGTSCL
LRHLQRFHSN		VLKTEVSETA		RPSSPDTRVP		RGTELSGASS		FDDTNEKFYD
SHPVAKKITS		LIAEMIALDL		QPYSFVDNVG		FNRLLEYLKP		QYSLPAPSYF
SRTAIPGMYD		NVKQIIMSHL		KEAESGVIHF		TSGIWMSNQT		REYLTLTAHW
VSFESPARPR		CDDHHCSALL		DVSQVDCDYS		GNSIQKQLEC		WWEAWVTSTG
LQVGITVTDN		ASIGKTLNEG		EHSSVQCFSH		TVNLIVSEAI		KSQRMVQNLL
SLARKICERV		HRSPKAKEKL		AELQREYALP		QHHLIQDVPS		KWSTSFHMLE
RLIEQKRAIN		EMSVECNFRE		LISCDQWEVM		QSVCRALKPF		EAASREMSTQ
MSTLSQVIPM		VHILNRKVEM		LFEETMGIDT		MLRSLKEAMV		SRLSATLHDP
RYVFATLLDP		RYKASLFTEE		EAEQYKQDLI		RELELMNSTS		EDVAASHRCD
AGSPSKDSAA		EENLWSLVAK		VKKKDPREKL		PEAMVLAYLE		EEVLEHSCDP
LTYWNLKKAS		WPGLSALAVR		FLGCPPSIVP		SEKLFNTPTE		NGSLGQSRLM
MEHFEKLIFL		KVNLPLIYFQ		Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 22