YTHDF1

YTHDF1 (англ. YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 559 амінокислот, а молекулярна маса — 60 874.

YTHDF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4RCI, 4RCJ
Ідентифікатори
Символи	YTHDF1, C20orf21, YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 1, DF1
Зовнішні ІД	OMIM: 616529 MGI: 1917431 HomoloGene: 9844 GeneCards: YTHDF1
Онтологія гена Молекулярна функція • ribosome binding • N6-methyladenosine-containing RNA binding • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма Біологічний процес • positive regulation of translational initiation • positive regulation of translation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54915	228994
Ensembl	ENSG00000149658	ENSMUSG00000038848
UniProt	Q9BYJ9	P59326
RefSeq (мРНК)	NM_017798	NM_173761
RefSeq (білок)	NP_060268	NP_776122
Локус (UCSC)	Хр. 20: 63.2 – 63.22 Mb	Хр. 2: 180.55 – 180.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSATSVDTQR		TKGQDNKVQN		GSLHQKDTVH		DNDFEPYLTG		QSNQSNSYPS
MSDPYLSSYY		PPSIGFPYSL		NEAPWSTAGD		PPIPYLTTYG		QLSNGDHHFM
HDAVFGQPGG		LGNNIYQHRF		NFFPENPAFS		AWGTSGSQGQ		QTQSSAYGSS
YTYPPSSLGG		TVVDGQPGFH		SDTLSKAPGM		NSLEQGMVGL		KIGDVSSSAV
KTVGSVVSSV		ALTGVLSGNG		GTNVNMPVSK		PTSWAAIASK		PAKPQPKMKT
KSGPVMGGGL		PPPPIKHNMD		IGTWDNKGPV		PKAPVPQQAP		SPQAAPQPQQ
VAQPLPAQPP		ALAQPQYQSP		QQPPQTRWVA		PRNRNAAFGQ		SGGAGSDSNS
PGNVQPNSAP		SVESHPVLEK		LKAAHSYNPK		EFEWNLKSGR		VFIIKSYSED
DIHRSIKYSI		WCSTEHGNKR		LDSAFRCMSS		KGPVYLLFSV		NGSGHFCGVA
EMKSPVDYGT		SAGVWSQDKW		KGKFDVQWIF		VKDVPNNQLR		HIRLENNDNK
PVTNSRDTQE		VPLEKAKQVL		KIISSYKHTT		SIFDDFAHYE		KRQEEEEVVR
KERQSRNKQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20