YLPM1

YLPM1 (англ. YLP motif containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 951 амінокислот, а молекулярна маса — 219 985.

YLPM1
Ідентифікатори
Символи	YLPM1, C14orf170, PPP1R169, ZAP113, ZAP3, YLP motif containing 1
Зовнішні ІД	MGI: 1926195 HomoloGene: 87707 GeneCards: YLPM1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • Нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear speck Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0022610 життєдіяльність • regulation of telomere maintenance Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56252	56531
Ensembl	ENSG00000119596	ENSMUSG00000021244
UniProt	P49750	Q9R0I7
RefSeq (мРНК)	NM_019589	NM_178363 NM_001347421
RefSeq (білок)	NP_062535	NP_001334350 NP_848140
Локус (UCSC)	Хр. 14: 74.76 – 74.86 Mb	Хр. 12: 85.04 – 85.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYPNWGRYGG		SSHYPPPPVP		PPPPVALPEA		SPGPGYSSST		TPAAPSSSGF
MSFREQHLAQ		LQQLQQMHQK		QMQCVLQPHH		LPPPPLPPPP		VMPGGGYGDW
QPPPPPMPPP		PGPALSYQKQ		QQYKHQMLHH		QRDGPPGLVP		MELESPPESP
PVPPGSYMPP		SQSYMPPPQP		PPSYYPPTSS		QPYLPPAQPS		PSQSPPSQSY
LAPTPSYSSS		SSSSQSYLSH		SQSYLPSSQA		SPSRPSQGHS		KSQLLAPPPP
SAPPGNKTTV		QQEPLESGAK		NKSTEQQQAA		PEPDPSTMTP		QEQQQYWYRQ
HLLSLQQRTK		VHLPGHKKGP		VVAKDTPEPV		KEEVTVPATS		QVPESPSSEE
PPLPPPNEEV		PPPLPPEEPQ		SEDPEEDARL		KQLQAAAAHW		QQHQQHRVGF
QYQGIMQKHT		QLQQILQQYQ		QIIQPPPHIQ		ATTPPPGIPP		PGVPQGIPPQ
LTAAPVPPAS		SSQSSQVPEK		PRPALLPTPV		SFGSAPPTTY		HPPLQSAGPS
EQVNSKAPLS		KSALPYSSFS		SDQGLGESSA		APSQPITAVK		DMPVRSGGLL
PDPPRSSYLE		SPRGPRFDGP		RRFEDLGSRC		EGPRPKGPRF		EGNRPDGPRP
RYEGHPAEGT		KSKWGMIPRG		PASQFYITPS		TSLSPRQSGP		QWKGPKPAFG
QQHQQQPKSQ		AEPLSGNKEP		LADTSSNQQK		NFKMQSAAFS		IAADVKDVKA
AQSNENLSDS		QQEPPKSEVS		EGPVEPSNWD		QNVQSMETQI		DKAQAVTQPV
PLANKPVPAQ		STFPSKTGGM		EGGTAVATSS		LTADNDFKPV		GIGLPHSENN
QDKGLPRPDN		RDNRLEGNRG		NSSSYRGPGQ		SRMEDTRDKG		LVNRGRGQAI
SRGPGLVKQE		DFRDKMMGRR		EDSREKMNRG		EGSRDRGLVR		PGSSREKVPG
GLQGSQDRGA		AGSRERGPPR		RAGSQERGPL		RRAGSRERIP		PRRAGSRERG
PPRGPGSRER		GLGRSDFGRD		RGPFRPEPGD		GGEKMYPYHR		DEPPRAPWNH
GEERGHEEFP		LDGRNAPMER		ERLDDWDRER		YWRECERDYQ		DDTLELYNRE
DRFSAPPSRS		HDGDRRGPWW		DDWERDQDMD		EDYNREMERD		MDRDVDRISR
PMDMYDRSLD		NEWDRDYGRP		LDEQESQFRE		RDIPSLPPLP		PLPPLPPLDR
YRDDRWREER		NREHGYDRDF		RDRGELRIRE		YPERGDTWRE		KRDYVPDRMD
WERERLSDRW		YPSDVDRHSP		MAEHMPSSHH		SSEMMGSDAS		LDSDQGLGGV
MVLSQRQHEI		ILKAAQELKM		LREQKEQLQK		MKDFGSEPQM		ADHLPPQESR
LQNTSSRPGM		YPPPGSYRPP		PPMGKPPGSI		VRPSAPPARS		SVPVTRPPVP
IPPPPPPPPL		PPPPPVIKPQ		TSAVEQERWD		EDSFYGLWDT		NDEQGLNSEF
KSETAAIPSA		PVLPPPPVHS		SIPPPGPVPM		GMPPMSKPPP		VQQTVDYGHG
RDISTNKVEQ		IPYGERITLR		PDPLPERSTF		ETEHAGQRDR		YDRERDREPY
FDRQSNVIAD		HRDFKRDRET		HRDRDRDRGV		IDYDRDRFDR		ERRPRDDRAQ
SYRDKKDHSS		SRRGGFDRPS		YDRKSDRPVY		EGPSMFGGER		RTYPEERMPL
PAPSLSHQPP		PAPRVEKKPE		SKNVDDILKP		PGRESRPERI		VVIMRGLPGS
GKTHVAKLIR		DKEVEFGGPA		PRVLSLDDYF		ITEVEKEEKD		PDSGKKVKKK
VMEYEYEAEM		EETYRTSMFK		TFKKTLDDGF		FPFIILDAIN		DRVRHFDQFW
SAAKTKGFEV		YLAEMSADNQ		TCGKRNIHGR		KLKEINKMAD		HWETAPRHMM
RLDIRSLLQD		AAIEEVEMED		FDANIEEQKE		EKKDAEEEES		ELGYIPKSKW
EMDTSEAKLD		KLDGLRTGTK		RKRDWEAIAS		RMEDYLQLPD		DYDTRASEPG
KKRVRWADLE		EKKDADRKRA		IGFVVGQTDW		EKITDESGHL		AEKALNRTKY
I

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 14