Ku70

Ku70 (англ. X-ray repair cross complementing 6) – білок, який кодується геном XRCC6, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 609 амінокислот, а молекулярна маса — 69 843.

XRCC6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1JEQ, 1JEY, 1JJR, 3RZX
Ідентифікатори
Символи	XRCC6, X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6, CTC75, CTCBF, G22P1, KU70, ML8, TLAA, X-ray repair cross complementing 6
Зовнішні ІД	OMIM: 152690 MGI: 95606 HomoloGene: 37483 GeneCards: XRCC6
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • double-stranded telomeric DNA binding • telomeric DNA binding • GO:0008026 helicase activity • 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity • GO:0004003 DNA helicase activity • protein C-terminus binding • каталітична активність • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lyase activity • hydrolase activity • ATP binding • DNA binding • double-stranded DNA binding • damaged DNA binding • RNA binding • cyclin binding • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • гіалоплазма • nuclear telomere cap complex • мембрана • transcription regulator complex • хромосома • нуклеоплазма • nonhomologous end joining complex • клітинне ядро • Ku70:Ku80 complex • цитоплазма • extracellular region • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • protein-DNA complex • ядерце • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • double-strand break repair via classical nonhomologous end joining • protein heterotetramerization • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of smooth muscle cell proliferation • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • DNA ligation • establishment of integrated proviral latency • обмін речовин • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • double-strand break repair via nonhomologous end joining • telomere maintenance • positive regulation of type I interferon production • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • DNA duplex unwinding • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular hyperosmotic salinity response • brain development • DNA recombination • neutrophil degranulation • cellular response to gamma radiation • cellular response to X-ray • positive regulation of protein kinase activity • activation of innate immune response • процес імунної системи • вроджений імунітет Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2547	14375
Ensembl	ENSG00000196419	ENSMUSG00000022471
UniProt	P12956	P23475
RefSeq (мРНК)	NM_001469 NM_001288976 NM_001288977 NM_001288978	NM_010247
RefSeq (білок)	NP_001275905 NP_001275906 NP_001275907 NP_001460 NP_001275905.1 NP_001460.1	NP_034377
Локус (UCSC)	Хр. 22: 41.62 – 41.66 Mb	Хр. 15: 81.87 – 81.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGWESYYKT		EGDEEAEEEQ		EENLEASGDY		KYSGRDSLIF		LVDASKAMFE
SQSEDELTPF		DMSIQCIQSV		YISKIISSDR		DLLAVVFYGT		EKDKNSVNFK
NIYVLQELDN		PGAKRILELD		QFKGQQGQKR		FQDMMGHGSD		YSLSEVLWVC
ANLFSDVQFK		MSHKRIMLFT		NEDNPHGNDS		AKASRARTKA		GDLRDTGIFL
DLMHLKKPGG		FDISLFYRDI		ISIAEDEDLR		VHFEESSKLE		DLLRKVRAKE
TRKRALSRLK		LKLNKDIVIS		VGIYNLVQKA		LKPPPIKLYR		ETNEPVKTKT
RTFNTSTGGL		LLPSDTKRSQ		IYGSRQIILE		KEETEELKRF		DDPGLMLMGF
KPLVLLKKHH		YLRPSLFVYP		EESLVIGSST		LFSALLIKCL		EKEVAALCRY
TPRRNIPPYF		VALVPQEEEL		DDQKIQVTPP		GFQLVFLPFA		DDKRKMPFTE
KIMATPEQVG		KMKAIVEKLR		FTYRSDSFEN		PVLQQHFRNL		EALALDLMEP
EQAVDLTLPK		VEAMNKRLGS		LVDEFKELVY		PPDYNPEGKV		TKRKHDNEGS
GSKRPKVEYS		EEELKTHISK		GTLGKFTVPM		LKEACRAYGL		KSGLKKQELL
EALTKHFQD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, гідролаз, активаторів, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Griffith A.J., Craft J., Evans J., Mimori T., Hardin J.A. (1992). Nucleotide sequence and genomic structure analyses of the p70 subunit of the human Ku autoantigen: evidence for a family of genes encoding Ku (p70)-related polypeptides. Mol. Biol. Rep. 16: 91—97. PMID 1608402 DOI:10.1007/BF00419754
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Oderwald H., Hughes M.J., Jost J.-P. (1996). Non-histone protein 1 (NHP1) is a member of the Ku protein family which is upregulated in differentiating mouse myoblasts and human promyelocytes. FEBS Lett. 382: 313—318. PMID 8605992 DOI:10.1016/0014-5793(96)00189-5
• Jin S., Weaver D.T. (1997). Double-strand break repair by Ku70 requires heterodimerization with Ku80 and DNA binding functions. EMBO J. 16: 6874—6885. PMID 9362500 DOI:10.1093/emboj/16.22.6874
• West R.B., Yaneva M., Lieber M.R. (1998). Productive and nonproductive complexes of Ku and DNA-dependent protein kinase at DNA termini. Mol. Cell. Biol. 18: 5908—5920. PMID 9742108 DOI:10.1128/MCB.18.10.5908
• Chan D.W., Ye R., Veillette C.J., Lees-Miller S.P. (1999). DNA-dependent protein kinase phosphorylation sites in Ku 70/80 heterodimer. Biochemistry. 38: 1819—1828. PMID 10026262 DOI:10.1021/bi982584b

Див. також

• Хромосома 22