XPC

XPC
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2A4J, 2GGM, 2OBH, 2RVB
Ідентифікатори
Символи	XPC, RAD4, XP3, XPCC, p125, xeroderma pigmentosum, complementation group C, XPC complex subunit, DNA damage recognition and repair factor
Зовнішні ІД	OMIM: 613208 MGI: 103557 HomoloGene: 3401 GeneCards: XPC
Пов'язані генетичні захворювання
	xeroderma pigmentosum group C
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • heteroduplex DNA loop binding; • bubble DNA binding; • single-stranded DNA binding; • damaged DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинна мембрана; • нуклеоплазма; • XPC complex; • ядерце; • nucleotide-excision repair factor 2 complex; • клітинне ядро; • мітохондрія; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • nucleotide-excision repair complex;
Біологічний процес	• nucleotide-excision repair; • regulation of mitotic cell cycle phase transition; • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition; • mitotic intra-S DNA damage checkpoint signaling; • cellular response to DNA damage stimulus; • global genome nucleotide-excision repair; • response to auditory stimulus; • DNA mismatch repair; • response to UV-B; • UV-damage excision repair; • GO:0100026 Репарація ДНК; • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly; • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7508
	22591
	ENSG00000154767
	ENSMUSG00000030094
	Q01831
	P51612
	NM_001145769; NM_004628
	NM_009531
	NP_004619; NP_001341655; NP_001341656; NP_001341658; NP_001341659
	NP_033557
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

XPC (англ. XPC complex subunit, DNA damage recognition and repair factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 940 амінокислот, а молекулярна маса — 105 953^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARKRAAGGE	PRGRELRSQK	SKAKSKARRE	EEEEDAFEDE	KPPKKSLLSK
VSQGKRKRGC	SHPGGSADGP	AKKKVAKVTV	KSENLKVIKD	EALSDGDDLR
DFPSDLKKAH	HLKRGATMNE	DSNEEEEESE	NDWEEVEELS	EPVLGDVRES
TAFSRSLLPV	KPVEIEIETP	EQAKTRERSE	KIKLEFETYL	RRAMKRFNKG
VHEDTHKVHL	LCLLANGFYR	NNICSQPDLH	AIGLSIIPAR	FTRVLPRDVD
TYYLSNLVKW	FIGTFTVNAE	LSASEQDNLQ	TTLERRFAIY	SARDDEELVH
IFLLILRALQ	LLTRLVLSLQ	PIPLKSATAK	GKKPSKERLT	ADPGGSSETS
SQVLENHTKP	KTSKGTKQEE	TFAKGTCRPS	AKGKRNKGGR	KKRSKPSSSE
EDEGPGDKQE	KATQRRPHGR	ERRVASRVSY	KEESGSDEAG	SGSDFELSSG
EASDPSDEDS	EPGPPKQRKA	PAPQRTKAGS	KSASRTHRGS	HRKDPSLPAA
SSSSSSSKRG	KKMCSDGEKA	EKRSIAGIDQ	WLEVFCEQEE	KWVCVDCVHG
VVGQPLTCYK	YATKPMTYVV	GIDSDGWVRD	VTQRYDPVWM	TVTRKCRVDA
EWWAETLRPY	QSPFMDREKK	EDLEFQAKHM	DQPLPTAIGL	YKNHPLYALK
RHLLKYEAIY	PETAAILGYC	RGEAVYSRDC	VHTLHSRDTW	LKKARVVRLG
EVPYKMVKGF	SNRARKARLA	EPQLREENDL	GLFGYWQTEE	YQPPVAVDGK
VPRNEFGNVY	LFLPSMMPIG	CVQLNLPNLH	RVARKLDIDC	VQAITGFDFH
GGYSHPVTDG	YIVCEEFKDV	LLTAWENEQA	VIERKEKEKK	EKRALGNWKL
LAKGLLIRER	LKRRYGPKSE	AAAPHTDAGG	GLSSDEEEGT	SSQAEAARIL
AASWPQNRED	EEKQKLKGGP	KKTKREKKAA	ASHLFPFEQL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Legerski R.J., Peterson C.A. (1992). Expression cloning of a human DNA repair gene involved in Xeroderma pigmentosum group C. Nature. 359: 70—73. PMID 1522891 DOI:10.1038/359070a0
Legerski R.J., Peterson C.A. (1992). Nature. 360: 610—610. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 1461286 DOI:10.1038/360610b0
Batty D., Rapic'-Otrin V., Levine A.S., Wood R.D. (2000). Stable binding of human XPC complex to irradiated DNA confers strong discrimination for damaged sites. J. Mol. Biol. 300: 275—290. PMID 10873465 DOI:10.1006/jmbi.2000.3857
Sugasawa K., Shimizu Y., Iwai S., Hanaoka F. (2002). A molecular mechanism for DNA damage recognition by the xeroderma pigmentosum group C protein complex. DNA Repair. 1: 95—107. PMID 12509299 DOI:10.1016/S1568-7864(01)00008-8
Shimizu Y., Iwai S., Hanaoka F., Sugasawa K. (2003). Xeroderma pigmentosum group C protein interacts physically and functionally with thymine DNA glycosylase. EMBO J. 22: 164—173. PMID 12505994 DOI:10.1093/emboj/cdg016