XAB2

XAB2 (англ. XPA binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 855 амінокислот, а молекулярна маса — 100 010.

XAB2
Ідентифікатори
Символи	XAB2, HCNP, HCRN, NTC90, SYF1, XPA binding protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 610850 MGI: 1914689 HomoloGene: 5738 GeneCards: XAB2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • мембрана • нуклеоплазма • spliceosomal complex • клітинне ядро • Prp19 complex • prespliceosome • catalytic step 1 spliceosome • post-mRNA release spliceosomal complex • U2-type catalytic step 2 spliceosome Біологічний процес • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • mRNA processing • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • Сплайсинг РНК • cerebral cortex development • transcription-coupled nucleotide-excision repair • blastocyst development • GO:0100026 Репарація ДНК • mRNA splicing, via spliceosome • generation of catalytic spliceosome for first transesterification step Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56949	67439
Ensembl	ENSG00000076924	ENSMUSG00000019470
UniProt	Q9HCS7	Q9DCD2
RefSeq (мРНК)	NM_020196	NM_026156
RefSeq (білок)	NP_064581	NP_080432
Локус (UCSC)	Хр. 19: 7.62 – 7.63 Mb	Хр. 8: 3.66 – 3.67 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVVMARLSRP		ERPDLVFEEE		DLPYEEEIMR		NQFSVKCWLR		YIEFKQGAPK
PRLNQLYERA		LKLLPCSYKL		WYRYLKARRA		QVKHRCVTDP		AYEDVNNCHE
RAFVFMHKMP		RLWLDYCQFL		MDQGRVTHTR		RTFDRALRAL		PITQHSRIWP
LYLRFLRSHP		LPETAVRGYR		RFLKLSPESA		EEYIEYLKSS		DRLDEAAQRL
ATVVNDERFV		SKAGKSNYQL		WHELCDLISQ		NPDKVQSLNV		DAIIRGGLTR
FTDQLGKLWC		SLADYYIRSG		HFEKARDVYE		EAIRTVMTVR		DFTQVFDSYA
QFEESMIAAK		METASELGRE		EEDDVDLELR		LARFEQLISR		RPLLLNSVLL
RQNPHHVHEW		HKRVALHQGR		PREIINTYTE		AVQTVDPFKA		TGKPHTLWVA
FAKFYEDNGQ		LDDARVILEK		ATKVNFKQVD		DLASVWCQCG		ELELRHENYD
EALRLLRKAT		ALPARRAEYF		DGSEPVQNRV		YKSLKVWSML		ADLEESLGTF
QSTKAVYDRI		LDLRIATPQI		VINYAMFLEE		HKYFEESFKA		YERGISLFKW
PNVSDIWSTY		LTKFIARYGG		RKLERARDLF		EQALDGCPPK		YAKTLYLLYA
QLEEEWGLAR		HAMAVYERAT		RAVEPAQQYD		MFNIYIKRAA		EIYGVTHTRG
IYQKAIEVLS		DEHAREMCLR		FADMECKLGE		IDRARAIYSF		CSQICDPRTT
GAFWQTWKDF		EVRHGNEDTI		KEMLRIRRSV		QATYNTQVNF		MASQMLKVSG
SATGTVSDLA		PGQSGMDDMK		LLEQRAEQLA		AEAERDQPLR		AQSKILFVRS
DASREELAEL		AQQVNPEEIQ		LGEDEDEDEM		DLEPNEVRLE		QQSVPAAVFG
SLKED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Див. також

• Хромосома 19