WDR90

WDR90 (англ. WD repeat domain 90) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 748 амінокислот, а молекулярна маса — 187 437.

WDR90
Ідентифікатори
Символи	WDR90, C16orf15, C16orf16, C16orf17, C16orf18, C16orf19, WD repeat domain 90, POC16
Зовнішні ІД	OMIM: 618290 MGI: 1921267 HomoloGene: 27066 GeneCards: WDR90
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • Центріоль • цитоплазма • цитоскелет • GO:0035085 Аксонема • ciliary basal body Біологічний процес • cilium assembly • cell projection organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	197335	106618
Ensembl	ENSG00000161996	ENSMUSG00000073434
UniProt	Q96KV7	Q6ZPG2
RefSeq (мРНК)	NM_145294 NM_153239	NM_001163766 NM_134124
RefSeq (білок)	NP_660337	NP_001157238
Локус (UCSC)	Хр. 16: 0.65 – 0.67 Mb	Хр. 17: 26.06 – 26.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MARAWQHPFL		NVFRHFRVDE		WKRSAKQGDV		AVVTDKTLKG		AVYRIRGSVS
AANYIQLPKS		STQSLGLTGR		YLYVLFRPLP		SKHFVIHLDV		SSKDNQVIRV
SFSNLFKEFK		STATWLQFPL		VLEARTPQRD		LVGLAPSGAR		WTCLQLDLQD
VLLVYLNRCY		GHLKSIRLCA		SLLVRNLYTS		DLCFEPAISG		AQWAKLPVTP
MPREMAFPVP		KGESWHDRYI		HVRFPSESLK		VPSKPIEKSC		SPPEAVLLGP
GPQPLPCPVA		SSKPVRFSVS		PVVQTPSPTA		SGRAALAPRP		FPEVSLSQER
SDASNADGPG		FHSLEPWAQL		EASDIHTAAA		GTHVLTHESA		EVPVARTGSC
EGFLPDPVLR		LKGVIGFGGH		GTRQALWTPD		GAAVVYPCHA		VIVVLLVDTG
EQRFFLGHTD		KVSALALDGS		SSLLASAQAR		APSVMRLWDF		QTGRCLCLFR
SPMHVVCSLS		FSDSGALLCG		VGKDHHGRTM		VVAWGTGQVG		LGGEVVVLAK
AHTDFDVQAF		RVTFFDETRM		ASCGQGSVRL		WRLRGGVLRS		CPVDLGEHHA
LQFTDLAFKQ		ARDGCPEPSA		AMLFVCSRSG		HILEIDCQRM		VVRHARRLLP
TRTPGGPHPQ		KQTFSSGPGI		AISSLSVSPA		MCAVGSEDGF		LRLWPLDFSS
VLLEAEHEGP		VSSVCVSPDG		LRVLSATSSG		HLGFLDTLSR		VYHMLARSHT
APVLALAMEQ		RRGQLATVSQ		DRTVRIWDLA		TLQQLYDFTS		SEDAPCAVTF
HPTRPTFFCG		FSSGAVRSFS		LEAAEVLVEH		TCHRGAVTGL		TATPDGRLLF
SSCSQGSLAQ		YSCADPQWHV		LRVAADMVCP		DAPASPSALA		VSRDGRLLAF
VGPSRCTVTV		MGSASLDELL		RVDIGTLDLA		SSRLDSAMAV		CFGPAALGHL
LVSTSSNRVV		VLDAVSGRII		RELPGVHPEP		CPSLTLSEDA		RFLLIAAGRT
IKVWDYATQA		SPGPQVYIGH		SEPVQAVAFS		PDQQQVLSAG		DAVFLWDVLA
PTESDQSFPG		APPACKTGPG		AGPLEDAASR		ASELPRQQVP		KPCQASPPRL
GVCARPPEGG		DGARDTRNSG		APRTTYLASC		KAFTPARVSC		SPHSAKGTCP
PPASGGWLRL		KAVVGYSGNG		RANMVWRPDT		GFFAYTCGRL		VVVEDLHSGA
QQHWSGHSAE		ISTLALSHSA		QVLASASGRS		STTAHCQIRV		WDVSGGLCQH
LIFPHSTTVL		ALAFSPDDRL		LVTLGDHDGR		TLALWGTATY		DLVSSTRLPE
PVHGVAFNPW		DAGELTCVGQ		GTVTFWLLQQ		RGADISLQVR		REPVPEAVGA
GELTSLCYGA		PPLLYCGTSS		GQVCVWDTRA		GRCFLSWEAD		DGGIGLLLFS
GSRLVSGSST		GRLRLWAVGA		VSELRCKGSG		ASSVFMEHEL		VLDGAVVSAS
FDDSVDMGVV		GTTAGTLWFV		SWAEGTSTRL		ISGHRSKVNE		VVFSPGESHC
ATCSEDGSVR		VWALASMELV		IQFQVLNQSC		LCLAWSPPCC		GRPEQQRLAA
GYGDGSLRIF		SVSRTAMELK		MHPHPVALTT		VAFSTDGQTV		LSGDKDGLVA
VSHPCTGTTF		RVLSDHQGAP		ISTICVTCKE		CEDLGVEGTD		LWLAASGDQR
VSVWASDWLR		NHCELVDWLS		FPMPATTETQ		GHLPPSLAAF		CPWDGALLMY
VGPGVYKEVI		IYNLCQKQVV		EKIPLPFFAM		SLSLSPGTHL		LAVGFAECML
RLVDCAMGTA		QDFAGHDNAV		HLCRFTPSAR		LLFTAARNEI		LVWEVPGL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179

Див. також

• Хромосома 16