WDR1

WDR1 (англ. WD repeat domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 606 амінокислот, а молекулярна маса — 66 194.

WDR1
Ідентифікатори
Символи	WDR1, AIP1, HEL-S-52, NORI-1, WD repeat domain 1, PFITS
Зовнішні ІД	OMIM: 604734 MGI: 1337100 HomoloGene: 6628 GeneCards: WDR1
Онтологія гена Молекулярна функція • actin binding • actin filament binding Клітинна компонента • extracellular region • myelin sheath • podosome • міжклітинні контакти • cell projection • екзосома • цитоскелет • мікрофіламент • cell-cell junction • цитоплазма • гіалоплазма • cortical actin cytoskeleton • клітинна мембрана Біологічний процес • platelet degranulation • слух • actin cytoskeleton organization • regulation of ventricular cardiac muscle cell membrane repolarization • regulation of oligodendrocyte differentiation • maintenance of epithelial cell apical/basal polarity • apical junction assembly • regulation of actin filament depolymerization • neutrophil mediated immunity • regulation of cell shape • actin filament fragmentation • Тромбоцитопоез • positive regulation of actin filament depolymerization • cortical cytoskeleton organization • locomotion • establishment of planar polarity of follicular epithelium • sarcomere organization • neutrophil migration • actin filament depolymerization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9948	22388
Ensembl	ENSG00000071127	ENSMUSG00000005103
UniProt	O75083	O88342
RefSeq (мРНК)	NM_005112 NM_017491	NM_011715
RefSeq (білок)	NP_005103 NP_059830	NP_035845
Локус (UCSC)	Хр. 4: 10.07 – 10.12 Mb	Хр. 5: 38.68 – 38.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPYEIKKVFA		SLPQVERGVS		KIIGGDPKGN		NFLYTNGKCV		ILRNIDNPAL
ADIYTEHAHQ		VVVAKYAPSG		FYIASGDVSG		KLRIWDTTQK		EHLLKYEYQP
FAGKIKDIAW		TEDSKRIAVV		GEGREKFGAV		FLWDSGSSVG		EITGHNKVIN
SVDIKQSRPY		RLATGSDDNC		AAFFEGPPFK		FKFTIGDHSR		FVNCVRFSPD
GNRFATASAD		GQIYIYDGKT		GEKVCALGGS		KAHDGGIYAI		SWSPDSTHLL
SASGDKTSKI		WDVSVNSVVS		TFPMGSTVLD		QQLGCLWQKD		HLLSVSLSGY
INYLDRNNPS		KPLHVIKGHS		KSIQCLTVHK		NGGKSYIYSG		SHDGHINYWD
SETGENDSFA		GKGHTNQVSR		MTVDESGQLI		SCSMDDTVRY		TSLMLRDYSG
QGVVKLDVQP		KCVAVGPGGY		AVVVCIGQIV		LLKDQRKCFS		IDNPGYEPEV
VAVHPGGDTV		AIGGVDGNVR		LYSILGTTLK		DEGKLLEAKG		PVTDVAYSHD
GAFLAVCDAS		KVVTVFSVAD		GYSENNVFYG		HHAKIVCLAW		SPDNEHFASG
GMDMMVYVWT		LSDPETRVKI		QDAHRLHHVS		SLAWLDEHTL		VTTSHDASVK
EWTITY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

• Adler H.J., Winnicki R.S., Gong T.-W.L., Lomax M.I. (1999). A gene upregulated in the acoustically damaged chick basilar papilla encodes a novel WD40 repeat protein. Genomics. 56: 59—69. PMID 10036186 DOI:10.1006/geno.1998.5672
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cervero P., Himmel M., Kruger M., Linder S. (2012). Proteomic analysis of podosome fractions from macrophages reveals similarities to spreading initiation centres. Eur. J. Cell Biol. 91: 908—922. PMID 22721921 DOI:10.1016/j.ejcb.2012.05.005
• Lechuga S., Baranwal S., Ivanov A.I. (2015). Actin-interacting protein 1 controls assembly and permeability of intestinal epithelial apical junctions. Am. J. Physiol. 308: G745—G756. PMID 25792565 DOI:10.1152/ajpgi.00446.2014

Див. також

• Хромосома 4