VPS18
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
VPS18 (англ. VPS18, CORVET/HOPS core subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 973 амінокислот, а молекулярна маса — 110 186[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MASILDEYEN | SLSRSAVLQP | GCPSVGIPHS | GYVNAQLEKE | VPIFTKQRID | ||||
FTPSERITSL | VVSSNQLCMS | LGKDTLLRID | LGKANEPNHV | ELGRKDDAKV | ||||
HKMFLDHTGS | HLLIALSSTE | VLYVNRNGQK | VRPLARWKGQ | LVESVGWNKA | ||||
LGTESSTGPI | LVGTAQGHIF | EAELSASEGG | LFGPAPDLYF | RPLYVLNEEG | ||||
GPAPVCSLEA | ERGPDGRSFV | IATTRQRLFQ | FIGRAAEGAE | AQGFSGLFAA | ||||
YTDHPPPFRE | FPSNLGYSEL | AFYTPKLRSA | PRAFAWMMGD | GVLYGALDCG | ||||
RPDSLLSEER | VWEYPEGVGP | GASPPLAIVL | TQFHFLLLLA | DRVEAVCTLT | ||||
GQVVLRDHFL | EKFGPLKHMV | KDSSTGQLWA | YTERAVFRYH | VQREARDVWR | ||||
TYLDMNRFDL | AKEYCRERPD | CLDTVLAREA | DFCFRQRRYL | ESARCYALTQ | ||||
SYFEEIALKF | LEARQEEALA | EFLQRKLASL | KPAERTQATL | LTTWLTELYL | ||||
SRLGALQGDP | EALTLYRETK | ECFRTFLSSP | RHKEWLFASR | ASIHELLASH | ||||
GDTEHMVYFA | VIMQDYERVV | AYHCQHEAYE | EALAVLARHR | DPQLFYKFSP | ||||
ILIRHIPRQL | VDAWIEMGSR | LDARQLIPAL | VNYSQGGEVQ | QVSQAIRYME | ||||
FCVNVLGETE | QAIHNYLLSL | YARGRPDSLL | AYLEQAGASP | HRVHYDLKYA | ||||
LRLCAEHGHH | RACVHVYKVL | ELYEEAVDLA | LQVDVDLAKQ | CADLPEEDEE | ||||
LRKKLWLKIA | RHVVQEEEDV | QTAMACLASC | PLLKIEDVLP | FFPDFVTIDH | ||||
FKEAICSSLK | AYNHHIQELQ | REMEEATASA | QRIRRDLQEL | RGRYGTVEPQ | ||||
DKCATCDFPL | LNRPFYLFLC | GHMFHADCLL | QAVRPGLPAY | KQARLEELQR | ||||
KLGAAPPPAK | GSARAKEAEG | GAATAGPSRE | QLKADLDELV | AAECVYCGEL | ||||
MIRSIDRPFI | DPQRYEEEQL | SWL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, автофагія, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.
Література
ред.- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Poteryaev D., Datta S., Ackema K., Zerial M., Spang A. (2010). Identification of the switch in early-to-late endosome transition. Cell. 141: 497—508. PMID 20434987 DOI:10.1016/j.cell.2010.03.011
- Solinger J.A., Spang A. (2013). Tethering complexes in the endocytic pathway: CORVET and HOPS. FEBS J. 280: 2743—2757. PMID 23351085 DOI:10.1111/febs.12151
- Wartosch L., Guenesdogan U., Graham S.C., Luzio J.P. (2015). Recruitment of VPS33A to HOPS by VPS16 Is Required for Lysosome Fusion with Endosomes and Autophagosomes. Traffic. 16: 727—742. PMID 25783203 DOI:10.1111/tra.12283
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15972 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9P253 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
ред.На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |