VIRMA
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
VIRMA (англ. Vir like m6A methyltransferase associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 812 амінокислот, а молекулярна маса — 202 025[4].
VIRMA | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | VIRMA, fSAP121, MSTP054, KIAA1429, vir like m6A methyltransferase associated | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 616447 MGI: 1913435 HomoloGene: 41043 GeneCards: VIRMA | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 8: 94.49 – 94.55 Mb | Хр. 4: 11.49 – 11.55 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAVDSAMELL | FLDTFKHPSA | EQSSHIDVVR | FPCVVYINEV | RVIPPGVRAH | ||||
SSLPDNRAYG | ETSPHTFQLD | LFFNNVSKPS | APVFDRLGSL | EYDENTSIIF | ||||
RPNSKVNTDG | LVLRGWYNCL | TLAIYGSVDR | VISHDRDSPP | PPPPPPPPPQ | ||||
PQPSLKRNPK | HADGEKEDQF | NGSPPRPQPR | GPRTPPGPPP | PDDDEDDPVP | ||||
LPVSGDKEED | APHREDYFEP | ISPDRNSVPQ | EGQYSDEGEV | EEEQQEEGEE | ||||
DEDDVDVEEE | EDEDEDDRRT | VDSIPEEEEE | DEEEEGEEDE | EGEGDDGYEQ | ||||
ISSDEDGIAD | LERETFKYPN | FDVEYTAEDL | ASVPPMTYDP | YDRELVPLLY | ||||
FSCPYKTTFE | IEISRMKDQG | PDKENSGAIE | ASVKLTELLD | LYREDRGAKW | ||||
VTALEEIPSL | IIKGLSYLQL | KNTKQDSLGQ | LVDWTMQALN | LQVALRQPIA | ||||
LNVRQLKAGT | KLVSSLAECG | AQGVTGLLQA | GVISGLFELL | FADHVSSSLK | ||||
LNAFKALDSV | ISMTEGMEAF | LRGRQNEKSG | YQKLLELILL | DQTVRVVTAG | ||||
SAILQKCHFY | EVLSEIKRLG | DHLAEKTSSL | PNHSEPDHDT | DAGLERTNPE | ||||
YENEVEASMD | MDLLESSNIS | EGEIERLINL | LEEVFHLMET | APHTMIQQPV | ||||
KSFPTMARIT | GPPERDDPYP | VLFRYLHSHH | FLELVTLLLS | IPVTSAHPGV | ||||
LQATKDVLKF | LAQSQKGLLF | FMSEYEATNL | LIRALCHFYD | QDEEEGLQSD | ||||
GVIDDAFALW | LQDSTQTLQC | ITELFSHFQR | CTASEETDHS | DLLGTLHNLY | ||||
LITFNPVGRS | AVGHVFSLEK | NLQSLITLME | YYSKEALGDS | KSKKSVAYNY | ||||
ACILILVVVQ | SSSDVQMLEQ | HAASLLKLCK | ADENNAKLQE | LGKWLEPLKN | ||||
LRFEINCIPN | LIEYVKQNID | NLMTPEGVGL | TTALRVLCNV | ACPPPPVEGQ | ||||
QKDLKWNLAV | IQLFSAEGMD | TFIRVLQKLN | SILTQPWRLH | VNMGTTLHRV | ||||
TTISMARCTL | TLLKTMLTEL | LRGGSFEFKD | MRVPSALVTL | HMLLCSIPLS | ||||
GRLDSDEQKI | QNDIIDILLT | FTQGVNEKLT | ISEETLANNT | WSLMLKEVLS | ||||
SILKVPEGFF | SGLILLSELL | PLPLPMQTTQ | VIEPHDISVA | LNTRKLWSMH | ||||
LHVQAKLLQE | IVRSFSGTTC | QPIQHMLRRI | CVQLCDLASP | TALLIMRTVL | ||||
DLIVEDLQST | SEDKEKQYTS | QTTRLLALLD | ALASHKACKL | AILHLINGTI | ||||
KGDERYAEIF | QDLLALVRSP | GDSVIRQQCV | EYVTSILQSL | CDQDIALILP | ||||
SSSEGSISEL | EQLSNSLPNK | ELMTSICDCL | LATLANSESS | YNCLLTCVRT | ||||
MMFLAEHDYG | LFHLKSSLRK | NSSALHSLLK | RVVSTFSKDT | GELASSFLEF | ||||
MRQILNSDTI | GCCGDDNGLM | EVEGAHTSRT | MSINAAELKQ | LLQSKEESPE | ||||
NLFLELEKLV | LEHSKDDDNL | DSLLDSVVGL | KQMLESSGDP | LPLSDQDVEP | ||||
VLSAPESLQN | LFNNRTAYVL | ADVMDDQLKS | MWFTPFQAEE | IDTDLDLVKV | ||||
DLIELSEKCC | SDFDLHSELE | RSFLSEPSSP | GRTKTTKGFK | LGKHKHETFI | ||||
TSSGKSEYIE | PAKRAHVVPP | PRGRGRGGFG | QGIRPHDIFR | QRKQNTSRPP | ||||
SMHVDDFVAA | ESKEVVPQDG | IPPPKRPLKV | SQKISSRGGF | SGNRGGRGAF | ||||
HSQNRFFTPP | ASKGNYSRRE | GTRGSSWSAQ | NTPRGNYNES | RGGQSNFNRG | ||||
PLPPLRPLSS | TGYRPSPRDR | ASRGRGGLGP | SWASANSGSG | GSRGKFVSGG | ||||
SGRGRHVRSF | TR |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, метилювання. Локалізований у ядрі.
Література
ред.- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Niessen M., Schneiter R., Nothiger R. (2001). Molecular identification of virilizer, a gene required for the expression of the sex-determining gene Sex-lethal in Drosophila melanogaster. Genetics. 157: 679—688. PMID 11156988
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24500 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q69YN4 (англ.) . Архів оригіналу за 7 грудня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |