UPF3B
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
UPF3B (англ. UPF3B, regulator of nonsense mediated mRNA decay) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 483 амінокислот, а молекулярна маса — 57 762[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MKEEKEHRPK | EKRVTLLTPA | GATGSGGGTS | GDSSKGEDKQ | DRNKEKKEAL | ||||
SKVVIRRLPP | TLTKEQLQEH | LQPMPEHDYF | EFFSNDTSLY | PHMYARAYIN | ||||
FKNQEDIILF | RDRFDGYVFL | DNKGQEYPAI | VEFAPFQKAA | KKKTKKRDTK | ||||
VGTIDDDPEY | RKFLESYATD | NEKMTSTPET | LLEEIEAKNR | ELIAKKTTPL | ||||
LSFLKNKQRM | REEKREERRR | REIERKRQRE | EERRKWKEEE | KRKRKDIEKL | ||||
KKIDRIPERD | KLKDEPKIKV | HRFLLQAVNQ | KNLLKKPEKG | DEKELDKREK | ||||
AKKLDKENLS | DERASGQSCT | LPKRSDSELK | DEKPKRPEDE | SGRDYRERER | ||||
EYERDQERIL | RERERLKRQE | EERRRQKERY | EKEKTFKRKE | EEMKKEKDTL | ||||
RDKGKKAEST | ESIGSSEKTE | KKEEVVKRDR | IRNKDRPAMQ | LYQPGARSRN | ||||
RLCPPDDSTK | SGDSAAERKQ | ESGISHRKEG | GEE |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
ред.- Lykke-Andersen J., Shu M.-D., Steitz J.A. (2000). Human Upf proteins target an mRNA for nonsense-mediated decay when bound downstream of a termination codon. Cell. 103: 1121—1131. PMID 11163187 DOI:10.1016/S0092-8674(00)00214-2
- Serin G., Gersappe A., Black J.D., Aronoff R., Maquat L.E. (2001). Identification and characterization of human orthologues to Saccharomyces cerevisiae Upf2 protein and Upf3 protein (Caenorhabditis elegans SMG-4). Mol. Cell. Biol. 21: 209—223. PMID 11113196 DOI:10.1128/MCB.21.1.209-223.2001
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kim V.N., Kataoka N., Dreyfuss G. (2001). Role of the nonsense-mediated decay factor hUpf3 in the splicing-dependent exon-exon junction complex. Science. 293: 1832—1836. PMID 11546873 DOI:10.1126/science.1062829
- Lykke-Andersen J., Shu M.-D., Steitz J.A. (2001). Communication of the position of exon-exon junctions to the mRNA surveillance machinery by the protein RNPS1. Science. 293: 1836—1839. PMID 11546874 DOI:10.1126/science.1062786
- Gehring N.H., Neu-Yilik G., Schell T., Hentze M.W., Kulozik A.E. (2003). Y14 and hUpf3b form an NMD-activating complex. Mol. Cell. 11: 939—949. PMID 12718880 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00142-4
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20439 (англ.) . Процитовано 13 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9BZI7 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |