UIMC1

UIMC1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2MKF, 2MKG, 2RR9, 2N9E
Ідентифікатори
Символи	UIMC1, RAP80, X2HRIP110, ubiquitin interaction motif containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609433 MGI: 103185 HomoloGene: 9455 GeneCards: UIMC1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0031493 histone binding; • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• BRCA1-A complex; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • ядерні тільця;
Біологічний процес	• response to ionizing radiation; • GO:1900404 positive regulation of DNA repair; • histone H2A K63-linked deubiquitination; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • double-strand break repair via nonhomologous end joining; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • cellular response to DNA damage stimulus; • double-strand break repair; • GO:0100026 Репарація ДНК; • protein deubiquitination; • mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	51720
	20184
	ENSG00000087206
	ENSMUSG00000025878
	Q96RL1
	Q5U5Q9
	NM_001199297; NM_001199298; NM_016290; NM_001317961
	NM_001293660; NM_011307; NM_001359757; NM_001359758
	NP_001186226; NP_001186227; NP_001304890; NP_057374
	NP_001280589; NP_035437; NP_001346686; NP_001346687
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

UIMC1 (англ. Ubiquitin interaction motif containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 719 амінокислот, а молекулярна маса — 79 727^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPRRKKKVKE	VSESRNLEKK	DVETTSSVSV	KRKRRLEDAF	IVISDSDGEE
PKEENGLQKT	KTKQSNRAKC	LAKRKIAQMT	EEEQFALALK	MSEQEAREVN
SQEEEEEELL	RKAIAESLNS	CRPSDASATR	SRPLATGPSS	QSHQEKTTDS
GLTEGIWQLV	PPSLFKGSHI	SQGNEAEERE	EPWDHTEKTE	EEPVSGSSGS
WDQSSQPVFE	NVNVKSFDRC	TGHSAEHTQC	GKPQESTGRG	SAFLKAVQGS
GDTSRHCLPT	LADAKGLQDT	GGTVNYFWGI	PFCPDGVDPN	QYTKVILCQL
EVYQKSLKMA	QRQLLNKKGF	GEPVLPRPPS	LIQNECGQGE	QASEKNECIS
EDMGDEDKEE	RQESRASDWH	SKTKDFQESS	IKSLKEKLLL	EEEPTTSHGQ
SSQGIVEETS	EEGNSVPASQ	SVAALTSKRS	LVLMPESSAE	EITVCPETQL
SSSETFDLER	EVSPGSRDIL	DGVRIIMADK	EVGNKEDAEK	EVAISTFSSS
NQVSCPLCDQ	CFPPTKIERH	AMYCNGLMEE	DTVLTRRQKE	AKTKSDSGTA
AQTSLDIDKN	EKCYLCKSLV	PFREYQCHVD	SCLQLAKADQ	GDGPEGSGRA
CSTVEGKWQQ	RLKNPKEKGH	SEGRLLSFLE	QSEHKTSDAD	IKSSETGAFR
VPSPGMEEAG	CSREMQSSFT	RRDLNESPVK	SFVSISEATD	CLVDFKKQVT
VQPGSRTRTK	AGRGRRRKF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у ядрі.

Література

Yan Z., Kim Y.-S., Jetten A.M. (2002). RAP80: a novel nuclear protein that interacts with the retinoid-related testis-associated receptor. J. Biol. Chem. 277: 32379—32388. PMID 12080054 DOI:10.1074/jbc.M203475200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yan J., Yang X.-P., Kim Y.-S., Joo J.H., Jetten A.M. (2007). RAP80 interacts with the SUMO-conjugating enzyme UBC9 and is a novel target for sumoylation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 362: 132—138. PMID 17698038 DOI:10.1016/j.bbrc.2007.07.158
Liu Z., Wu J., Yu X. (2007). CCDC98 targets BRCA1 to DNA damage sites. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 716—720. PMID 17643121 DOI:10.1038/nsmb1279
Kim H., Huang J., Chen J. (2007). CCDC98 is a BRCA1-BRCT domain-binding protein involved in the DNA damage response. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 710—715. PMID 17643122 DOI:10.1038/nsmb1277
Wang B., Elledge S.J. (2007). Ubc13/Rnf8 ubiquitin ligases control foci formation of the Rap80/Abraxas/Brca1/Brcc36 complex in response to DNA damage. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 20759—20763. PMID 18077395 DOI:10.1073/pnas.0710061104

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30298 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96RL1 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30298 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q96RL1 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]