UBC (ген)

UBC (англ. Ubiquitin C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 685 амінокислот, а молекулярна маса — 77 039.

UBC
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1C3T, 1CMX, 1D3Z, 1F9J, 1FXT, 1G6J, 1GJZ, 1NBF, 1OGW, 1Q5W, 1S1Q, 1SIF, 1TBE, 1UBI, 1UBQ, 1UD7, 1XD3, 1XQQ, 1YX5, 1YX6, 1ZGU, 2AYO, 2BGF, 2DEN, 2FUH, 2G45, 2GBJ, 2GBK, 2GBM, 2GBN, 2GBR, 2GMI, 2HTH, 2IBI, 2J7Q, 2JF5, 2JRI, 2JY6, 2JZZ, 2K25, 2K6D, 2K8B, 2K8C, 2KDF, 2KJH, 2KLG, 2KN5, 2KX0, 2L3Z, 2LD9, 2LVO, 2LVP, 2LVQ, 2LZ6, 2MBO, 2MBQ, 2MCN, 2MI8, 2MJ5, 2MOR, 2MRE, 2MWS, 2N2K, 2NR2, 2O6V, 2OJR, 2PE9, 2PEA, 2RR9, 2RU6, 2W9N, 2WDT, 2XEW, 2Z59, 2ZCB, 2ZVN, 2ZVO, 3A33, 3ALB, 3AUL, 3B08, 3B0A, 3BY4, 3C0R, 3DVG, 3DVN, 3EEC, 3EFU, 3EHV, 3H7P, 3H7S, 3HM3, 3IFW, 3IHP, 3JSV, 3JVZ, 3JW0, 3K9O, 3K9P, 3KVF, 3KW5, 3LDZ, 3MHS, 3MTN, 3N30, 3N32, 3N3K, 3NS8, 3O65, 3OFI, 3OJ4, 3ONS, 3PRM, 3PT2, 3PTF, 3Q3F, 3RUL, 3TMP, 3U30, 3UGB, 3V6C, 3V6E, 3VFK, 3VUW, 3VUX, 3VUY, 3WXE, 3WXF, 3ZNI, 3ZNZ, 4AUQ, 4BOS, 4BOZ, 4BVU, 4DDG, 4DDI, 4DHJ, 4DHZ, 4FJV, 4HK2, 4HXD, 4I6L, 4I6N, 4IG7, 4IUM, 4JQW, 4K1R, 4K7S, 4K7U, 4K7W, 4KSK, 4KSL, 4LCD, 4LDT, 4MDK, 4MM3, 4MSM, 4MSQ, 4NQK, 4UN2, 4V3K, 4V3L, 5AIU, 4XOK, 5AF6, 5AF5, 5AF4, 4XOL, 5C7J, 5C7M, 5E6J, 4ZQS, 4AP4,%%s4AP4
Ідентифікатори
Символи	UBC, HMG20, Ubiquitin C
Зовнішні ІД	OMIM: 191340 MGI: 98889 HomoloGene: 128418 GeneCards: UBC
Онтологія гена Молекулярна функція • protease binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • protein tag • ubiquitin protein ligase binding Клітинна компонента • цитоплазма • endocytic vesicle membrane • гіалоплазма • клітинне ядро • екзосома • клітинна мембрана • нуклеоплазма • endosome membrane • міжклітинний простір • мітохондріальна зовнішня мембрана • endoplasmic reticulum quality control compartment • везикула • endoplasmic reticulum membrane • host cell Біологічний процес • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • interstrand cross-link repair • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • regulation of type I interferon production • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • Fc-epsilon receptor signaling pathway • endosomal transport • global genome nucleotide-excision repair • NIK/NF-kappaB signaling • G2/M transition of mitotic cell cycle • stress-activated MAPK cascade • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • macroautophagy • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • nucleotide-excision repair, DNA gap filling • error-free translesion synthesis • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • JNK cascade • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • nucleotide-excision repair, DNA incision • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • вроджений імунітет • Сигнальний шлях Notch • regulation of mRNA stability • protein polyubiquitination • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • virion assembly • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • negative regulation of type I interferon production • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway • GO:0046795 intracellular transport of virus • GO:0019067 viral life cycle • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • error-prone translesion synthesis • MAPK cascade • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • ion transmembrane transport • glycogen biosynthetic process • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • translesion synthesis • transcription-coupled nucleotide-excision repair • T cell receptor signaling pathway • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • Wnt signaling pathway • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding • regulation of signal transduction by p53 class mediator • ERBB2 signaling pathway • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • згортання білків • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • Убіквітин-залежний протеоліз • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • entry of bacterium into host cell • трансмембранний транспорт • regulation of necroptotic process • membrane organization • endoplasmic reticulum mannose trimming • cellular iron ion homeostasis • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • protein targeting to peroxisome • cytokine-mediated signaling pathway • modification-dependent protein catabolic process • interleukin-1-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7316	22190
Ensembl	ENSG00000150991	ENSMUSG00000008348
UniProt	P0CG48	P0CG50
RefSeq (мРНК)	NM_021009	NM_019639
RefSeq (білок)	NP_066289	NP_062613
Локус (UCSC)	Хр. 12: 124.91 – 124.92 Mb	Хр. 5: 125.46 – 125.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQIFVKTLTG		KTITLEVEPS		DTIENVKAKI		QDKEGIPPDQ		QRLIFAGKQL
EDGRTLSDYN		IQKESTLHLV		LRLRGGMQIF		VKTLTGKTIT		LEVEPSDTIE
NVKAKIQDKE		GIPPDQQRLI		FAGKQLEDGR		TLSDYNIQKE		STLHLVLRLR
GGMQIFVKTL		TGKTITLEVE		PSDTIENVKA		KIQDKEGIPP		DQQRLIFAGK
QLEDGRTLSD		YNIQKESTLH		LVLRLRGGMQ		IFVKTLTGKT		ITLEVEPSDT
IENVKAKIQD		KEGIPPDQQR		LIFAGKQLED		GRTLSDYNIQ		KESTLHLVLR
LRGGMQIFVK		TLTGKTITLE		VEPSDTIENV		KAKIQDKEGI		PPDQQRLIFA
GKQLEDGRTL		SDYNIQKEST		LHLVLRLRGG		MQIFVKTLTG		KTITLEVEPS
DTIENVKAKI		QDKEGIPPDQ		QRLIFAGKQL		EDGRTLSDYN		IQKESTLHLV
LRLRGGMQIF		VKTLTGKTIT		LEVEPSDTIE		NVKAKIQDKE		GIPPDQQRLI
FAGKQLEDGR		TLSDYNIQKE		STLHLVLRLR		GGMQIFVKTL		TGKTITLEVE
PSDTIENVKA		KIQDKEGIPP		DQQRLIFAGK		QLEDGRTLSD		YNIQKESTLH
LVLRLRGGMQ		IFVKTLTGKT		ITLEVEPSDT		IENVKAKIQD		KEGIPPDQQR
LIFAGKQLED		GRTLSDYNIQ		KESTLHLVLR		LRGGV

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Schlesinger D.H., Goldstein G. (1975). Molecular conservation of 74 amino acid sequence of ubiquitin between cattle and man. Nature. 255: 423—424. PMID 1128706 DOI:10.1038/255423a0
• Einspanier R., Sharma H.S., Scheit K.H. (1987). Cloning and sequence analysis of a cDNA encoding poly-ubiquitin in human ovarian granulosa cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 147: 581—587. PMID 2820408 DOI:10.1016/0006-291X(87)90970-3
• Huang F., Kirkpatrick D., Jiang X., Gygi S.P., Sorkin A. (2006). Differential regulation of EGF receptor internalization and degradation by multiubiquitination within the kinase domain. Mol. Cell. 21: 737—748. PMID 16543144 DOI:10.1016/j.molcel.2006.02.018
• Okumura F., Hatakeyama S., Matsumoto M., Kamura T., Nakayama K. (2004). Functional regulation of FEZ1 by the U-box-type ubiquitin ligase E4B contributes to neuritogenesis. J. Biol. Chem. 279: 53533—53543. PMID 15466860 DOI:10.1074/jbc.M402916200
• Komander D. (2009). The emerging complexity of protein ubiquitination. Biochem. Soc. Trans. 37: 937—953. PMID 19754430 DOI:10.1042/BST0370937

Див. також

• Хромосома 12