TYMP

TYMP (англ. Thymidine phosphorylase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 482 амінокислот, а молекулярна маса — 49 955.

TYMP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UOU, 2J0F, 2WK5, 2WK6
Ідентифікатори
Символи	TYMP, thymidine phosphorylase, ECGF, ECGF1, MEDPS1, MNGIE, MTDPS1, PDECGF, TP, hPD-ECGF
Зовнішні ІД	OMIM: 131222 MGI: 1920212 HomoloGene: 1474 GeneCards: TYMP
Пов'язані генетичні захворювання
mitochondrial DNA depletion syndrome 1, mitochondrial neurogastrointestinal encephalomyopathy
Реагує на сполуку
Типірацил
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • glycosyltransferase activity • pyrimidine-nucleoside phosphorylase activity • growth factor activity • pentosyltransferase activity • 1,4-alpha-oligoglucan phosphorylase activity • thymidine phosphorylase activity • protein homodimerization activity Клітинна компонента • гіалоплазма Біологічний процес • диференціація клітин • pyrimidine nucleoside salvage • pyrimidine nucleoside catabolic process • multicellular organism development • хемотаксис • Ангіогенез • обмін речовин • pyrimidine nucleobase metabolic process • mitochondrial genome maintenance • pyrimidine nucleoside metabolic process • regulation of myelination • regulation of transmission of nerve impulse • regulation of gastric motility • regulation of signaling receptor activity • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1890	72962
Ensembl	ENSG00000025708	ENSMUSG00000022615
UniProt	P19971	Q99N42
RefSeq (мРНК)	NM_001953 NM_001113755 NM_001113756 NM_001257988 NM_001257989	NM_138302 NM_028405
RefSeq (білок)	NP_001107227 NP_001107228 NP_001244917 NP_001244918 NP_001944	NP_612175
Локус (UCSC)	Хр. 22: 50.53 – 50.53 Mb	Хр. 15: 89.26 – 89.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAALMTPGTG		APPAPGDFSG		EGSQGLPDPS		PEPKQLPELI		RMKRDGGRLS
EADIRGFVAA		VVNGSAQGAQ		IGAMLMAIRL		RGMDLEETSV		LTQALAQSGQ
QLEWPEAWRQ		QLVDKHSTGG		VGDKVSLVLA		PALAACGCKV		PMISGRGLGH
TGGTLDKLES		IPGFNVIQSP		EQMQVLLDQA		GCCIVGQSEQ		LVPADGILYA
ARDVTATVDS		LPLITASILS		KKLVEGLSAL		VVDVKFGGAA		VFPNQEQARE
LAKTLVGVGA		SLGLRVAAAL		TAMDKPLGRC		VGHALEVEEA		LLCMDGAGPP
DLRDLVTTLG		GALLWLSGHA		GTQAQGAARV		AAALDDGSAL		GRFERMLAAQ
GVDPGLARAL		CSGSPAERRQ		LLPRAREQEE		LLAPADGTVE		LVRALPLALV
LHELGAGRSR		AGEPLRLGVG		AELLVDVGQR		LRRGTPWLRV		HRDGPALSGP
QSRALQEALV		LSDRAPFAAP		SPFAELVLPP		QQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз, факторів росту, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ангіогенез, хемотаксис, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг.

Література

• Finnis C., Goodey A., Courtney M., Sleep D. (1992). Expression of recombinant platelet-derived endothelial cell growth factor in the yeast Saccharomyces cerevisiae. Yeast. 8: 57—60. PMID 1580101 DOI:10.1002/yea.320080106
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nishino I., Spinazzola A., Hirano M. (1999). Thymidine phosphorylase gene mutations in MNGIE, a human mitochondrial disorder. Science. 283: 689—692. PMID 9924029 DOI:10.1126/science.283.5402.689

Див. також

• Хромосома 22