TRIOBP

TRIOBP
Ідентифікатори
Символи	TRIOBP, DFNB28, TAP68, TARA, dJ37E16.4, HRIHFB2122, TRIO and F-actin binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 609761 MGI: 1349410 HomoloGene: 5104 GeneCards: TRIOBP
Пов'язані генетичні захворювання
	autosomal recessive nonsyndromic deafness 28
Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin filament binding; • actin binding; • ubiquitin protein ligase binding; • myosin II binding;
Клітинна компонента	• focal adhesion; • центр організації мікротрубочок; • клітинне ядро; • цитоскелет; • midbody; • actin cytoskeleton; • цитоплазма;
Біологічний процес	• barbed-end actin filament capping; • regulation of actin cytoskeleton organization; • клітинний цикл; • поділ клітини; • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading; • actin modification; • sensory perception of sound; • auditory receptor cell stereocilium organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	11078
	110253
	ENSG00000100106
	ENSMUSG00000033088
	Q9H2D6
	Q99KW3
	NM_138632; NM_001039141; NM_007032
	NM_001024716; NM_001039155; NM_001039156; NM_138579
	NP_001034230; NP_008963; NP_619538
	NP_001019887; NP_001034244; NP_001034245; NP_613045
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TRIOBP (англ. TRIO and F-actin binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 365 амінокислот, а молекулярна маса — 261 376^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEEVPGDALC	EHFEANILTQ	NRCQNCFHPE	EAHGARYQEL	RSPSGAEVPY
CDLPRCPPAP	EDPLSASTSG	CQSVVDPGLR	PGPKRGPSPS	AGLPEEGPTA
APRSRSRELE	AVPYLEGLTT	SLCGSCNEDP	GSDPTSSPDS	ATPDDTSNSS
SVDWDTVERQ	EEEAPSWDEL	AVMIPRRPRE	GPRADSSQRA	PSLLTRSPVG
GDAAGQKKED	TGGGGRSAGQ	HWARLRGESG	LSLERHRSTL	TQASSMTPHS
GPRSTTSQAS	PAQRDTAQAA	STREIPRASS	PHRITQRDTS	RASSTQQEIS
RASSTQQETS	RASSTQEDTP	RASSTQEDTP	RASSTQWNTP	RASSPSRSTQ
LDNPRTSSTQ	QDNPQTSFPT	CTPQRENPRT	PCVQQDDPRA	SSPNRTTQRE
NSRTSCAQRD	NPKASRTSSP	NRATRDNPRT	SCAQRDNPRA	SSPSRATRDN
PTTSCAQRDN	PRASRTSSPN	RATRDNPRTS	CAQRDNPRAS	SPSRATRDNP
TTSCAQRDNP	RASRTSSPNR	ATRDNPRTSC	AQRDNPRASS	PNRAARDNPT
TSCAQRDNPR	ASRTSSPNRA	TRDNPRTSCA	QRDNPRASSP	NRATRDNPTT
SCAQRDNPRA	SRTSSPNRAT	RDNPRTSCAQ	RDNPRASSPN	RTTQQDSPRT
SCARRDDPRA	SSPNRTIQQE	NPRTSCALRD	NPRASSPSRT	IQQENPRTSC
AQRDDPRASS	PNRTTQQENP	RTSCARRDNP	RASSRNRTIQ	RDNPRTSCAQ
RDNPRASSPN	RTIQQENLRT	SCTRQDNPRT	SSPNRATRDN	PRTSCAQRDN
LRASSPIRAT	QQDNPRTCIQ	QNIPRSSSTQ	QDNPKTSCTK	RDNLRPTCTQ
RDRTQSFSFQ	RDNPGTSSSQ	CCTQKENLRP	SSPHRSTQWN	NPRNSSPHRT
NKDIPWASFP	LRPTQSDGPR	TSSPSRSKQS	EVPWASIALR	PTQGDRPQTS
SPSRPAQHDP	PQSSFGPTQY	NLPSRATSSS	HNPGHQSTSR	TSSPVYPAAY
GAPLTSPEPS	QPPCAVCIGH	RDAPRASSPP	RYLQHDPFPF	FPEPRAPESE
PPHHEPPYIP	PAVCIGHRDA	PRASSPPRHT	QFDPFPFLPD	TSDAEHQCQS
PQHEPLQLPA	PVCIGYRDAP	RASSPPRQAP	EPSLLFQDLP	RASTESLVPS
MDSLHECPHI	PTPVCIGHRD	APSFSSPPRQ	APEPSLFFQD	PPGTSMESLA
PSTDSLHGSP	VLIPQVCIGH	RDAPRASSPP	RHPPSDLAFL	APSPSPGSSG
GSRGSAPPGE	TRHNLEREEY	TVLADLPPPR	RLAQRQPGPQ	AQCSSGGRTH
SPGRAEVERL	FGQERRKSEA	AGAFQAQDEG	RSQQPSQGQS	QLLRRQSSPA
PSRQVTMLPA	KQAELTRRSQ	AEPPHPWSPE	KRPEGDRQLQ	GSPLPPRTSA
RTPERELRTQ	RPLESGQAGP	RQPLGVWQSQ	EEPPGSQGPH	RHLERSWSSQ
EGGLGPGGWW	GCGEPSLGAA	KAPEGAWGGT	SREYKESWGQ	PEAWEEKPTH
ELPRELGKRS	PLTSPPENWG	GPAESSQSWH	SGTPTAVGWG	AEGACPYPRG
SERRPELDWR	DLLGLLRAPG	EGVWARVPSL	DWEGLLELLQ	ARLPRKDPAG
HRDDLARALG	PELGPPGTND	VPEQESHSQP	EGWAEATPVN	GHSPALQSQS
PVQLPSPACT	STQWPKIKVT	RGPATATLAG	LEQTGPLGSR	STAKGPSLPE
LQFQPEEPEE	SEPSRGQDPL	TDQKQADSAD	KRPAEGKAGS	PLKGRLVTSW
RMPGDRPTLF	NPFLLSLGVL	RWRRPDLLNF	KKGWMSILDE	PGEPPSPSLT
TTSTSQWKKH	WFVLTDSSLK	YYRDSTAEEA	DELDGEIDLR	SCTDVTEYAV
QRNYGFQIHT	KDAVYTLSAM	TSGIRRNWIE	ALRKTVRPTS	APDVTKLSDS
NKENALHSYS	TQKGPLKAGE	QRAGSEVISR	GGPRKADGQR	QALDYVELSP
LTQASPQRAR	TPARTPDRLA	KQEELERDLA	QRSEERRKWF	EATDSRTPEV
PAGEGPRRGL	GAPLTEDQQN	RLSEEIEKKW	QELEKLPLRE	NKRVPLTALL
NQSRGERRGP	PSDGHEALEK	EVQALRAQLE	AWRLQGEAPQ	SALRSQEDGH
IPPGYISQEA	CERSLAEMES	SHQQVMEELQ	RHHERELQRL	QQEKEWLLAE
ETAATASAIE	AMKKAYQEEL	SRELSKTRSL	QQGPDGLRKQ	HQSDVEALKR
ELQVLSEQYS	QKCLEIGALM	RQAEEREHTL	RRCQQEGQEL	LRHNQELHGR
LSEEIDQLRG	FIASQGMGNG	CGRSNERSSC	ELEVLLRVKE	NELQYLKKEV
QCLRDELQMM	QKDKRFTSGK	YQDVYVELSH	IKTRSEREIE	QLKEHLRLAM
AALQEKESMR	NSLAE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hirosawa M., Nagase T., Murahashi Y., Kikuno R., Ohara O. (2001). Identification of novel transcribed sequences on human chromosome 22 by expressed sequence tag mapping. DNA Res. 8: 1—9. PMID 11258795 DOI:10.1093/dnares/8.1.1
Seipel K., O'Brien S.P., Iannotti E., Medley Q.G., Streuli M. (2001). Tara, a novel F-actin binding protein, associates with the Trio guanine nucleotide exchange factor and regulates actin cytoskeletal organization. J. Cell Sci. 114: 389—399. PMID 11148140