TRIO

TRIO (англ. Trio Rho guanine nucleotide exchange factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 097 амінокислот, а молекулярна маса — 346 900.

TRIO
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1NTY, 2NZ8
Ідентифікатори
Символи	TRIO, ARHGEF23, tgat, trio Rho guanine nucleotide exchange factor, MEBAS, MRD44, MRD63, TRIO gene
Зовнішні ІД	OMIM: 601893 MGI: 1927230 HomoloGene: 20847 GeneCards: TRIO
Пов'язані генетичні захворювання
нейропатія, autosomal dominant non-syndromic intellectual disability44, syndromic intellectual disability
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • guanyl-nucleotide exchange factor activity • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • фосфорилювання • protein phosphorylation • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase signaling pathway • positive regulation of apoptotic process • regulation of Rho protein signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • negative regulation of fat cell differentiation • G protein-coupled receptor signaling pathway • axon guidance • central nervous system development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7204	223435
Ensembl	ENSG00000038382	ENSMUSG00000022263
UniProt	O75962	Q0KL02
RefSeq (мРНК)	NM_007118	NM_001081302
RefSeq (білок)	NP_009049	NP_001074771
Локус (UCSC)	Хр. 5: 14.14 – 14.53 Mb	Хр. 15: 27.73 – 28.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGSSGGAAA		PAASSGPAAA		ASAAGSGCGG		GAGEGAEEAA		KDLADIAAFF
RSGFRKNDEM		KAMDVLPILK		EKVAYLSGGR		DKRGGPILTF		PARSNHDRIR
QEDLRRLISY		LACIPSEEVC		KRGFTVIVDM		RGSKWDSIKP		LLKILQESFP
CCIHVALIIK		PDNFWQKQRT		NFGSSKFEFE		TNMVSLEGLT		KVVDPSQLTP
EFDGCLEYNH		EEWIEIRVAF		EDYISNATHM		LSRLEELQDI		LAKKELPQDL
EGARNMIEEH		SQLKKKVIKA		PIEDLDLEGQ		KLLQRIQSSE		SFPKKNSGSG
NADLQNLLPK		VSTMLDRLHS		TRQHLHQMWH		VRKLKLDQCF		QLRLFEQDAE
KMFDWITHNK		GLFLNSYTEI		GTSHPHAMEL		QTQHNHFAMN		CMNVYVNINR
IMSVANRLVE		SGHYASQQIR		QIASQLEQEW		KAFAAALDER		STLLDMSSIF
HQKAEKYMSN		VDSWCKACGE		VDLPSELQDL		EDAIHHHQGI		YEHITLAYSE
VSQDGKSLLD		KLQRPLTPGS		SDSLTASANY		SKAVHHVLDV		IHEVLHHQRQ
LENIWQHRKV		RLHQRLQLCV		FQQDVQQVLD		WIENHGEAFL		SKHTGVGKSL
HRARALQKRH		EDFEEVAQNT		YTNADKLLEA		AEQLAQTGEC		DPEEIYQAAH
QLEDRIQDFV		RRVEQRKILL		DMSVSFHTHV		KELWTWLEEL		QKELLDDVYA
ESVEAVQDLI		KRFGQQQQTT		LQVTVNVIKE		GEDLIQQLRD		SAISSNKTPH
NSSINHIETV		LQQLDEAQSQ		MEELFQERKI		KLELFLQLRI		FERDAIDIIS
DLESWNDELS		QQMNDFDTED		LTIAEQRLQH		HADKALTMNN		LTFDVIHQGQ
DLLQYVNEVQ		ASGVELLCDR		DVDMATRVQD		LLEFLHEKQQ		ELDLAAEQHR
KHLEQCVQLR		HLQAEVKQVL		GWIRNGESML		NAGLITASSL		QEAEQLQREH
EQFQHAIEKT		HQSALQVQQK		AEAMLQANHY		DMDMIRDCAE		KVASHWQQLM
LKMEDRLKLV		NASVAFYKTS		EQVCSVLESL		EQEYKREEDW		CGGADKLGPN
SETDHVTPMI		SKHLEQKEAF		LKACTLARRN		ADVFLKYLHR		NSVNMPGMVT
HIKAPEQQVK		NILNELFQRE		NRVLHYWTMR		KRRLDQCQQY		VVFERSAKQA
LEWIHDNGEF		YLSTHTSTGS		SIQHTQELLK		EHEEFQITAK		QTKERVKLLI
QLADGFCEKG		HAHAAEIKKC		VTAVDKRYRD		FSLRMEKYRT		SLEKALGISS
DSNKSSKSLQ		LDIIPASIPG		SEVKLRDAAH		ELNEEKRKSA		RRKEFIMAEL
IQTEKAYVRD		LRECMDTYLW		EMTSGVEEIP		PGIVNKELII		FGNMQEIYEF
HNNIFLKELE		KYEQLPEDVG		HCFVTWADKF		QMYVTYCKNK		PDSTQLILEH
AGSYFDEIQQ		RHGLANSISS		YLIKPVQRIT		KYQLLLKELL		TCCEEGKGEI
KDGLEVMLSV		PKRANDAMHL		SMLEGFDENI		ESQGELILQE		SFQVWDPKTL
IRKGRERHLF		LFEMSLVFSK		EVKDSSGRSK		YLYKSKLFTS		ELGVTEHVEG
DPCKFALWVG		RTPTSDNKIV		LKASSIENKQ		DWIKHIREVI		QERTIHLKGA
LKEPIHIPKT		APATRQKGRR		DGEDLDSQGD		GSSQPDTISI		ASRTSQNTLD
SDKLSGGCEL		TVVIHDFTAC		NSNELTIRRG		QTVEVLERPH		DKPDWCLVRT
TDRSPAAEGL		VPCGSLCIAH		SRSSMEMEGI		FNHKDSLSVS		SNDASPPASV
ASLQPHMIGA		QSSPGPKRPG		NTLRKWLTSP		VRRLSSGKAD		GHVKKLAHKH
KKSREVRKSA		DAGSQKDSDD		SAATPQDETV		EERGRNEGLS		SGTLSKSSSS
GMQSCGEEEG		EEGADAVPLP		PPMAIQQHSL		LQPDSQDDKA		SSRLLVRPTS
SETPSAAELV		SAIEELVKSK		MALEDRPSSL		LVDQGDSSSP		SFNPSDNSLL
SSSSPIDEME		ERKSSSLKRR		HYVLQELVET		ERDYVRDLGY		VVEGYMALMK
EDGVPDDMKG		KDKIVFGNIH		QIYDWHRDFF		LGELEKCLED		PEKLGSLFVK
HERRLHMYIA		YCQNKPKSEH		IVSEYIDTFF		EDLKQRLGHR		LQLTDLLIKP
VQRIMKYQLL		LKDFLKYSKK		ASLDTSELER		AVEVMCIVPR		RCNDMMNVGR
LQGFDGKIVA		QGKLLLQDTF		LVTDQDAGLL		PRCRERRIFL		FEQIVIFSEP
LDKKKGFSMP		GFLFKNSIKV		SCLCLEENVE		NDPCKFALTS		RTGDVVETFI
LHSSSPSVRQ		TWIHEINQIL		ENQRNFLNAL		TSPIEYQRNH		SGGGGGGGSG
GSGGGGGSGG		GGAPSGGSGH		SGGPSSCGGA		PSTSRSRPSR		IPQPVRHHPP
VLVSSAASSQ		AEADKMSGTS		TPGPSLPPPG		AAPEAGPSAP		SRRPPGADAE
GSEREAEPIP		KMKVLESPRK		GAANASGSSP		DAPAKDARAS		LGTLPLGKPR
AGAASPLNSP		LSSAVPSLGK		EPFPPSSPLQ		KGGSFWSSIP		ASPASRPGSF
TFPGDSDSLQ		RQTPRHAAPG		KDTDRMSTCS		SASEQSVQST		QSNGSESSSS
SNISTMLVTH		DYTAVKEDEI		NVYQGEVVQI		LASNQQNMFL		VFRAATDQCP
AAEGWIPGFV		LGHTSAVIVE		NPDGTLKKST		SWHTALRLRK		KSEKKDKDGK
REGKLENGYR		KSREGLSNKV		SVKLLNPNYI		YDVPPEFVIP		LSEVTCETGE
TVVLRCRVCG		RPKASITWKG		PEHNTLNNDG		HYSISYSDLG		EATLKIVGVT
TEDDGIYTCI		AVNDMGSASS		SASLRVLGPG		MDGIMVTWKD		NFDSFYSEVA
ELGRGRFSVV		KKCDQKGTKR		AVATKFVNKK		LMKRDQVTHE		LGILQSLQHP
LLVGLLDTFE		TPTSYILVLE		MADQGRLLDC		VVRWGSLTEG		KIRAHLGEVL
EAVRYLHNCR		IAHLDLKPEN		ILVDESLAKP		TIKLADFGDA		VQLNTTYYIH
QLLGNPEFAA		PEIILGNPVS		LTSDTWSVGV		LTYVLLSGVS		PFLDDSVEET
CLNICRLDFS		FPDDYFKGVS		QKAKEFVCFL		LQEDPAKRPS		AALALQEQWL
QAGNGRSTGV		LDTSRLTSFI		ERRKHQNDVR		PIRSIKNFLQ		SRLLPRV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Liang Y., Niederstrasser H., Edwards M., Jackson C.E., Cooper J.A. (2009). Distinct roles for CARMIL isoforms in cell migration. Mol. Biol. Cell. 20: 5290—5305. PMID 19846667 DOI:10.1091/mbc.E08-10-1071

Див. також

• Хромосома 5