TRIM7

TRIM7 (англ. Tripartite motif containing 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 511 амінокислот, а молекулярна маса — 56 631.

TRIM7
Ідентифікатори
Символи	TRIM7, GNIP, RNF90, tripartite motif containing 7
Зовнішні ІД	OMIM: 609315 MGI: 2137353 HomoloGene: 14113 GeneCards: TRIM7
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • внутрішньоклітинний • клітинне ядро Біологічний процес • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81786	94089
Ensembl	ENSG00000146054	ENSMUSG00000040350
UniProt	Q9C029	Q923T7
RefSeq (мРНК)	NM_203297 NM_033342 NM_203293 NM_203294 NM_203295 NM_203296	NM_053166 NM_001347436 NM_001347446
RefSeq (білок)	NP_203128 NP_976038 NP_976039 NP_976040 NP_976041 NP_976042	NP_001334375 NP_444396
Локус (UCSC)	Хр. 5: 181.19 – 181.21 Mb	Хр. 11: 48.72 – 48.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAVGPRTGP		GTGAEALALA		AELQGEATCS		ICLELFREPV		SVECGHSFCR
ACIGRCWERP		GAGSVGAATR		APPFPLPCPQ		CREPARPSQL		RPNRQLAAVA
TLLRRFSLPA		AAPGEHGSQA		AAARAAAARC		GQHGEPFKLY		CQDDGRAICV
VCDRAREHRE		HAVLPLDEAV		QEAKELLESR		LRVLKKELED		CEVFRSTEKK
ESKELLKQMA		AEQEKVGAEF		QALRAFLVEQ		EGRLLGRLEE		LSREVAQKQN
ENLAQLGVEI		TQLSKLSSQI		QETAQKPDLD		FLQEFKSTLS		RCSNVPGPKP
TTVSSEMKNK		VWNVSLKTFV		LKGMLKKFKE		DLRGELEKEE		KVELTLDPDT
ANPRLILSLD		LKGVRLGERA		QDLPNHPCRF		DTNTRVLASC		GFSSGRHHWE
VEVGSKDGWA		FGVARESVRR		KGLTPFTPEE		GVWALQLNGG		QYWAVTSPER
SPLSCGHLSR		VRVALDLEVG		AVSFYAVEDM		RHLYTFRVNF		QERVFPLFSV
CSTGTYLRIW		P

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• Skurat A.V., Dietrich A.D., Zhai L., Roach P.J. (2002). GNIP, a novel protein that binds and activates glycogenin, the self-glucosylating initiator of glycogen biosynthesis. J. Biol. Chem. 277: 19331—19338. PMID 11916970 DOI:10.1074/jbc.M201190200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhai L., Dietrich A., Skurat A.V., Roach P.J. (2004). Structure-function analysis of GNIP, the glycogenin-interacting protein. Arch. Biochem. Biophys. 421: 236—242. PMID 14984203 DOI:10.1016/j.abb.2003.11.017

Див. також

• Хромосома 5