TRIM68

TRIM68 (англ. Tripartite motif containing 68) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 485 амінокислот, а молекулярна маса — 56 259.

TRIM68
Ідентифікатори
Символи	TRIM68, GC109, RNF137, SS-56, SS56, tripartite motif containing 68
Зовнішні ІД	OMIM: 613184 MGI: 2142077 HomoloGene: 9991 GeneCards: TRIM68
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • androgen receptor binding • histone acetyltransferase binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • комплекс Ґольджі • ядерце • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • interferon-gamma-mediated signaling pathway • regulation of androgen receptor signaling pathway • Убіквітин-залежний протеоліз • protein autoubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55128	101700
Ensembl	ENSG00000167333	ENSMUSG00000073968
UniProt	Q6AZZ1	Q8K243
RefSeq (мРНК)	NM_018073 NM_001304496	NM_198012 NM_001307998
RefSeq (білок)	NP_001291425 NP_060543	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 11: 4.6 – 4.61 Mb	Хр. 7: 102.33 – 102.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPTALVEAI		VEEVACPICM		TFLREPMSID		CGHSFCHSCL		SGLWEIPGES
QNWGYTCPLC		RAPVQPRNLR		PNWQLANVVE		KVRLLRLHPG		MGLKGDLCER
HGEKLKMFCK		EDVLIMCEAC		SQSPEHEAHS		VVPMEDVAWE		YKWELHEALE
HLKKEQEEAW		KLEVGERKRT		ATWKIQVETR		KQSIVWEFEK		YQRLLEKKQP
PHRQLGAEVA		AALASLQREA		AETMQKLELN		HSELIQQSQV		LWRMIAELKE
RSQRPVRWML		QDIQEVLNRS		KSWSLQQPEP		ISLELKTDCR		VLGLREILKT
YAADVRLDPD		TAYSRLIVSE		DRKRVHYGDT		NQKLPDNPER		FYRYNIVLGS
QCISSGRHYW		EVEVGDRSEW		GLGVCKQNVD		RKEVVYLSPH		YGFWVIRLRK
GNEYRAGTDE		YPILSLPVPP		RRVGIFVDYE		AHDISFYNVT		DCGSHIFTFP
RYPFPGRLLP		YFSPCYSIGT		NNTAPLAICS		LDGED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11