TRIM38

TRIM38 (англ. Tripartite motif containing 38) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 53 416.

TRIM38
Ідентифікатори
Символи	TRIM38, RNF15, RORET, tripartite motif containing 38
Зовнішні ІД	MGI: 2684869 HomoloGene: 48427 GeneCards: TRIM38
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • signal transducer activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transferase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • внутрішньоклітинний Біологічний процес • процес імунної системи • interferon-gamma-mediated signaling pathway • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • вроджений імунітет Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10475	214158
Ensembl	ENSG00000112343	ENSMUSG00000064140
UniProt	O00635	Q5SZ99
RefSeq (мРНК)	NM_006355	NM_001029935
RefSeq (білок)	NP_006346	NP_001025106
Локус (UCSC)	Хр. 6: 25.96 – 25.99 Mb	Хр. 13: 23.95 – 23.98 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASTTSTKKM		MEEATCSICL		SLMTNPVSIN		CGHSYCHLCI		TDFFKNPSQK
QLRQETFCCP		QCRAPFHMDS		LRPNKQLGSL		IEALKETDQE		MSCEEHGEQF
HLFCEDEGQL		ICWRCERAPQ		HKGHTTALVE		DVCQGYKEKL		QKAVTKLKQL
EDRCTEQKLS		TAMRITKWKE		KVQIQRQKIR		SDFKNLQCFL		HEEEKSYLWR
LEKEEQQTLS		RLRDYEAGLG		LKSNELKSHI		LELEEKCQGS		AQKLLQNVND
TLSRSWAVKL		ETSEAVSLEL		HTMCNVSKLY		FDVKKMLRSH		QVSVTLDPDT
AHHELILSED		RRQVTRGYTQ		ENQDTSSRRF		TAFPCVLGCE		GFTSGRRYFE
VDVGEGTGWD		LGVCMENVQR		GTGMKQEPQS		GFWTLRLCKK		KGYVALTSPP
TSLHLHEQPL		LVGIFLDYEA		GVVSFYNGNT		GCHIFTFPKA		SFSDTLRPYF
QVYQYSPLFL		PPPGD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6