TRAP1

TRAP1 (англ. TNF receptor associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 704 амінокислот, а молекулярна маса — 80 110.

TRAP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4Z1F, 4Z1G, 4Z1H, 4Z1I, 5F3K, 5F5R
Ідентифікатори
Символи	TRAP1, HSP 75, HSP75, HSP90L, TRAP-1, TNF receptor associated protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606219 MGI: 1915265 HomoloGene: 9457 GeneCards: TRAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • unfolded protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • tumor necrosis factor receptor binding • ATP binding • protein kinase binding • RNA binding Клітинна компонента • мембрана • мітохондріальний міжмембранний простір • lipid droplet • Нуклеоплазма • мітохондріальний матрикс • мітохондрія • мітохондріальна внутрішня мембрана • екзосома Біологічний процес • response to stress • negative regulation of cellular respiration • згортання білків • negative regulation of reactive oxygen species biosynthetic process • translational attenuation • chaperone-mediated protein folding • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to hydrogen peroxide Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10131	68015
Ensembl	ENSG00000126602	ENSMUSG00000005981
UniProt	Q12931	Q9CQN1
RefSeq (мРНК)	NM_001272049 NM_016292	NM_026508
RefSeq (білок)	NP_001258978 NP_057376	NP_080784
Локус (UCSC)	Хр. 16: 3.65 – 3.72 Mb	Хр. 16: 3.86 – 3.9 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MARELRALLL		WGRRLRPLLR		APALAAVPGG		KPILCPRRTT		AQLGPRRNPA
WSLQAGRLFS		TQTAEDKEEP		LHSIISSTES		VQGSTSKHEF		QAETKKLLDI
VARSLYSEKE		VFIRELISNA		SDALEKLRHK		LVSDGQALPE		MEIHLQTNAE
KGTITIQDTG		IGMTQEELVS		NLGTIARSGS		KAFLDALQNQ		AEASSKIIGQ
FGVGFYSAFM		VADRVEVYSR		SAAPGSLGYQ		WLSDGSGVFE		IAEASGVRTG
TKIIIHLKSD		CKEFSSEARV		RDVVTKYSNF		VSFPLYLNGR		RMNTLQAIWM
MDPKDVREWQ		HEEFYRYVAQ		AHDKPRYTLH		YKTDAPLNIR		SIFYVPDMKP
SMFDVSRELG		SSVALYSRKV		LIQTKATDIL		PKWLRFIRGV		VDSEDIPLNL
SRELLQESAL		IRKLRDVLQQ		RLIKFFIDQS		KKDAEKYAKF		FEDYGLFMRE
GIVTATEQEV		KEDIAKLLRY		ESSALPSGQL		TSLSEYASRM		RAGTRNIYYL
CAPNRHLAEH		SPYYEAMKKK		DTEVLFCFEQ		FDELTLLHLR		EFDKKKLISV
ETDIVVDHYK		EEKFEDRSPA		AECLSEKETE		ELMAWMRNVL		GSRVTNVKVT
LRLDTHPAMV		TVLEMGAARH		FLRMQQLAKT		QEERAQLLQP		TLEINPRHAL
IKKLNQLRAS		EPGLAQLLVD		QIYENAMIAA		GLVDDPRAMV		GRLNELLVKA
LERH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до шаперонів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Song H.Y., Dunbar J.D., Zhang Y.X., Guo D., Donner D.B. (1995). Identification of a protein with homology to hsp90 that binds the type 1 tumor necrosis factor receptor. J. Biol. Chem. 270: 3574—3581. PMID 7876093 DOI:10.1074/jbc.270.28.16630

Див. також

• Хромосома 16