TNXB
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
TNXB (англ. Tenascin XB) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 242 амінокислот, а молекулярна маса — 458 220[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MMPAQYALTS | SLVLLVLLST | ARAGPFSSRS | NVTLPAPRPP | PQPGGHTVGA | ||||
GVGSPSSQLY | EHTVEGGEKQ | VVFTHRINLP | PSTGCGCPPG | TEPPVLASEV | ||||
QALRVRLEIL | EELVKGLKEQ | CTGGCCPASA | QAGTGQTDVR | TLCSLHGVFD | ||||
LSRCTCSCEP | GWGGPTCSDP | TDAEIPPSSP | PSASGSCPDD | CNDQGRCVRG | ||||
RCVCFPGYTG | PSCGWPSCPG | DCQGRGRCVQ | GVCVCRAGFS | GPDCSQRSCP | ||||
RGCSQRGRCE | GGRCVCDPGY | TGDDCGMRSC | PRGCSQRGRC | ENGRCVCNPG | ||||
YTGEDCGVRS | CPRGCSQRGR | CKDGRCVCDP | GYTGEDCGTR | SCPWDCGEGG | ||||
RCVDGRCVCW | PGYTGEDCST | RTCPRDCRGR | GRCEDGECIC | DTGYSGDDCG | ||||
VRSCPGDCNQ | RGRCEDGRCV | CWPGYTGTDC | GSRACPRDCR | GRGRCENGVC | ||||
VCNAGYSGED | CGVRSCPGDC | RGRGRCESGR | CMCWPGYTGR | DCGTRACPGD | ||||
CRGRGRCVDG | RCVCNPGFTG | EDCGSRRCPG | DCRGHGLCED | GVCVCDAGYS | ||||
GEDCSTRSCP | GGCRGRGQCL | DGRCVCEDGY | SGEDCGVRQC | PNDCSQHGVC | ||||
QDGVCICWEG | YVSEDCSIRT | CPSNCHGRGR | CEEGRCLCDP | GYTGPTCATR | ||||
MCPADCRGRG | RCVQGVCLCH | VGYGGEDCGQ | EEPPASACPG | GCGPRELCRA | ||||
GQCVCVEGFR | GPDCAIQTCP | GDCRGRGECH | DGSCVCKDGY | AGEDCGEEVP | ||||
TIEGMRMHLL | EETTVRTEWT | PAPGPVDAYE | IQFIPTTEGA | SPPFTARVPS | ||||
SASAYDQRGL | APGQEYQVTV | RALRGTSWGL | PASKTITTMI | DGPQDLRVVA | ||||
VTPTTLELGW | LRPQAEVDRF | VVSYVSAGNQ | RVRLEVPPEA | DGTLLTDLMP | ||||
GVEYVVTVTA | ERGRAVSYPA | SVRANTGSSP | LGLLGTTDEP | PPSGPSTTQG | ||||
AQAPLLQQRP | QELGELRVLG | RDETGRLRVV | WTAQPDTFAY | FQLRMRVPEG | ||||
PGAHEEVLPG | DVRQALVPPP | PPGTPYELSL | HGVPPGGKPS | DPIIYQGIMD | ||||
KDEEKPGKSS | GPPRLGELTV | TDRTSDSLLL | RWTVPEGEFD | SFVIQYKDRD | ||||
GQPQVVPVEG | PQRSAVITSL | DPGRKYKFVL | YGFVGKKRHG | PLVAEAKILP | ||||
QSDPSPGTPP | HLGNLWVTDP | TPDSLHLSWT | VPEGQFDTFM | VQYRDRDGRP | ||||
QVVPVEGPER | SFVVSSLDPD | HKYRFTLFGI | ANKKRYGPLT | ADGTTAPERK | ||||
EEPPRPEFLE | QPLLGELTVT | GVTPDSLRLS | WTVAQGPFDS | FMVQYKDAQG | ||||
QPQAVPVAGD | ENEVTVPGLD | PDRKYKMNLY | GLRGRQRVGP | ESVVAKTAPQ | ||||
EDVDETPSPT | ELGTEAPESP | EEPLLGELTV | TGSSPDSLSL | FWTVPQGSFD | ||||
SFTVQYKDRD | GRPRAVRVGG | KESEVTVGGL | EPGHKYKMHL | YGLHEGQRVG | ||||
PVSAVGVTAP | QQEETPPATE | SPLEPRLGEL | TVTDVTPNSV | GLSWTVPEGQ | ||||
FDSFIVQYKD | KDGQPQVVPV | AADQREVTVY | NLEPERKYKM | NMYGLHDGQR | ||||
MGPLSVVIVT | APLPPAPATE | ASKPPLEPRL | GELTVTDITP | DSVGLSWTVP | ||||
EGEFDSFVVQ | YKDRDGQPQV | VPVAADQREV | TIPDLEPSRK | YKFLLFGIQD | ||||
GKRRSPVSVE | AKTVARGDAS | PGAPPRLGEL | WVTDPTPDSL | RLSWTVPEGQ | ||||
FDSFVVQFKD | KDGPQVVPVE | GHERSVTVTP | LDAGRKYRFL | LYGLLGKKRH | ||||
GPLTADGTTE | ARSAMDDTGT | KRPPKPRLGE | ELQVTTVTQN | SVGLSWTVPE | ||||
GQFDSFVVQY | KDRDGQPQVV | PVEGSLREVS | VPGLDPAHRY | KLLLYGLHHG | ||||
KRVGPISAVA | ITAGREETET | ETTAPTPPAP | EPHLGELTVE | EATSHTLHLS | ||||
WMVTEGEFDS | FEIQYTDRDG | QLQMVRIGGD | RNDITLSGLE | SDHRYLVTLY | ||||
GFSDGKHVGP | VHVEALTVPE | EEKPSEPPTA | TPEPPIKPRL | GELTVTDATP | ||||
DSLSLSWTVP | EGQFDHFLVQ | YRNGDGQPKA | VRVPGHEEGV | TISGLEPDHK | ||||
YKMNLYGFHG | GQRMGPVSVV | GVTAAEEETP | SPTEPSMEAP | EPAEEPLLGE | ||||
LTVTGSSPDS | LSLSWTVPQG | RFDSFTVQYK | DRDGRPQVVR | VGGEESEVTV | ||||
GGLEPGRKYK | MHLYGLHEGR | RVGPVSAVGV | TAPEEESPDA | PLAKLRLGQM | ||||
TVRDITSDSL | SLSWTVPEGQ | FDHFLVQFKN | GDGQPKAVRV | PGHEDGVTIS | ||||
GLEPDHKYKM | NLYGFHGGQR | VGPVSAVGLT | APGKDEEMAP | ASTEPPTPEP | ||||
PIKPRLEELT | VTDATPDSLS | LSWTVPEGQF | DHFLVQYKNG | DGQPKATRVP | ||||
GHEDRVTISG | LEPDNKYKMN | LYGFHGGQRV | GPVSAIGVTA | AEEETPSPTE | ||||
PSMEAPEPPE | EPLLGELTVT | GSSPDSLSLS | WTVPQGRFDS | FTVQYKDRDG | ||||
RPQVVRVGGE | ESEVTVGGLE | PGRKYKMHLY | GLHEGRRVGP | VSTVGVTAPQ | ||||
EDVDETPSPT | EPGTEAPGPP | EEPLLGELTV | TGSSPDSLSL | SWTVPQGRFD | ||||
SFTVQYKDRD | GRPQAVRVGG | QESKVTVRGL | EPGRKYKMHL | YGLHEGRRLG | ||||
PVSAVGVTED | EAETTQAVPT | MTPEPPIKPR | LGELTMTDAT | PDSLSLSWTV | ||||
PEGQFDHFLV | QYRNGDGQPK | AVRVPGHEDG | VTISGLEPDH | KYKMNLYGFH | ||||
GGQRVGPISV | IGVTAAEEET | PSPTELSTEA | PEPPEEPLLG | ELTVTGSSPD | ||||
SLSLSWTIPQ | GHFDSFTVQY | KDRDGRPQVM | RVRGEESEVT | VGGLEPGRKY | ||||
KMHLYGLHEG | RRVGPVSTVG | VTEDEAETTQ | AVPTTTPEPP | NKPRLGELTV | ||||
TDATPDSLSL | SWMVPEGQFD | HFLVQYRNGD | GQPKVVRVPG | HEDGVTISGL | ||||
EPDHKYKMNL | YGFHGGQRVG | PISVIGVTAA | EEETPAPTEP | STEAPEPPEE | ||||
PLLGELTVTG | SSPDSLSLSW | TIPQGRFDSF | TVQYKDRDGR | PQVVRVRGEE | ||||
SEVTVGGLEP | GCKYKMHLYG | LHEGQRVGPV | SAVGVTAPKD | EAETTQAVPT | ||||
MTPEPPIKPR | LGELTVTDAT | PDSLSLSWMV | PEGQFDHFLV | QYRNGDGQPK | ||||
AVRVPGHEDG | VTISGLEPDH | KYKMNLYGFH | GGQRVGPVSA | IGVTEEETPS | ||||
PTEPSTEAPE | APEEPLLGEL | TVTGSSPDSL | SLSWTVPQGR | FDSFTVQYKD | ||||
RDGQPQVVRV | RGEESEVTVG | GLEPGRKYKM | HLYGLHEGQR | VGPVSTVGIT | ||||
APLPTPLPVE | PRLGELAVAA | VTSDSVGLSW | TVAQGPFDSF | LVQYRDAQGQ | ||||
PQAVPVSGDL | RAVAVSGLDP | ARKYKFLLFG | LQNGKRHGPV | PVEARTAPDT | ||||
KPSPRLGELT | VTDATPDSVG | LSWTVPEGEF | DSFVVQYKDK | DGRLQVVPVA | ||||
ANQREVTVQG | LEPSRKYRFL | LYGLSGRKRL | GPISADSTTA | PLEKELPPHL | ||||
GELTVAEETS | SSLRLSWTVA | QGPFDSFVVQ | YRDTDGQPRA | VPVAADQRTV | ||||
TVEDLEPGKK | YKFLLYGLLG | GKRLGPVSAL | GMTAPEEDTP | APELAPEAPE | ||||
PPEEPRLGVL | TVTDTTPDSM | RLSWSVAQGP | FDSFVVQYED | TNGQPQALLV | ||||
DGDQSKILIS | GLEPSTPYRF | LLYGLHEGKR | LGPLSAEGTT | GLAPAGQTSE | ||||
ESRPRLSQLS | VTDVTTSSLR | LNWEAPPGAF | DSFLLRFGVP | SPSTLEPHPR | ||||
PLLQRELMVP | GTRHSAVLRD | LRSGTLYSLT | LYGLRGPHKA | DSIQGTARTL | ||||
SPVLESPRDL | QFSEIRETSA | KVNWMPPPSR | ADSFKVSYQL | ADGGEPQSVQ | ||||
VDGQARTQKL | QGLIPGARYE | VTVVSVRGFE | ESEPLTGFLT | TVPDGPTQLR | ||||
ALNLTEGFAV | LHWKPPQNPV | DTYDVQVTAP | GAPPLQAETP | GSAVDYPLHD | ||||
LVLHTNYTAT | VRGLRGPNLT | SPASITFTTG | LEAPRDLEAK | EVTPRTALLT | ||||
WTEPPVRPAG | YLLSFHTPGG | QNQEILLPGG | ITSHQLLGLF | PSTSYNARLQ | ||||
AMWGQSLLPP | VSTSFTTGGL | RIPFPRDCGE | EMQNGAGASR | TSTIFLNGNR | ||||
ERPLNVFCDM | ETDGGGWLVF | QRRMDGQTDF | WRDWEDYAHG | FGNISGEFWL | ||||
GNEALHSLTQ | AGDYSMRVDL | RAGDEAVFAQ | YDSFHVDSAA | EYYRLHLEGY | ||||
HGTAGDSMSY | HSGSVFSARD | RDPNSLLISC | AVSYRGAWWY | RNCHYANLNG | ||||
LYGSTVDHQG | VSWYHWKGFE | FSVPFTEMKL | RPRNFRSPAG | GG |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
ред.- Tee M.K., Thomson A.A., Bristow J., Miller W.L. (1995). Sequences promoting the transcription of the human XA gene overlapping P450c21A correctly predict the presence of a novel, adrenal-specific, truncated form of tenascin-X. Genomics. 28: 171—178. PMID 8530023 DOI:10.1006/geno.1995.1128
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bristow J., Tee M.K., Gitelman S.E., Mellon S.H., Miller W.L. (1993). Tenascin-X: a novel extracellular matrix protein encoded by the human XB gene overlapping P450c21B. J. Cell Biol. 122: 265—278. PMID 7686164 DOI:10.1083/jcb.122.1.265
- Speek M., Barry F., Miller W.L. (1996). Alternate promoters and alternate splicing of human tenascin-X, a gene with 5' and 3' ends buried in other genes. Hum. Mol. Genet. 5: 1749—1758. PMID 8923003 DOI:10.1093/hmg/5.11.1749
- Morel Y., Bristow J., Gitelman S.E., Miller W.L. (1989). Transcript encoded on the opposite strand of the human steroid 21-hydroxylase/complement component C4 gene locus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 6582—6586. PMID 2475872 DOI:10.1073/pnas.86.17.6582
- Egging D.F., van den Berkmortel F., Taylor G., Bristow J., Schalkwijk J. (2007). Interactions of human tenascin-X domains with dermal extracellular matrix molecules. Arch. Dermatol. Res. 298: 389—396. PMID 17033827 DOI:10.1007/s00403-006-0706-9
Примітки
ред.- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TNXB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11976 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P22105 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |