TNXB

TNXB
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2CUH, 2CUI, 2CUM
Ідентифікатори
Символи	TNXB, EDS3, HXBL, TENX, TN-X, TNX, TNXB1, TNXB2, TNXBS, VUR8, XB, XBS, tenascin XB, EDSCLL, EDSCLL1
Зовнішні ІД	OMIM: 600985 MGI: 1932137 HomoloGene: 49589 GeneCards: TNXB
Пов'язані генетичні захворювання
	макулодистрофія, системний червоний вовчак, ВІЛ-заворювання, Ehlers-Danlos syndrome due to tenascin-X deficiency
Онтологія гена
Молекулярна функція	• integrin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • heparin binding; • extracellular matrix structural constituent; • collagen fibril binding;
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця; • внутрішньоклітинний; • fibrillar collagen trimer; • екзосома; • міжклітинний простір; • extracellular region; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• collagen fibril organization; • collagen metabolic process; • extracellular matrix organization; • адгезія клітин; • elastic fiber assembly; • actin cytoskeleton organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	7148
	81877
ENSG00000236236; ENSG00000236221; ENSG00000229353; ENSG00000229341; ENSG00000233323;
	ENSG00000231608; ENSG00000206258; ENSG00000168477
	ENSMUSG00000033327
	P22105
	н/д
	NM_032470; NM_019105; NM_001365276
	NM_031176
	NP_061978; NP_115859; NP_001352205
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TNXB (англ. Tenascin XB) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 242 амінокислот, а молекулярна маса — 458 220^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMPAQYALTS	SLVLLVLLST	ARAGPFSSRS	NVTLPAPRPP	PQPGGHTVGA
GVGSPSSQLY	EHTVEGGEKQ	VVFTHRINLP	PSTGCGCPPG	TEPPVLASEV
QALRVRLEIL	EELVKGLKEQ	CTGGCCPASA	QAGTGQTDVR	TLCSLHGVFD
LSRCTCSCEP	GWGGPTCSDP	TDAEIPPSSP	PSASGSCPDD	CNDQGRCVRG
RCVCFPGYTG	PSCGWPSCPG	DCQGRGRCVQ	GVCVCRAGFS	GPDCSQRSCP
RGCSQRGRCE	GGRCVCDPGY	TGDDCGMRSC	PRGCSQRGRC	ENGRCVCNPG
YTGEDCGVRS	CPRGCSQRGR	CKDGRCVCDP	GYTGEDCGTR	SCPWDCGEGG
RCVDGRCVCW	PGYTGEDCST	RTCPRDCRGR	GRCEDGECIC	DTGYSGDDCG
VRSCPGDCNQ	RGRCEDGRCV	CWPGYTGTDC	GSRACPRDCR	GRGRCENGVC
VCNAGYSGED	CGVRSCPGDC	RGRGRCESGR	CMCWPGYTGR	DCGTRACPGD
CRGRGRCVDG	RCVCNPGFTG	EDCGSRRCPG	DCRGHGLCED	GVCVCDAGYS
GEDCSTRSCP	GGCRGRGQCL	DGRCVCEDGY	SGEDCGVRQC	PNDCSQHGVC
QDGVCICWEG	YVSEDCSIRT	CPSNCHGRGR	CEEGRCLCDP	GYTGPTCATR
MCPADCRGRG	RCVQGVCLCH	VGYGGEDCGQ	EEPPASACPG	GCGPRELCRA
GQCVCVEGFR	GPDCAIQTCP	GDCRGRGECH	DGSCVCKDGY	AGEDCGEEVP
TIEGMRMHLL	EETTVRTEWT	PAPGPVDAYE	IQFIPTTEGA	SPPFTARVPS
SASAYDQRGL	APGQEYQVTV	RALRGTSWGL	PASKTITTMI	DGPQDLRVVA
VTPTTLELGW	LRPQAEVDRF	VVSYVSAGNQ	RVRLEVPPEA	DGTLLTDLMP
GVEYVVTVTA	ERGRAVSYPA	SVRANTGSSP	LGLLGTTDEP	PPSGPSTTQG
AQAPLLQQRP	QELGELRVLG	RDETGRLRVV	WTAQPDTFAY	FQLRMRVPEG
PGAHEEVLPG	DVRQALVPPP	PPGTPYELSL	HGVPPGGKPS	DPIIYQGIMD
KDEEKPGKSS	GPPRLGELTV	TDRTSDSLLL	RWTVPEGEFD	SFVIQYKDRD
GQPQVVPVEG	PQRSAVITSL	DPGRKYKFVL	YGFVGKKRHG	PLVAEAKILP
QSDPSPGTPP	HLGNLWVTDP	TPDSLHLSWT	VPEGQFDTFM	VQYRDRDGRP
QVVPVEGPER	SFVVSSLDPD	HKYRFTLFGI	ANKKRYGPLT	ADGTTAPERK
EEPPRPEFLE	QPLLGELTVT	GVTPDSLRLS	WTVAQGPFDS	FMVQYKDAQG
QPQAVPVAGD	ENEVTVPGLD	PDRKYKMNLY	GLRGRQRVGP	ESVVAKTAPQ
EDVDETPSPT	ELGTEAPESP	EEPLLGELTV	TGSSPDSLSL	FWTVPQGSFD
SFTVQYKDRD	GRPRAVRVGG	KESEVTVGGL	EPGHKYKMHL	YGLHEGQRVG
PVSAVGVTAP	QQEETPPATE	SPLEPRLGEL	TVTDVTPNSV	GLSWTVPEGQ
FDSFIVQYKD	KDGQPQVVPV	AADQREVTVY	NLEPERKYKM	NMYGLHDGQR
MGPLSVVIVT	APLPPAPATE	ASKPPLEPRL	GELTVTDITP	DSVGLSWTVP
EGEFDSFVVQ	YKDRDGQPQV	VPVAADQREV	TIPDLEPSRK	YKFLLFGIQD
GKRRSPVSVE	AKTVARGDAS	PGAPPRLGEL	WVTDPTPDSL	RLSWTVPEGQ
FDSFVVQFKD	KDGPQVVPVE	GHERSVTVTP	LDAGRKYRFL	LYGLLGKKRH
GPLTADGTTE	ARSAMDDTGT	KRPPKPRLGE	ELQVTTVTQN	SVGLSWTVPE
GQFDSFVVQY	KDRDGQPQVV	PVEGSLREVS	VPGLDPAHRY	KLLLYGLHHG
KRVGPISAVA	ITAGREETET	ETTAPTPPAP	EPHLGELTVE	EATSHTLHLS
WMVTEGEFDS	FEIQYTDRDG	QLQMVRIGGD	RNDITLSGLE	SDHRYLVTLY
GFSDGKHVGP	VHVEALTVPE	EEKPSEPPTA	TPEPPIKPRL	GELTVTDATP
DSLSLSWTVP	EGQFDHFLVQ	YRNGDGQPKA	VRVPGHEEGV	TISGLEPDHK
YKMNLYGFHG	GQRMGPVSVV	GVTAAEEETP	SPTEPSMEAP	EPAEEPLLGE
LTVTGSSPDS	LSLSWTVPQG	RFDSFTVQYK	DRDGRPQVVR	VGGEESEVTV
GGLEPGRKYK	MHLYGLHEGR	RVGPVSAVGV	TAPEEESPDA	PLAKLRLGQM
TVRDITSDSL	SLSWTVPEGQ	FDHFLVQFKN	GDGQPKAVRV	PGHEDGVTIS
GLEPDHKYKM	NLYGFHGGQR	VGPVSAVGLT	APGKDEEMAP	ASTEPPTPEP
PIKPRLEELT	VTDATPDSLS	LSWTVPEGQF	DHFLVQYKNG	DGQPKATRVP
GHEDRVTISG	LEPDNKYKMN	LYGFHGGQRV	GPVSAIGVTA	AEEETPSPTE
PSMEAPEPPE	EPLLGELTVT	GSSPDSLSLS	WTVPQGRFDS	FTVQYKDRDG
RPQVVRVGGE	ESEVTVGGLE	PGRKYKMHLY	GLHEGRRVGP	VSTVGVTAPQ
EDVDETPSPT	EPGTEAPGPP	EEPLLGELTV	TGSSPDSLSL	SWTVPQGRFD
SFTVQYKDRD	GRPQAVRVGG	QESKVTVRGL	EPGRKYKMHL	YGLHEGRRLG
PVSAVGVTED	EAETTQAVPT	MTPEPPIKPR	LGELTMTDAT	PDSLSLSWTV
PEGQFDHFLV	QYRNGDGQPK	AVRVPGHEDG	VTISGLEPDH	KYKMNLYGFH
GGQRVGPISV	IGVTAAEEET	PSPTELSTEA	PEPPEEPLLG	ELTVTGSSPD
SLSLSWTIPQ	GHFDSFTVQY	KDRDGRPQVM	RVRGEESEVT	VGGLEPGRKY
KMHLYGLHEG	RRVGPVSTVG	VTEDEAETTQ	AVPTTTPEPP	NKPRLGELTV
TDATPDSLSL	SWMVPEGQFD	HFLVQYRNGD	GQPKVVRVPG	HEDGVTISGL
EPDHKYKMNL	YGFHGGQRVG	PISVIGVTAA	EEETPAPTEP	STEAPEPPEE
PLLGELTVTG	SSPDSLSLSW	TIPQGRFDSF	TVQYKDRDGR	PQVVRVRGEE
SEVTVGGLEP	GCKYKMHLYG	LHEGQRVGPV	SAVGVTAPKD	EAETTQAVPT
MTPEPPIKPR	LGELTVTDAT	PDSLSLSWMV	PEGQFDHFLV	QYRNGDGQPK
AVRVPGHEDG	VTISGLEPDH	KYKMNLYGFH	GGQRVGPVSA	IGVTEEETPS
PTEPSTEAPE	APEEPLLGEL	TVTGSSPDSL	SLSWTVPQGR	FDSFTVQYKD
RDGQPQVVRV	RGEESEVTVG	GLEPGRKYKM	HLYGLHEGQR	VGPVSTVGIT
APLPTPLPVE	PRLGELAVAA	VTSDSVGLSW	TVAQGPFDSF	LVQYRDAQGQ
PQAVPVSGDL	RAVAVSGLDP	ARKYKFLLFG	LQNGKRHGPV	PVEARTAPDT
KPSPRLGELT	VTDATPDSVG	LSWTVPEGEF	DSFVVQYKDK	DGRLQVVPVA
ANQREVTVQG	LEPSRKYRFL	LYGLSGRKRL	GPISADSTTA	PLEKELPPHL
GELTVAEETS	SSLRLSWTVA	QGPFDSFVVQ	YRDTDGQPRA	VPVAADQRTV
TVEDLEPGKK	YKFLLYGLLG	GKRLGPVSAL	GMTAPEEDTP	APELAPEAPE
PPEEPRLGVL	TVTDTTPDSM	RLSWSVAQGP	FDSFVVQYED	TNGQPQALLV
DGDQSKILIS	GLEPSTPYRF	LLYGLHEGKR	LGPLSAEGTT	GLAPAGQTSE
ESRPRLSQLS	VTDVTTSSLR	LNWEAPPGAF	DSFLLRFGVP	SPSTLEPHPR
PLLQRELMVP	GTRHSAVLRD	LRSGTLYSLT	LYGLRGPHKA	DSIQGTARTL
SPVLESPRDL	QFSEIRETSA	KVNWMPPPSR	ADSFKVSYQL	ADGGEPQSVQ
VDGQARTQKL	QGLIPGARYE	VTVVSVRGFE	ESEPLTGFLT	TVPDGPTQLR
ALNLTEGFAV	LHWKPPQNPV	DTYDVQVTAP	GAPPLQAETP	GSAVDYPLHD
LVLHTNYTAT	VRGLRGPNLT	SPASITFTTG	LEAPRDLEAK	EVTPRTALLT
WTEPPVRPAG	YLLSFHTPGG	QNQEILLPGG	ITSHQLLGLF	PSTSYNARLQ
AMWGQSLLPP	VSTSFTTGGL	RIPFPRDCGE	EMQNGAGASR	TSTIFLNGNR
ERPLNVFCDM	ETDGGGWLVF	QRRMDGQTDF	WRDWEDYAHG	FGNISGEFWL
GNEALHSLTQ	AGDYSMRVDL	RAGDEAVFAQ	YDSFHVDSAA	EYYRLHLEGY
HGTAGDSMSY	HSGSVFSARD	RDPNSLLISC	AVSYRGAWWY	RNCHYANLNG
LYGSTVDHQG	VSWYHWKGFE	FSVPFTEMKL	RPRNFRSPAG	GG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література ред.

Tee M.K., Thomson A.A., Bristow J., Miller W.L. (1995). Sequences promoting the transcription of the human XA gene overlapping P450c21A correctly predict the presence of a novel, adrenal-specific, truncated form of tenascin-X. Genomics. 28: 171—178. PMID 8530023 DOI:10.1006/geno.1995.1128
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bristow J., Tee M.K., Gitelman S.E., Mellon S.H., Miller W.L. (1993). Tenascin-X: a novel extracellular matrix protein encoded by the human XB gene overlapping P450c21B. J. Cell Biol. 122: 265—278. PMID 7686164 DOI:10.1083/jcb.122.1.265
Speek M., Barry F., Miller W.L. (1996). Alternate promoters and alternate splicing of human tenascin-X, a gene with 5' and 3' ends buried in other genes. Hum. Mol. Genet. 5: 1749—1758. PMID 8923003 DOI:10.1093/hmg/5.11.1749
Morel Y., Bristow J., Gitelman S.E., Miller W.L. (1989). Transcript encoded on the opposite strand of the human steroid 21-hydroxylase/complement component C4 gene locus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 6582—6586. PMID 2475872 DOI:10.1073/pnas.86.17.6582
Egging D.F., van den Berkmortel F., Taylor G., Bristow J., Schalkwijk J. (2007). Interactions of human tenascin-X domains with dermal extracellular matrix molecules. Arch. Dermatol. Res. 298: 389—396. PMID 17033827 DOI:10.1007/s00403-006-0706-9