TLR4

TLR4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4G8A, 2Z62, 2Z63, 2Z65, 2Z66, 3FXI, 3UL7, 3UL8, 3UL9, 3ULA
Ідентифікатори
Символи	TLR4, ARMD10, CD284, TLR-4, TOLL, toll like receptor 4
Зовнішні ІД	OMIM: 603030 MGI: 96824 HomoloGene: 41317 GeneCards: TLR4
Реагує на сполуку
	resatorvid
Онтологія гена
Молекулярна функція	• lipopolysaccharide immune receptor activity; • lipopolysaccharide binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • transmembrane signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • perinuclear region of cytoplasm; • cell surface; • integral component of membrane; • клітинна мембрана; • endosome membrane; • intrinsic component of plasma membrane; • integral component of plasma membrane; • lipopolysaccharide receptor complex; • external side of plasma membrane;
Біологічний процес	• positive regulation of MHC class II biosynthetic process; • positive regulation of JNK cascade; • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway; • cellular response to mechanical stimulus; • positive regulation of interleukin-8 production; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • T-helper 1 type immune response; • positive regulation of platelet activation; • positive regulation of interleukin-1 production; • positive regulation of stress-activated MAPK cascade; • positive regulation of NLRP3 inflammasome complex assembly; • positive regulation of interleukin-12 production; • positive regulation of interferon-alpha production; • I-kappaB phosphorylation; • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process; • positive regulation of B cell proliferation; • defense response to bacterium; • positive regulation of interleukin-6 production; • activation of innate immune response; • positive regulation of tumor necrosis factor production; • negative regulation of tumor necrosis factor production; • вроджений імунітет; • negative regulation of interleukin-17 production; • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • positive regulation of interferon-beta production; • positive regulation of inflammatory response; • toll-like receptor 4 signaling pathway; • positive regulation of macrophage cytokine production; • positive regulation of interleukin-10 production; • процес імунної системи; • astrocyte development; • intestinal epithelial structure maintenance; • positive regulation of nucleotide-binding oligomerization domain containing 1 signaling pathway; • response to lipopolysaccharide; • cellular response to lipoteichoic acid; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • negative regulation of interleukin-23 production; • regulation of inflammatory response; • positive regulation of chemokine production; • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; • detection of fungus; • positive regulation of nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway; • negative regulation of interferon-gamma production; • response to bacterium; • negative regulation of osteoclast differentiation; • B cell proliferation involved in immune response; • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process; • negative regulation of interleukin-6 production; • positive regulation of interferon-gamma production; • nitric oxide production involved in inflammatory response; • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway; • regulation of dendritic cell cytokine production; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • macrophage activation; • detection of lipopolysaccharide; • cellular response to lipopolysaccharide; • positive regulation of lymphocyte proliferation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • inflammatory response; • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium; • toll-like receptor signaling pathway; • GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз; • apoptotic signaling pathway; • negative regulation of MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7099
	21898
	ENSG00000136869
	ENSMUSG00000039005
	O00206
	Q9QUK6
	NM_138557; NM_003266; NM_138554; NM_138556
	NM_021297
	NP_003257; NP_612564; NP_612567
	NP_067272
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TLR4 (англ. Toll like receptor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 839 амінокислот, а молекулярна маса — 95 680^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMSASRLAGT	LIPAMAFLSC	VRPESWEPCV	EVVPNITYQC	MELNFYKIPD
NLPFSTKNLD	LSFNPLRHLG	SYSFFSFPEL	QVLDLSRCEI	QTIEDGAYQS
LSHLSTLILT	GNPIQSLALG	AFSGLSSLQK	LVAVETNLAS	LENFPIGHLK
TLKELNVAHN	LIQSFKLPEY	FSNLTNLEHL	DLSSNKIQSI	YCTDLRVLHQ
MPLLNLSLDL	SLNPMNFIQP	GAFKEIRLHK	LTLRNNFDSL	NVMKTCIQGL
AGLEVHRLVL	GEFRNEGNLE	KFDKSALEGL	CNLTIEEFRL	AYLDYYLDDI
IDLFNCLTNV	SSFSLVSVTI	ERVKDFSYNF	GWQHLELVNC	KFGQFPTLKL
KSLKRLTFTS	NKGGNAFSEV	DLPSLEFLDL	SRNGLSFKGC	CSQSDFGTTS
LKYLDLSFNG	VITMSSNFLG	LEQLEHLDFQ	HSNLKQMSEF	SVFLSLRNLI
YLDISHTHTR	VAFNGIFNGL	SSLEVLKMAG	NSFQENFLPD	IFTELRNLTF
LDLSQCQLEQ	LSPTAFNSLS	SLQVLNMSHN	NFFSLDTFPY	KCLNSLQVLD
YSLNHIMTSK	KQELQHFPSS	LAFLNLTQND	FACTCEHQSF	LQWIKDQRQL
LVEVERMECA	TPSDKQGMPV	LSLNITCQMN	KTIIGVSVLS	VLVVSVVAVL
VYKFYFHLML	LAGCIKYGRG	ENIYDAFVIY	SSQDEDWVRN	ELVKNLEEGV
PPFQLCLHYR	DFIPGVAIAA	NIIHEGFHKS	RKVIVVVSQH	FIQSRWCIFE
YEIAQTWQFL	SSRAGIIFIV	LQKVEKTLLR	QQVELYRLLS	RNTYLEWEDS
VLGRHIFWRR	LRKALLDGKS	WNPEGTVGTG	CNWQEATSI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

TLR4 здатний активувати NF-κB.

Література

Medzhitov R., Preston-Hurlburt P., Janeway C.A. Jr. (1997). A human homologue of the Drosophila Toll protein signals activation of adaptive immunity. Nature. 388: 394—397. PMID 9237759 DOI:10.1038/41131
Rock F.L., Hardiman G., Timans J.C., Kastelein R.A., Bazan J.F. (1998). A family of human receptors structurally related to Drosophila Toll. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 588—593. PMID 9435236 DOI:10.1073/pnas.95.2.588
Smirnova I., Poltorak A., Chan E.K.L., McBride C., Beutler B. (2000). Phylogenetic variation and polymorphism at the Toll-like receptor 4 locus (TLR4). Genome Biol. 1: RESEARCH002.1—RESEARCH002.10. PMID 11104518 DOI:10.1186/gb-2000-1-1-research002
Georgel P., Macquin C., Bahram S. (2009). The heterogeneous allelic repertoire of human Toll-Like receptor (TLR) genes. PLoS ONE. 4: E7803—E7803. PMID 19924287 DOI:10.1371/journal.pone.0007803
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504