TIRAP

TIRAP (англ. TIR domain containing adaptor protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 221 амінокислот, а молекулярна маса — 23 883.

TIRAP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2Y92, 3UB2, 3UB3, 3UB4, 4FZ5, 4LQD
Ідентифікатори
Символи	TIRAP, BACTS1, Mal, MyD88-2, wyatt, toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain containing adaptor protein, TIR domain containing adaptor protein
Зовнішні ІД	OMIM: 606252 MGI: 2152213 HomoloGene: 14285 GeneCards: TIRAP
Онтологія гена Молекулярна функція • protein-macromolecule adaptor activity • protein homodimerization activity • Toll-like receptor 2 binding • Toll-like receptor 4 binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • protein kinase C binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • клітинна мембрана • endocytic vesicle • ruffle membrane Біологічний процес • myeloid cell differentiation • regulation of innate immune response • cellular response to bacterial lipopeptide • positive regulation of toll-like receptor 3 signaling pathway • positive regulation of interleukin-12 production • positive regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 1 production • positive regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 2 production • процес імунної системи • positive regulation of JNK cascade • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • positive regulation of interleukin-15 production • positive regulation of protein homodimerization activity • cell surface receptor signaling pathway • response to lipopolysaccharide • TIRAP-dependent toll-like receptor 4 signaling pathway • cellular response to lipoteichoic acid • positive regulation of B cell proliferation • regulation of interferon-beta production • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of interleukin-8 production • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of neutrophil chemotaxis • positive regulation of tumor necrosis factor production • positive regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of toll-like receptor 2 signaling pathway • 3'-UTR-mediated mRNA stabilization • inflammatory response • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • вроджений імунітет • activation of NF-kappaB-inducing kinase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	114609	117149
Ensembl	ENSG00000150455	ENSMUSG00000032041
UniProt	P58753	Q99JY1
RefSeq (мРНК)	NM_001039661 NM_052887 NM_148910 NM_001318776 NM_001318777	NM_001177845 NM_001177846 NM_001177847 NM_054096
RefSeq (білок)	NP_001034750 NP_001305705 NP_001305706 NP_683708	NP_001171316 NP_001171317 NP_001171318 NP_473437
Локус (UCSC)	Хр. 11: 126.28 – 126.3 Mb	Хр. 9: 35.1 – 35.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASSTSLPAP		GSRPKKPLGK		MADWFRQTLL		KKPKKRPNSP		ESTSSDASQP
TSQDSPLPPS		LSSVTSPSLP		PTHASDSGSS		RWSKDYDVCV		CHSEEDLVAA
QDLVSYLEGS		TASLRCFLQL		RDATPGGAIV		SELCQALSSS		HCRVLLITPG
FLQDPWCKYQ		MLQALTEAPG		AEGCTIPLLS		GLSRAAYPPE		LRFMYYVDGR
GPDGGFRQVK		EAVMRYLQTL		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

• Horng T., Barton G.M., Medzhitov R. (2001). TIRAP: an adapter molecule in the Toll signaling pathway. Nat. Immunol. 2: 835—841. PMID 11526399 DOI:10.1038/ni0901-835
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Semaan N., Alsaleh G., Gottenberg J.E., Wachsmann D., Sibilia J. (2008). Etk/BMX, a Btk family tyrosine kinase, and Mal contribute to the cross-talk between MyD88 and FAK pathways. J. Immunol. 180: 3485—3491. PMID 18292575 DOI:10.4049/jimmunol.180.5.3485
• Wan T., Liu T., Zhang H., Tang S., Min W. (2010). AIP1 functions as Arf6-GAP to negatively regulate TLR4 signaling. J. Biol. Chem. 285: 3750—3757. PMID 19948740 DOI:10.1074/jbc.M109.069385

Див. також

• Хромосома 11