THSD1

THSD1 (англ. Thrombospondin type 1 domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 852 амінокислот, а молекулярна маса — 94 584.

THSD1
Ідентифікатори
Символи	THSD1, TMTSP, UNQ3010, thrombospondin type 1 domain containing 1, ANIB12
Зовнішні ІД	OMIM: 616821 MGI: 1929096 HomoloGene: 10264 GeneCards: THSD1
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55901	56229
Ensembl	ENSG00000136114	ENSMUSG00000031480
UniProt	Q9NS62	Q9JM61
RefSeq (мРНК)	NM_199263 NM_018676	NM_001205253 NM_001293688 NM_019576
RefSeq (білок)	NP_061146 NP_954872	NP_001192182 NP_001280617 NP_062522
Локус (UCSC)	Хр. 13: 52.38 – 52.42 Mb	Хр. 8: 22.72 – 22.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKPMLKDFSN		LLLVVLCDYV		LGEAEYLLLR		EPGHVALSND		TVYVDFQYFD
GANGTLRNVS		VLLLEANTNQ		TVTTKYLLTN		QSQGTLKFEC		FYFKEAGDYW
FTMTPEATDN		STPFPWWEKS		AFLKVEWPVF		HVDLNRSAKA		AEGTFQVGLF
TSQPLCPFPV		DKPNIVVDVI		FTNSLPEARR		NSRQPLEIRT		SKRTELAQGQ
WVEFGCAPLG		PEAYVTVVLK		LLGRDSVITS		TGPIDLAQKF		GYKLVMVPEL
TCESGVEVTV		LPPPCTFVQG		VVTVFKEAPR		YPGKRTIHLA		ENSLPLGERR
TIFNCTLFDM		GKNKYCFDFG		ISSRSHFSAK		EECMLIQRNT		ETWGLWQPWS
QCSATCGDGV		RERRRVCLTS		FPSSPVCPGM		SLEASLCSLE		ECAAFQPSSP
SPLQPQGPVK		SNNIVTVTGI		SLCLFIIIAT		VLITLWRRFG		RPAKCSTPAR
HNSIHSPSFR		KNSDEENICE		LSEQRGSFSD		GGDGPTGSPG		DTGIPLTYRR
SGPVPPEDDA		SGSESFQSNA		QKIIPPLFSY		RLAQQQLKEM		KKKGLTETTK
VYHVSQSPLT		DTAIDAAPSA		PLDLESPEEA		AANKFRIKSP		FPEQPAVSAG
ERPPSRLDLN		VTQASCAISP		SQTLIRKSQA		RHVGSRGGPS		ERSHARNAHF
RRTASFHEAR		QARPFRERSM		STLTPRQAPA		YSSRTRTCEQ		AEDRFRPQSR
GAHLFPEKLE		HFQEASGTRG		PLNPLPKSYT		LGQPLRKPDL		GDHQAGLVAG
IERTEPHRAR		RGPSPSHKSV		SRKQSSPISP		KDNYQRVSSL		SPSQCRKDKC
QSFPTHPEFA		FYDNTSFGLT		EAEQRMLDLP		GYFGSNEEDE		TTSTLSVEKL
VI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 13